More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3767 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6332  transposase  100 
 
 		 307 aa  631  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.121397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3767  transposase  100 
 
 		 307 aa  631  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.961104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7069  transposase  100 
 
 		 307 aa  631  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.944245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5101  transposase  100 
 
 		 307 aa  631  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.744435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0740  transposase  100 
 
 		 307 aa  631  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0332922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5311  transposase  99.35 
 
 		 344 aa  627  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.414868  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0676  transposase IS116/IS110/IS902  56.04 
 
 		 343 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3442  transposase IS116/IS110/IS902  56.04 
 
 		 343 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.150686  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3996  transposase IS116/IS110/IS902  53.92 
 
 		 343 aa  332  7.000000000000001e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4496  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.22 
 
 		 345 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0504708  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4637  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.58 
 
 		 343 aa  281  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4651  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.58 
 
 		 343 aa  281  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4092  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.83 
 
 		 343 aa  280  2e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.293783 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3759  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.83 
 
 		 342 aa  280  2e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.076485  normal  0.271017 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4035  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.83 
 
 		 342 aa  280  2e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.327975  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4003  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.64 
 
 		 340 aa  278  6e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.428142 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.64 
 
 		 340 aa  278  6e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0474  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.34 
 
 		 350 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0599215 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0807  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.99 
 
 		 343 aa  277  2e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3207  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.99 
 
 		 367 aa  277  2e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1355  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.62 
 
 		 348 aa  276  3e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847555 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0338  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.62 
 
 		 348 aa  276  3e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3506  hypothetical protein  50 
 
 		 350 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.194292  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3994  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.66 
 
 		 347 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7964  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.94 
 
 		 348 aa  253  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00546664  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0880  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.94 
 
 		 348 aa  253  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0133961  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0373  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.94 
 
 		 360 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0910679  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0639  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.94 
 
 		 348 aa  252  6e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.611621  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7202  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.94 
 
 		 348 aa  252  6e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4120  transposase IS116/IS110/IS902  40.26 
 
 		 374 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3381  hypothetical protein  41.56 
 
 		 343 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.439907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1095  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.51 
 
 		 342 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4009  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.21 
 
 		 362 aa  231  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.143996 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0587  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.21 
 
 		 362 aa  231  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.347833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0703  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.21 
 
 		 362 aa  231  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2874  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.21 
 
 		 362 aa  231  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0819902 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0753  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.21 
 
 		 362 aa  231  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3008  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.21 
 
 		 362 aa  231  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2805  transposase IS110 family protein  42.03 
 
 		 362 aa  228  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1742  transposase IS110 family protein  42.03 
 
 		 362 aa  228  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1027  transposase IS110 family protein  42.03 
 
 		 362 aa  228  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.111206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1602  transposase IS110 family protein  42.03 
 
 		 362 aa  228  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2419  transposase IS110 family protein  42.03 
 
 		 362 aa  228  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.930996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1068  transposase IS110 family protein  42.03 
 
 		 362 aa  228  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4626  transposase IS116/IS110/IS902  48.5 
 
 		 266 aa  223  4e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.878988  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0853  transposase IS116/IS110/IS902  41.58 
 
 		 363 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0549911 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0804  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.64 
 
 		 374 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4338  hypothetical protein  38.64 
 
 		 348 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.589616  normal  0.0891494 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3820  hypothetical protein  38.64 
 
 		 346 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.930447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0240  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.98 
 
 		 340 aa  205  9e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.828436  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2265  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.98 
 
 		 340 aa  205  9e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6141  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.98 
 
 		 340 aa  205  9e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.98 
 
 		 340 aa  205  9e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.420607  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3111  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.87 
 
 		 347 aa  202  7e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.609339  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4556  transposase IS116/IS110/IS902  37.16 
 
 		 381 aa  191  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0733262  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3963  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.36 
 
 		 226 aa  149  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.408958  normal  0.426773 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0396  transposase IS116/IS110/IS902  36.24 
 
 		 370 aa  143  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.29591 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1575  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.19 
 
 		 354 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0511159  normal  0.740121 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0056  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.19 
 
 		 354 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1561  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.19 
 
 		 354 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.627114 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0064  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.19 
 
 		 354 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2661  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.91 
 
 		 344 aa  119  6e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0894966  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3900  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  35.26 
 
 		 226 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.528596  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3945  IS110 family transposase  30.79 
 
 		 344 aa  114  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4548  IS110 family transposase  30.79 
 
 		 344 aa  114  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7630  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.77 
 
 		 311 aa  105  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01475  hypothetical protein  26.46 
 
 		 338 aa  100  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02812  hypothetical protein  26.46 
 
 		 338 aa  100  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05053  hypothetical protein  26.46 
 
 		 338 aa  100  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0399  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.62 
 
 		 347 aa  99.8  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2644  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.62 
 
 		 347 aa  99.8  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0103758  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3770  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.62 
 
 		 347 aa  99.8  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0590738  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2806  transposase IS116/IS110/IS902  28.42 
 
 		 337 aa  99.4  8e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3360  transposase IS116/IS110/IS902  28.42 
 
 		 337 aa  99.4  8e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3816  transposase IS116/IS110/IS902  26.44 
 
 		 340 aa  99  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.531906  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13560  Transposase IS116/IS110/IS902  29.22 
 
 		 338 aa  99  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.682801  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45790  Transposase IS116/IS110/IS902  29.22 
 
 		 338 aa  99  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.997681  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35590  Transposase IS116/IS110/IS902  29.22 
 
 		 338 aa  99  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30230  Transposase IS116/IS110/IS902  29.22 
 
 		 338 aa  98.2  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09560  transposase IS116/IS110/IS902  29.22 
 
 		 338 aa  98.2  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.927637  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1976  transposase for insertion sequence element IS1111A  28.72 
 
 		 339 aa  98.2  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.629494  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1952  transposase for insertion sequence element IS1111A  28.72 
 
 		 339 aa  98.2  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.707191  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2103  transposase for insertion sequence element IS1111A  28.72 
 
 		 339 aa  98.2  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1963  transposase for insertion sequence element IS1111A  28.72 
 
 		 339 aa  98.2  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3108  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.42 
 
 		 360 aa  98.2  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.690807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0007  transposase for insertion sequence element IS1111A  28.72 
 
 		 339 aa  98.2  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0306334  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0643  ISAfe1, transposase  29.25 
 
 		 322 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0354b  transposase  28.72 
 
 		 288 aa  98.2  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0636  transposase for insertion sequence element IS1111A  28.72 
 
 		 339 aa  98.2  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.596694  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1740  transposase for insertion sequence element IS1111A  28.72 
 
 		 339 aa  98.2  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0555  transposase for insertion sequence element IS1111A  28.72 
 
 		 339 aa  98.2  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016494  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0223a  transposase  28.72 
 
 		 288 aa  98.2  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08193  transposase  26.12 
 
 		 338 aa  97.4  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1685a  transposase  28.72 
 
 		 288 aa  98.2  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000151302  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1256  transposase for insertion sequence element IS1111A  28.72 
 
 		 339 aa  98.2  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1715  transposase for insertion sequence element IS1111A  28.72 
 
 		 339 aa  98.2  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0847  transposase for insertion sequence element IS1111A  28.72 
 
 		 339 aa  98.2  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000936051  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0420  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.42 
 
 		 360 aa  98.2  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.505661 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0124  transposase for insertion sequence element IS1111A  28.72 
 
 		 339 aa  98.2  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000332846  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1751  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.42 
 
 		 360 aa  98.2  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>