More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4556 on replicon NC_007961
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007961  Nham_4556  transposase IS116/IS110/IS902  100 
 
 
381 aa  790    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0733262  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1095  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.19 
 
 
342 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0804  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.03 
 
 
374 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4338  hypothetical protein  41.03 
 
 
348 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.589616  normal  0.0891494 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3820  hypothetical protein  41.26 
 
 
346 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.930447  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0676  transposase IS116/IS110/IS902  41.45 
 
 
343 aa  251  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3442  transposase IS116/IS110/IS902  41.45 
 
 
343 aa  251  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.150686  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4120  transposase IS116/IS110/IS902  37.75 
 
 
374 aa  241  1e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0807  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.22 
 
 
343 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3207  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38 
 
 
367 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4003  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.13 
 
 
340 aa  239  5e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.428142 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.13 
 
 
340 aa  239  5e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3994  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40 
 
 
347 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0474  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.77 
 
 
350 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0599215 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3506  hypothetical protein  39.48 
 
 
350 aa  233  5e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.194292  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3381  hypothetical protein  37.54 
 
 
343 aa  230  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.439907  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3996  transposase IS116/IS110/IS902  37.97 
 
 
343 aa  229  5e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0880  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.48 
 
 
348 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0133961  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7964  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.48 
 
 
348 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00546664  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7202  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.48 
 
 
348 aa  227  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0373  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.14 
 
 
360 aa  228  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0910679  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0639  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.48 
 
 
348 aa  227  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.611621  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4496  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.68 
 
 
345 aa  227  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0504708  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1355  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.25 
 
 
348 aa  225  8e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00847555 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0338  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.25 
 
 
348 aa  225  8e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1742  transposase IS110 family protein  37.99 
 
 
362 aa  224  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1027  transposase IS110 family protein  37.99 
 
 
362 aa  224  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.111206  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1068  transposase IS110 family protein  37.99 
 
 
362 aa  224  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2419  transposase IS110 family protein  37.99 
 
 
362 aa  224  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.930996  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1602  transposase IS110 family protein  37.99 
 
 
362 aa  224  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2805  transposase IS110 family protein  37.99 
 
 
362 aa  224  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3759  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.15 
 
 
342 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.076485  normal  0.271017 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4035  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.15 
 
 
342 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.327975  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.08 
 
 
340 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.420607  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0853  transposase IS116/IS110/IS902  38.37 
 
 
363 aa  217  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0549911 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5311  transposase  36.02 
 
 
344 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.414868  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6141  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.08 
 
 
340 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0240  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.08 
 
 
340 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.828436  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2265  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.08 
 
 
340 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2874  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.94 
 
 
362 aa  216  5e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0819902 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4009  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.94 
 
 
362 aa  216  5e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.143996 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3008  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.94 
 
 
362 aa  216  5e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0587  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.94 
 
 
362 aa  216  5e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.347833  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0703  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.94 
 
 
362 aa  216  5e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0753  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.94 
 
 
362 aa  216  5e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3111  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.92 
 
 
347 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.609339  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4092  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.23 
 
 
343 aa  212  7.999999999999999e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.293783 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4651  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.1 
 
 
343 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4637  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.1 
 
 
343 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7069  transposase  37.16 
 
 
307 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.944245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3767  transposase  37.16 
 
 
307 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.961104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0740  transposase  37.16 
 
 
307 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0332922  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5101  transposase  37.16 
 
 
307 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.744435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6332  transposase  37.16 
 
 
307 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.121397 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3900  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  34.19 
 
 
226 aa  140  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.528596  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1561  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.85 
 
 
354 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.627114 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1575  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.85 
 
 
354 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0511159  normal  0.740121 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0056  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.85 
 
 
354 aa  139  6e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0064  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.85 
 
 
354 aa  139  6e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1419  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.31 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1591  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.31 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000798859  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1406  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.31 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000279792  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1740  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.31 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0155  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.31 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.239351  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2209  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.31 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000691177  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1361  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.31 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.58467  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1595  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.31 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000374661  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0636  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.31 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.596694  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1839  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.31 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0555  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.31 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016494  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1296  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.31 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201015  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0612  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.31 
 
 
354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.531061  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1835  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.31 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0124  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.31 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000332846  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0330  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.31 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000188022  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1826  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.31 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4626  transposase IS116/IS110/IS902  33.45 
 
 
266 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.878988  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0714  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.31 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0733  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.31 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.231607  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1338  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.31 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00487008  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0847  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.31 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000936051  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1033  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.31 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0854  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.31 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00143492  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0495  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.31 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375707  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1231  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.31 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1976  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.31 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.629494  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1652  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.31 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00058709  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1676  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.31 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1568  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.31 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0135752  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1529  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.31 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0251179  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1715  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.31 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1848  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.31 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0668  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.31 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119665  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1256  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.31 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1963  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.31 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1952  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.31 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.707191  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2103  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.31 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2197  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.31 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1389  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.31 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0007  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.31 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0306334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>