More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0804 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3820  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  697    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.930447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0804  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 		 374 aa  753    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4338  hypothetical protein  99.71 
 
 		 348 aa  700    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.589616  normal  0.0891494 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0807  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.31 
 
 		 343 aa  295  1e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3207  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.02 
 
 		 367 aa  292  7e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1095  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.4 
 
 		 342 aa  288  8e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1355  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.4 
 
 		 348 aa  279  6e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847555 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0338  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.4 
 
 		 348 aa  279  6e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3994  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.47 
 
 		 347 aa  264  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3111  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.07 
 
 		 347 aa  264  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.609339  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4556  transposase IS116/IS110/IS902  41.03 
 
 		 381 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0733262  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0880  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.47 
 
 		 348 aa  257  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0133961  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0676  transposase IS116/IS110/IS902  40.59 
 
 		 343 aa  257  3e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7964  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.47 
 
 		 348 aa  257  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00546664  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7202  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.47 
 
 		 348 aa  256  4e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0639  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.47 
 
 		 348 aa  256  4e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.611621  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3442  transposase IS116/IS110/IS902  40.29 
 
 		 343 aa  256  6e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.150686  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3381  hypothetical protein  41.83 
 
 		 343 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.439907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0373  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.18 
 
 		 360 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0910679  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0474  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.12 
 
 		 350 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0599215 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3996  transposase IS116/IS110/IS902  39.6 
 
 		 343 aa  251  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4120  transposase IS116/IS110/IS902  38.82 
 
 		 374 aa  250  3e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4003  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.42 
 
 		 340 aa  250  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.428142 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.42 
 
 		 340 aa  250  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3506  hypothetical protein  40.83 
 
 		 350 aa  249  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.194292  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.64 
 
 		 340 aa  249  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.420607  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2265  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.64 
 
 		 340 aa  249  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0240  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.64 
 
 		 340 aa  249  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.828436  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6141  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.64 
 
 		 340 aa  249  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4009  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.53 
 
 		 362 aa  248  9e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.143996 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0587  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.53 
 
 		 362 aa  248  9e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.347833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0703  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.53 
 
 		 362 aa  248  9e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0753  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.53 
 
 		 362 aa  248  9e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2874  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.53 
 
 		 362 aa  248  9e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0819902 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3008  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.53 
 
 		 362 aa  248  9e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4496  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.12 
 
 		 345 aa  244  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0504708  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5311  transposase  38.04 
 
 		 344 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.414868  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0853  transposase IS116/IS110/IS902  40.18 
 
 		 363 aa  240  4e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0549911 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4035  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.53 
 
 		 342 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.327975  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3759  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.53 
 
 		 342 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.076485  normal  0.271017 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1027  transposase IS110 family protein  38.35 
 
 		 362 aa  235  8e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.111206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1742  transposase IS110 family protein  38.35 
 
 		 362 aa  235  8e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1602  transposase IS110 family protein  38.35 
 
 		 362 aa  235  8e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1068  transposase IS110 family protein  38.35 
 
 		 362 aa  235  8e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2805  transposase IS110 family protein  38.35 
 
 		 362 aa  235  8e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2419  transposase IS110 family protein  38.35 
 
 		 362 aa  235  8e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.930996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4092  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.64 
 
 		 343 aa  231  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.293783 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4637  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.87 
 
 		 343 aa  219  6e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4651  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.87 
 
 		 343 aa  219  6e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3767  transposase  38.64 
 
 		 307 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.961104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5101  transposase  38.64 
 
 		 307 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.744435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0740  transposase  38.64 
 
 		 307 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0332922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6332  transposase  38.64 
 
 		 307 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.121397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7069  transposase  38.64 
 
 		 307 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.944245 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3900  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  38.53 
 
 		 226 aa  170  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.528596  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0396  transposase IS116/IS110/IS902  42.13 
 
 		 370 aa  167  4e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.29591 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4626  transposase IS116/IS110/IS902  33.82 
 
 		 266 aa  143  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.878988  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9214  transposase for insertion sequence  40.13 
 
 		 185 aa  140  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1561  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.32 
 
 		 354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.627114 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0064  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.32 
 
 		 354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1575  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.32 
 
 		 354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0511159  normal  0.740121 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0056  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.32 
 
 		 354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3963  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.5 
 
 		 226 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.408958  normal  0.426773 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3484  hypothetical protein  44.53 
 
 		 145 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.157894 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1453  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.85 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2518  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.85 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4167  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.85 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4005  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.85 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3816  transposase IS116/IS110/IS902  28.66 
 
 		 340 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.531906  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0399  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.46 
 
 		 347 aa  103  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2644  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.46 
 
 		 347 aa  103  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0103758  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3770  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.46 
 
 		 347 aa  103  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0590738  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4139  transposase IS116/IS110/IS902  28.4 
 
 		 349 aa  103  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0114  IS110 family transposase  27.13 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  4.57339e-19  hitchhiker  1.5997e-89 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1966  hypothetical protein  43.38 
 
 		 193 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.931135  normal  0.418034 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3936  transposase IS116/IS110/IS902  32.16 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2661  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.69 
 
 		 344 aa  100  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0894966  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2565  transposase IS116/IS110/IS902  25.22 
 
 		 358 aa  99  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.101667  normal  0.0135142 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0993  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.27 
 
 		 341 aa  98.6  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0995  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.27 
 
 		 341 aa  98.6  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1529  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.61 
 
 		 339 aa  97.8  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0251179  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0155  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.61 
 
 		 339 aa  97.8  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.239351  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0714  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.61 
 
 		 339 aa  97.8  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1778  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.61 
 
 		 339 aa  97.8  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.459014  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1361  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.61 
 
 		 339 aa  97.8  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.58467  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1033  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.61 
 
 		 339 aa  97.8  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1839  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.61 
 
 		 339 aa  97.8  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1231  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.61 
 
 		 339 aa  97.8  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1389  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.61 
 
 		 339 aa  97.8  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0555  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.61 
 
 		 339 aa  97.8  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016494  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0612  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.61 
 
 		 354 aa  97.8  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.531061  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0668  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.61 
 
 		 339 aa  97.8  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119665  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1715  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.61 
 
 		 339 aa  97.8  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1740  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.61 
 
 		 339 aa  97.8  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0495  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.61 
 
 		 339 aa  97.8  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375707  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0636  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.61 
 
 		 339 aa  97.8  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.596694  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1652  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.61 
 
 		 339 aa  97.8  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00058709  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1676  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.61 
 
 		 339 aa  97.8  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2197  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.61 
 
 		 339 aa  97.8  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1256  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.61 
 
 		 339 aa  97.8  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>