More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2442 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0912  transposase, IS4  98.72 
 
 
313 aa  646    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.216188  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1639  transposase, IS4  100 
 
 
313 aa  652    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1446  transposase, IS4  100 
 
 
313 aa  652    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1991  transposase, IS4  98.72 
 
 
313 aa  646    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2137  transposase, IS4  100 
 
 
313 aa  652    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2019  transposase, IS4  100 
 
 
313 aa  652    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1923  transposase, IS4  100 
 
 
313 aa  652    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1279  transposase, IS4  100 
 
 
313 aa  652    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2442  transposase, IS4  100 
 
 
313 aa  652    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2173  transposase, IS4  100 
 
 
313 aa  652    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.460433  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2160  transposase, IS4  100 
 
 
313 aa  652    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0918  transposase, IS4  98.72 
 
 
313 aa  646    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0785  transposase, IS4  100 
 
 
313 aa  652    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0756  transposase, IS4  98.72 
 
 
313 aa  646    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.443512  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0131  transposase, IS4  100 
 
 
313 aa  652    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0398  transposase, IS4  98.72 
 
 
313 aa  646    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.3293  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0566  transposase, IS4  100 
 
 
313 aa  652    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0132  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0567  transposase, IS4  100 
 
 
313 aa  652    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.330478  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0584  transposase, IS4  100 
 
 
313 aa  652    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.810717  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1196  IS5 family transposase  32.93 
 
 
334 aa  185  7e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.107807  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0337  transposase IS4 family protein  36.62 
 
 
345 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0260  transposase IS4 family protein  36.62 
 
 
345 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0147  IS5 family transposase  33.12 
 
 
316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0222  transposase IS4 family protein  30.93 
 
 
348 aa  161  1e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16640  Transposase, IS4  35.03 
 
 
335 aa  159  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24660  Transposase, IS4  35.03 
 
 
335 aa  159  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26840  Transposase, IS4  35.03 
 
 
335 aa  159  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36450  Transposase, IS4  35.03 
 
 
335 aa  159  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49770  IS4 family transposase  35.03 
 
 
335 aa  159  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0479  transposase IS4 family protein  34.85 
 
 
345 aa  156  3e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1943  transposase IS4 family protein  34.85 
 
 
345 aa  156  3e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0044381  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0712  transposase IS4 family protein  30.33 
 
 
352 aa  157  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0829  transposase IS4 family protein  30.33 
 
 
352 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24710  Transposase, IS4  33.54 
 
 
335 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1665  transposase IS4 family protein  30.7 
 
 
367 aa  154  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.114037  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2450  transposase IS4 family protein  30.24 
 
 
348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.348584  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2324  transposase IS4 family protein  30.24 
 
 
348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.552067  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0318  transposase IS4 family protein  37.32 
 
 
314 aa  147  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.356657  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5319  transposase IS4 family protein  33.66 
 
 
353 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.316405 
 
 
-
 
NC_002950  PG0184  ISPg1, transposase  26.32 
 
 
361 aa  144  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0825  ISPg1, transposase  26.32 
 
 
361 aa  144  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1031  ISPg1, transposase  26.32 
 
 
361 aa  144  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000307461 
 
 
-
 
NC_002950  PG1177  ISPg1, transposase  26.32 
 
 
361 aa  144  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1197  ISPg1, transposase  26.32 
 
 
361 aa  144  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_002950  PG1448  ISPg1, transposase  26.32 
 
 
361 aa  144  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1624  ISPg1, transposase  26.32 
 
 
361 aa  144  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1906  ISPg1, transposase  26.32 
 
 
361 aa  144  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3091  transposase IS4 family protein  31.1 
 
 
338 aa  142  8e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2638  transposase IS4 family protein  31.1 
 
 
338 aa  142  8e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0500483  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4989  transposase IS4 family protein  32.79 
 
 
320 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2457  transposase IS4 family protein  31.1 
 
 
338 aa  142  8e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000063174  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2971  IS1246 transposase  34.93 
 
 
280 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4411  transposase, IS4  32.58 
 
 
320 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.434109  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0826  transposase, IS4  32.58 
 
 
320 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.33945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0216  transposase, IS4  32.58 
 
 
320 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0213  transposase, IS4  32.58 
 
 
320 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0925745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0078  transposase, IS4  32.58 
 
 
320 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.512756  normal  0.0332159 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1226  transposase, IS4  32.58 
 
 
320 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0460  ISPg1, transposase  26.32 
 
 
361 aa  137  2e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.835664 
 
 
-
 
NC_002950  PG0549  ISPg1, transposase  26.32 
 
 
361 aa  137  2e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1244  ISPg1, transposase  26.32 
 
 
361 aa  137  2e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0955  transposase IS4 family protein  29.75 
 
 
360 aa  127  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3123  transposase IS4 family protein  29.75 
 
 
360 aa  127  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4812  transposase IS4 family protein  28.82 
 
 
363 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1361  transposase IS4 family protein  34.53 
 
 
240 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.873798  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1747  transposase IS4 family protein  28.12 
 
 
359 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.25501  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4268  transposase, IS4  30.28 
 
 
330 aa  113  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.45537  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3344  transposase IS4 family protein  28.1 
 
 
336 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4149  transposase, IS4  31.09 
 
 
358 aa  112  9e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0604  transposase, IS4 family protein  31.74 
 
 
314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3712  transposase, IS4 family protein  31.74 
 
 
314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.216949  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4041  transposase, IS4  31.09 
 
 
445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.923218  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3832  transposase, IS4 family protein  31.74 
 
 
314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4261  transposase, IS4  30.71 
 
 
349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0257321  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4027  transposase, IS4 family protein  31.4 
 
 
326 aa  109  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0970154  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5109  IS4 family transposase  27.03 
 
 
358 aa  109  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0975401  normal  0.0840327 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2718  transposase, IS4 family protein  29.7 
 
 
330 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00012414  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3354  transposase IS4 family protein  32.12 
 
 
326 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32190  Transposase, IS4 protein  31.79 
 
 
326 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0096  transposase IS4  32.45 
 
 
327 aa  106  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5567  transposase IS4 family protein  29.39 
 
 
330 aa  106  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.60838 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6186  transposase IS4 family protein  29.39 
 
 
330 aa  106  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.62598 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3555  transposase IS4 family protein  29.39 
 
 
330 aa  106  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2612  transposase IS4 family protein  29.39 
 
 
330 aa  106  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5619  transposase IS4 family protein  29.39 
 
 
330 aa  106  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.659177  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5692  transposase IS4 family protein  29.39 
 
 
330 aa  106  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4057  transposase IS4 family protein  29.39 
 
 
330 aa  106  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4760  transposase IS4 family protein  29.39 
 
 
330 aa  106  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3478  transposase IS4 family protein  29.39 
 
 
330 aa  106  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.594385 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5581  transposase IS4 family protein  29.39 
 
 
330 aa  106  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3208  ISPssy, transposase  30.72 
 
 
338 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0135274  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2328  ISPssy, transposase  30.72 
 
 
325 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00380976  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2426  ISPssy, transposase  30.72 
 
 
325 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0162473  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2432  ISPssy, transposase  30.72 
 
 
325 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000860937  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2541  ISPssy, transposase  30.72 
 
 
325 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.182594  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2836  ISPssy, transposase  30.72 
 
 
325 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.967109  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2887  ISPssy, transposase  30.72 
 
 
325 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00537517  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3194  ISPssy, transposase  30.72 
 
 
325 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0837027  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3731  ISPssy, transposase  30.72 
 
 
325 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0359746  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3963  ISPssy, transposase  30.72 
 
 
325 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.038297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>