More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5109 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_5109  IS4 family transposase  100 
 
 		 358 aa  724    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0975401  normal  0.0840327 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1747  transposase IS4 family protein  55.31 
 
 		 359 aa  392  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.25501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4812  transposase IS4 family protein  54.17 
 
 		 363 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3425  transposase, IS4 family protein  61.74 
 
 		 233 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2638  transposase IS4 family protein  41.26 
 
 		 338 aa  256  4e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0500483  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2457  transposase IS4 family protein  41.26 
 
 		 338 aa  256  4e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000063174  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3091  transposase IS4 family protein  41.26 
 
 		 338 aa  256  4e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24710  Transposase, IS4  36.92 
 
 		 335 aa  221  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0222  transposase IS4 family protein  37.46 
 
 		 348 aa  222  9.999999999999999e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5319  transposase IS4 family protein  36.31 
 
 		 353 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.316405 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49770  IS4 family transposase  36.92 
 
 		 335 aa  218  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24660  Transposase, IS4  36.92 
 
 		 335 aa  218  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36450  Transposase, IS4  36.92 
 
 		 335 aa  218  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16640  Transposase, IS4  36.92 
 
 		 335 aa  218  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0712  transposase IS4 family protein  38.26 
 
 		 352 aa  218  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26840  Transposase, IS4  36.92 
 
 		 335 aa  218  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2324  transposase IS4 family protein  36.52 
 
 		 348 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.552067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2450  transposase IS4 family protein  36.52 
 
 		 348 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.348584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0829  transposase IS4 family protein  37.97 
 
 		 352 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0337  transposase IS4 family protein  36.49 
 
 		 345 aa  211  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0260  transposase IS4 family protein  36.49 
 
 		 345 aa  211  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0396  transposase IS116/IS110/IS902  75.59 
 
 		 370 aa  203  5e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.29591 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1665  transposase IS4 family protein  34.71 
 
 		 367 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.114037  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1943  transposase IS4 family protein  33.91 
 
 		 345 aa  200  3e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0044381  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0479  transposase IS4 family protein  33.91 
 
 		 345 aa  200  3e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0147  IS5 family transposase  36.44 
 
 		 316 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0318  transposase IS4 family protein  36.51 
 
 		 314 aa  183  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.356657  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2759  transposase (class II)  57.49 
 
 		 174 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.195506  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1196  IS5 family transposase  36.07 
 
 		 334 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.107807  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2971  IS1246 transposase  35.49 
 
 		 280 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0955  transposase IS4 family protein  33.43 
 
 		 360 aa  161  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3123  transposase IS4 family protein  33.43 
 
 		 360 aa  161  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1361  transposase IS4 family protein  36.11 
 
 		 240 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.873798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4989  transposase IS4 family protein  35.02 
 
 		 320 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0078  transposase, IS4  33.54 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.512756  normal  0.0332159 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0826  transposase, IS4  33.54 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.33945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0216  transposase, IS4  33.54 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4411  transposase, IS4  33.54 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.434109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0213  transposase, IS4  33.54 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0925745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1226  transposase, IS4  33.54 
 
 		 320 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0775  hypothetical protein  56.52 
 
 		 152 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.894102  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2442  transposase, IS4  27.03 
 
 		 313 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2173  transposase, IS4  27.03 
 
 		 313 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.460433  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2160  transposase, IS4  27.03 
 
 		 313 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0131  transposase, IS4  27.03 
 
 		 313 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0566  transposase, IS4  27.03 
 
 		 313 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0132  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0567  transposase, IS4  27.03 
 
 		 313 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.330478  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0584  transposase, IS4  27.03 
 
 		 313 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.810717  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0785  transposase, IS4  27.03 
 
 		 313 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1279  transposase, IS4  27.03 
 
 		 313 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1446  transposase, IS4  27.03 
 
 		 313 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1639  transposase, IS4  27.03 
 
 		 313 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1923  transposase, IS4  27.03 
 
 		 313 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2019  transposase, IS4  27.03 
 
 		 313 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2137  transposase, IS4  27.03 
 
 		 313 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0398  transposase, IS4  26.74 
 
 		 313 aa  106  5e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.3293  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0756  transposase, IS4  26.74 
 
 		 313 aa  106  5e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.443512  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0912  transposase, IS4  26.74 
 
 		 313 aa  106  5e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.216188  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0918  transposase, IS4  26.74 
 
 		 313 aa  106  5e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1991  transposase, IS4  26.74 
 
 		 313 aa  106  5e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0460  ISPg1, transposase  25.59 
 
 		 361 aa  106  6e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.835664 
 
 
-
 
NC_002950  PG0549  ISPg1, transposase  25.59 
 
 		 361 aa  106  6e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1244  ISPg1, transposase  25.59 
 
 		 361 aa  106  6e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3344  transposase IS4 family protein  28.34 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0184  ISPg1, transposase  25.59 
 
 		 361 aa  104  3e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0825  ISPg1, transposase  25.59 
 
 		 361 aa  104  3e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1031  ISPg1, transposase  25.59 
 
 		 361 aa  104  3e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000307461 
 
 
-
 
NC_002950  PG1177  ISPg1, transposase  25.59 
 
 		 361 aa  104  3e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1197  ISPg1, transposase  25.59 
 
 		 361 aa  104  3e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_002950  PG1448  ISPg1, transposase  25.59 
 
 		 361 aa  104  3e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1624  ISPg1, transposase  25.59 
 
 		 361 aa  104  3e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1906  ISPg1, transposase  25.59 
 
 		 361 aa  104  3e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0777  hypothetical protein  70.59 
 
 		 68 aa  98.6  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.817177  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4268  transposase, IS4  27.65 
 
 		 330 aa  98.2  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.45537  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4261  transposase, IS4  27.9 
 
 		 349 aa  94.7  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0257321  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4149  transposase, IS4  27.9 
 
 		 358 aa  94.7  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4041  transposase, IS4  27.9 
 
 		 445 aa  94  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.923218  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2748  transposase, IS4  25.65 
 
 		 311 aa  86.3  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.327226  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0655  transposase IS4 family protein  26.56 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.927973  normal  0.11164 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0809  hypothetical protein  61.02 
 
 		 90 aa  77.8  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1320  ISPg1, transposase, internal deletion  33.33 
 
 		 211 aa  75.9  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3159  hypothetical protein  62.75 
 
 		 90 aa  70.9  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0942  transposase, IS4  25.21 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3712  transposase, IS4 family protein  26.26 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.216949  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0604  transposase, IS4 family protein  26.26 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3832  transposase, IS4 family protein  26.26 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5532  IS4 family transposase  26.15 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2276  transposase, IS4  25.36 
 
 		 323 aa  69.3  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1042  transposase, IS4 family protein  24.38 
 
 		 317 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.077617  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4027  transposase, IS4 family protein  25.7 
 
 		 326 aa  68.9  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0970154  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1714  transposase IS4 family protein  24.38 
 
 		 317 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1156  transposase, IS4 family protein  24.38 
 
 		 317 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2847  transposase IS4 family protein  24.38 
 
 		 317 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4086  hypothetical protein  29.93 
 
 		 207 aa  68.2  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.396271  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4916  transposase IS4 family protein  26.17 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.387666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1557  transposase, IS4 family protein  24.33 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3460  transposase, IS4 family protein  24.33 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2494  transposase, IS4 family protein  24.33 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0455823  decreased coverage  0.00299337 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2718  transposase, IS4 family protein  24.13 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00012414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1053  TIS1021-transposase protein  34.26 
 
 		 349 aa  62.4  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.420746  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>