More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0396 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0396  transposase IS116/IS110/IS902  100 
 
 
370 aa  748    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.29591 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5109  IS4 family transposase  75.59 
 
 
358 aa  203  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0975401  normal  0.0840327 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3381  hypothetical protein  44.03 
 
 
343 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.439907  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3820  hypothetical protein  42.13 
 
 
346 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.930447  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0804  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.13 
 
 
374 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4338  hypothetical protein  42.13 
 
 
348 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.589616  normal  0.0891494 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3111  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.35 
 
 
347 aa  177  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.609339  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0474  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.43 
 
 
350 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0599215 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.99 
 
 
340 aa  169  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.420607  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6141  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.99 
 
 
340 aa  169  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0240  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.99 
 
 
340 aa  169  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.828436  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2265  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.99 
 
 
340 aa  169  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0807  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.74 
 
 
343 aa  168  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3207  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.74 
 
 
367 aa  167  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3506  hypothetical protein  38.06 
 
 
350 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.194292  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.55 
 
 
340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4003  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.55 
 
 
340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.428142 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0880  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.96 
 
 
348 aa  160  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0133961  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7964  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.96 
 
 
348 aa  160  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00546664  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0338  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.79 
 
 
348 aa  159  6e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1355  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.79 
 
 
348 aa  159  6e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00847555 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7202  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.96 
 
 
348 aa  159  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0639  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.96 
 
 
348 aa  159  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.611621  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1095  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.71 
 
 
342 aa  159  8e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0373  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.96 
 
 
360 aa  159  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0910679  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3008  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.68 
 
 
362 aa  157  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4009  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.68 
 
 
362 aa  157  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.143996 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2874  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.68 
 
 
362 aa  157  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0819902 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0587  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.68 
 
 
362 aa  157  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.347833  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0753  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.68 
 
 
362 aa  157  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0703  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.68 
 
 
362 aa  157  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1742  transposase IS110 family protein  38.56 
 
 
362 aa  154  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1068  transposase IS110 family protein  38.56 
 
 
362 aa  154  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5101  transposase  36.24 
 
 
307 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.744435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3767  transposase  36.24 
 
 
307 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.961104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0740  transposase  36.24 
 
 
307 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0332922  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7069  transposase  36.24 
 
 
307 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.944245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6332  transposase  36.24 
 
 
307 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.121397 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2805  transposase IS110 family protein  38.56 
 
 
362 aa  154  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5311  transposase  36.24 
 
 
344 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.414868  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1027  transposase IS110 family protein  38.56 
 
 
362 aa  154  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.111206  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1602  transposase IS110 family protein  38.56 
 
 
362 aa  154  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2419  transposase IS110 family protein  38.56 
 
 
362 aa  154  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.930996  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1747  transposase IS4 family protein  58.27 
 
 
359 aa  153  5e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.25501  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4120  transposase IS116/IS110/IS902  38.56 
 
 
374 aa  152  8.999999999999999e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0676  transposase IS116/IS110/IS902  38.03 
 
 
343 aa  151  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3442  transposase IS116/IS110/IS902  38.03 
 
 
343 aa  150  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.150686  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3759  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.86 
 
 
342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.076485  normal  0.271017 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4035  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.86 
 
 
342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.327975  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4496  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.46 
 
 
345 aa  146  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0504708  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4092  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.96 
 
 
343 aa  145  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.293783 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3994  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.32 
 
 
347 aa  140  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4651  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.47 
 
 
343 aa  138  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4637  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.47 
 
 
343 aa  138  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4556  transposase IS116/IS110/IS902  34.14 
 
 
381 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0733262  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0853  transposase IS116/IS110/IS902  36.91 
 
 
363 aa  134  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0549911 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3996  transposase IS116/IS110/IS902  35.78 
 
 
343 aa  133  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4812  transposase IS4 family protein  48.8 
 
 
363 aa  119  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2759  transposase (class II)  47.97 
 
 
174 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.195506  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2457  transposase IS4 family protein  41.3 
 
 
338 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000063174  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2638  transposase IS4 family protein  41.3 
 
 
338 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0500483  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3091  transposase IS4 family protein  41.3 
 
 
338 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0147  IS5 family transposase  44.35 
 
 
316 aa  102  7e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0567a  transposase  32.86 
 
 
288 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.569839  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2209  transposase for insertion sequence element IS1111A  32.86 
 
 
339 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000691177  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1778  transposase for insertion sequence element IS1111A  32.86 
 
 
339 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.459014  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1963  transposase for insertion sequence element IS1111A  32.86 
 
 
339 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1419  transposase for insertion sequence element IS1111A  32.86 
 
 
339 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1740  transposase for insertion sequence element IS1111A  32.86 
 
 
339 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1676  transposase for insertion sequence element IS1111A  32.86 
 
 
339 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1835  transposase for insertion sequence element IS1111A  32.86 
 
 
339 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1952  transposase for insertion sequence element IS1111A  32.86 
 
 
339 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.707191  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1848  transposase for insertion sequence element IS1111A  32.86 
 
 
339 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1976  transposase for insertion sequence element IS1111A  32.86 
 
 
339 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.629494  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2103  transposase for insertion sequence element IS1111A  32.86 
 
 
339 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1685a  transposase  32.86 
 
 
288 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000151302  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1568  transposase for insertion sequence element IS1111A  32.86 
 
 
339 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0135752  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1652  transposase for insertion sequence element IS1111A  32.86 
 
 
339 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00058709  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0733  transposase for insertion sequence element IS1111A  32.86 
 
 
339 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.231607  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0714  transposase for insertion sequence element IS1111A  32.86 
 
 
339 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0636  transposase for insertion sequence element IS1111A  32.86 
 
 
339 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.596694  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0668  transposase for insertion sequence element IS1111A  32.86 
 
 
339 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119665  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0223a  transposase  32.86 
 
 
288 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1033  transposase for insertion sequence element IS1111A  32.86 
 
 
339 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1591  transposase for insertion sequence element IS1111A  32.86 
 
 
339 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000798859  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1296  transposase for insertion sequence element IS1111A  32.86 
 
 
339 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201015  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1256  transposase for insertion sequence element IS1111A  32.86 
 
 
339 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1715  transposase for insertion sequence element IS1111A  32.86 
 
 
339 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0007  transposase for insertion sequence element IS1111A  32.86 
 
 
339 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0306334  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1338  transposase for insertion sequence element IS1111A  32.86 
 
 
339 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00487008  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1361  transposase for insertion sequence element IS1111A  32.86 
 
 
339 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.58467  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1406  transposase for insertion sequence element IS1111A  32.86 
 
 
339 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000279792  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0854  transposase for insertion sequence element IS1111A  32.86 
 
 
339 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00143492  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0493a  transposase  32.86 
 
 
288 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0124  transposase for insertion sequence element IS1111A  32.86 
 
 
339 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000332846  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2197  transposase for insertion sequence element IS1111A  32.86 
 
 
339 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0155  transposase for insertion sequence element IS1111A  32.86 
 
 
339 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.239351  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0330  transposase for insertion sequence element IS1111A  32.86 
 
 
339 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000188022  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0495  transposase for insertion sequence element IS1111A  32.86 
 
 
339 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375707  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1839  transposase for insertion sequence element IS1111A  32.86 
 
 
339 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>