More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2450 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2450  transposase IS4 family protein  100 
 
 
348 aa  726    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.348584  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2324  transposase IS4 family protein  100 
 
 
348 aa  726    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.552067  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0712  transposase IS4 family protein  81.84 
 
 
352 aa  613  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0829  transposase IS4 family protein  80.69 
 
 
352 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0222  transposase IS4 family protein  78.74 
 
 
348 aa  593  1e-168  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1665  transposase IS4 family protein  76.51 
 
 
367 aa  542  1e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.114037  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1361  transposase IS4 family protein  99.58 
 
 
240 aa  488  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.873798  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3091  transposase IS4 family protein  49.1 
 
 
338 aa  326  3e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2638  transposase IS4 family protein  49.1 
 
 
338 aa  326  3e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0500483  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2457  transposase IS4 family protein  49.1 
 
 
338 aa  326  3e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000063174  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4812  transposase IS4 family protein  42.41 
 
 
363 aa  293  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5319  transposase IS4 family protein  43.15 
 
 
353 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.316405 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1196  IS5 family transposase  46.53 
 
 
334 aa  283  5.000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.107807  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1747  transposase IS4 family protein  40.62 
 
 
359 aa  259  6e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.25501  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0147  IS5 family transposase  42.72 
 
 
316 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49770  IS4 family transposase  40.12 
 
 
335 aa  243  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24660  Transposase, IS4  40.12 
 
 
335 aa  243  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26840  Transposase, IS4  40.12 
 
 
335 aa  243  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16640  Transposase, IS4  40.12 
 
 
335 aa  243  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36450  Transposase, IS4  40.12 
 
 
335 aa  243  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24710  Transposase, IS4  39.82 
 
 
335 aa  243  3.9999999999999997e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0337  transposase IS4 family protein  39.12 
 
 
345 aa  241  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0260  transposase IS4 family protein  39.12 
 
 
345 aa  241  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1943  transposase IS4 family protein  37.06 
 
 
345 aa  231  1e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0044381  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0479  transposase IS4 family protein  37.06 
 
 
345 aa  231  1e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2971  IS1246 transposase  41.2 
 
 
280 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5109  IS4 family transposase  36.52 
 
 
358 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0975401  normal  0.0840327 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0318  transposase IS4 family protein  40.69 
 
 
314 aa  211  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.356657  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3123  transposase IS4 family protein  34.38 
 
 
360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0955  transposase IS4 family protein  34.38 
 
 
360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0398  transposase, IS4  30.54 
 
 
313 aa  150  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.3293  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0756  transposase, IS4  30.54 
 
 
313 aa  150  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.443512  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0912  transposase, IS4  30.54 
 
 
313 aa  150  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.216188  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0918  transposase, IS4  30.54 
 
 
313 aa  150  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1991  transposase, IS4  30.54 
 
 
313 aa  150  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0131  transposase, IS4  30.24 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0566  transposase, IS4  30.24 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0132  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0567  transposase, IS4  30.24 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.330478  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0584  transposase, IS4  30.24 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.810717  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0785  transposase, IS4  30.24 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1279  transposase, IS4  30.24 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1446  transposase, IS4  30.24 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1639  transposase, IS4  30.24 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1923  transposase, IS4  30.24 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2019  transposase, IS4  30.24 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2137  transposase, IS4  30.24 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2160  transposase, IS4  30.24 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2173  transposase, IS4  30.24 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.460433  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2442  transposase, IS4  30.24 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0460  ISPg1, transposase  29.02 
 
 
361 aa  145  1e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.835664 
 
 
-
 
NC_002950  PG0549  ISPg1, transposase  29.02 
 
 
361 aa  145  1e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1244  ISPg1, transposase  29.02 
 
 
361 aa  145  1e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0184  ISPg1, transposase  27.9 
 
 
361 aa  144  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0825  ISPg1, transposase  27.9 
 
 
361 aa  144  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1031  ISPg1, transposase  27.9 
 
 
361 aa  144  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000307461 
 
 
-
 
NC_002950  PG1177  ISPg1, transposase  27.9 
 
 
361 aa  144  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1197  ISPg1, transposase  27.9 
 
 
361 aa  144  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_002950  PG1448  ISPg1, transposase  27.9 
 
 
361 aa  144  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1624  ISPg1, transposase  27.9 
 
 
361 aa  144  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1906  ISPg1, transposase  27.9 
 
 
361 aa  144  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2759  transposase (class II)  43.64 
 
 
174 aa  139  8.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.195506  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5532  IS4 family transposase  30.35 
 
 
320 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4989  transposase IS4 family protein  27.62 
 
 
320 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1226  transposase, IS4  27.62 
 
 
320 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4411  transposase, IS4  27.62 
 
 
320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.434109  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0216  transposase, IS4  27.62 
 
 
320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0826  transposase, IS4  27.62 
 
 
320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.33945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0213  transposase, IS4  27.62 
 
 
320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0925745 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2276  transposase, IS4  30.1 
 
 
323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0078  transposase, IS4  27.62 
 
 
320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.512756  normal  0.0332159 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3425  transposase, IS4 family protein  35.4 
 
 
233 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4268  transposase, IS4  27.24 
 
 
330 aa  123  5e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.45537  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4916  transposase IS4 family protein  28.01 
 
 
324 aa  123  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.387666  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4041  transposase, IS4  28.52 
 
 
445 aa  122  7e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.923218  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4149  transposase, IS4  28.52 
 
 
358 aa  122  8e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4261  transposase, IS4  28.89 
 
 
349 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0257321  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0942  transposase, IS4  28.8 
 
 
322 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3344  transposase IS4 family protein  26.42 
 
 
336 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0206  TIS1021 transposase  28.09 
 
 
328 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1179  TIS1021 transposase  28.09 
 
 
328 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2748  transposase, IS4  26.92 
 
 
311 aa  115  7.999999999999999e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.327226  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0655  transposase IS4 family protein  27.78 
 
 
311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.927973  normal  0.11164 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2612  transposase IS4 family protein  27.16 
 
 
330 aa  113  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3555  transposase IS4 family protein  27.16 
 
 
330 aa  113  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3478  transposase IS4 family protein  27.16 
 
 
330 aa  113  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.594385 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6186  transposase IS4 family protein  27.16 
 
 
330 aa  113  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.62598 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5567  transposase IS4 family protein  27.16 
 
 
330 aa  113  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.60838 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4760  transposase IS4 family protein  27.16 
 
 
330 aa  113  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5619  transposase IS4 family protein  27.16 
 
 
330 aa  113  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.659177  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5692  transposase IS4 family protein  27.16 
 
 
330 aa  113  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5581  transposase IS4 family protein  27.16 
 
 
330 aa  113  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4057  transposase IS4 family protein  27.16 
 
 
330 aa  113  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1561  transposase IS4 family protein  25.89 
 
 
321 aa  112  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  0.983286 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0076  transposase IS4 family protein  25.89 
 
 
321 aa  112  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0258707  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1110  transposase IS4 family protein  25.89 
 
 
321 aa  112  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4863  transposase IS4 family protein  27.61 
 
 
330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0853188  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3354  transposase IS4 family protein  26.98 
 
 
326 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3832  transposase, IS4 family protein  28.4 
 
 
314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3712  transposase, IS4 family protein  28.4 
 
 
314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.216949  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0604  transposase, IS4 family protein  28.4 
 
 
314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>