More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3381 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3381  hypothetical protein  100 
 
 
343 aa  691    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.439907  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1095  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.79 
 
 
342 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1355  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.12 
 
 
348 aa  279  6e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00847555 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0338  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.12 
 
 
348 aa  279  6e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3111  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.21 
 
 
347 aa  272  6e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.609339  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0807  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.41 
 
 
343 aa  264  1e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3207  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.51 
 
 
367 aa  263  3e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5311  transposase  40.58 
 
 
344 aa  263  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.414868  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4496  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.14 
 
 
345 aa  261  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0504708  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0804  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.83 
 
 
374 aa  255  9e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3820  hypothetical protein  41.83 
 
 
346 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.930447  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4338  hypothetical protein  41.83 
 
 
348 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.589616  normal  0.0891494 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.94 
 
 
340 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4003  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.94 
 
 
340 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.428142 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0639  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.48 
 
 
348 aa  250  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.611621  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7202  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.48 
 
 
348 aa  250  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0373  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.56 
 
 
360 aa  249  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0910679  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7964  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.48 
 
 
348 aa  249  7e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00546664  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0880  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.48 
 
 
348 aa  249  7e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0133961  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4120  transposase IS116/IS110/IS902  40.41 
 
 
374 aa  246  4e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0676  transposase IS116/IS110/IS902  38.94 
 
 
343 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3442  transposase IS116/IS110/IS902  39.23 
 
 
343 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.150686  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0240  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.35 
 
 
340 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.828436  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2265  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.35 
 
 
340 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.35 
 
 
340 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.420607  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6141  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.35 
 
 
340 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6332  transposase  41.56 
 
 
307 aa  239  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.121397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7069  transposase  41.56 
 
 
307 aa  239  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.944245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0740  transposase  41.56 
 
 
307 aa  239  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0332922  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3767  transposase  41.56 
 
 
307 aa  239  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.961104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5101  transposase  41.56 
 
 
307 aa  239  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.744435 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0587  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.64 
 
 
362 aa  239  5.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.347833  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0703  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.64 
 
 
362 aa  239  5.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0753  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.64 
 
 
362 aa  239  5.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2874  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.64 
 
 
362 aa  239  5.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0819902 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4009  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.64 
 
 
362 aa  239  5.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.143996 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3008  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.64 
 
 
362 aa  239  5.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3994  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.59 
 
 
347 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0474  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.72 
 
 
350 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0599215 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3996  transposase IS116/IS110/IS902  39.23 
 
 
343 aa  236  6e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3506  hypothetical protein  41.42 
 
 
350 aa  235  9e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.194292  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4092  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.24 
 
 
343 aa  231  1e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.293783 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2419  transposase IS110 family protein  40.12 
 
 
362 aa  230  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.930996  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1068  transposase IS110 family protein  40.12 
 
 
362 aa  230  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1027  transposase IS110 family protein  40.12 
 
 
362 aa  230  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.111206  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4556  transposase IS116/IS110/IS902  37.54 
 
 
381 aa  230  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0733262  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2805  transposase IS110 family protein  40.12 
 
 
362 aa  230  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1602  transposase IS110 family protein  40.12 
 
 
362 aa  230  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1742  transposase IS110 family protein  40.12 
 
 
362 aa  230  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0853  transposase IS116/IS110/IS902  39.88 
 
 
363 aa  226  6e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0549911 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4035  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.84 
 
 
342 aa  219  7.999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.327975  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3759  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.84 
 
 
342 aa  219  7.999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.076485  normal  0.271017 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4651  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.39 
 
 
343 aa  218  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4637  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.39 
 
 
343 aa  218  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3900  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  39.13 
 
 
226 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.528596  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0396  transposase IS116/IS110/IS902  44.03 
 
 
370 aa  172  7.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.29591 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4626  transposase IS116/IS110/IS902  33.82 
 
 
266 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.878988  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1575  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.09 
 
 
354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0511159  normal  0.740121 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1561  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.09 
 
 
354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.627114 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0064  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.79 
 
 
354 aa  134  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0056  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.79 
 
 
354 aa  134  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9214  transposase for insertion sequence  39.05 
 
 
185 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4139  transposase IS116/IS110/IS902  30.58 
 
 
349 aa  117  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3484  hypothetical protein  43.66 
 
 
145 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.157894 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3083  transposase IS116/IS110/IS902  32.3 
 
 
343 aa  114  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.28 
 
 
345 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.533752  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0834  transposase IS116/IS110/IS902  32.13 
 
 
343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220678  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2472  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.53 
 
 
344 aa  110  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3963  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.76 
 
 
226 aa  110  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.408958  normal  0.426773 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1966  hypothetical protein  42.54 
 
 
193 aa  109  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.931135  normal  0.418034 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4005  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.49 
 
 
332 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2518  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.49 
 
 
332 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1453  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.49 
 
 
332 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4167  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.49 
 
 
332 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0993  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.68 
 
 
341 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0995  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.68 
 
 
341 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1361  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.71 
 
 
339 aa  108  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.58467  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0155  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.71 
 
 
339 aa  108  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.239351  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0555  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.71 
 
 
339 aa  108  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016494  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1338  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.71 
 
 
339 aa  108  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00487008  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0495  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.71 
 
 
339 aa  108  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375707  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0330  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.71 
 
 
339 aa  108  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000188022  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1952  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.71 
 
 
339 aa  108  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.707191  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1676  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.71 
 
 
339 aa  108  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1296  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.71 
 
 
339 aa  108  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201015  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1685a  transposase  29.67 
 
 
288 aa  107  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000151302  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0223a  transposase  29.67 
 
 
288 aa  107  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0643  ISAfe1, transposase  32.16 
 
 
322 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1529  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.71 
 
 
339 aa  108  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0251179  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2066  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.54 
 
 
343 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.819245  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1406  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.71 
 
 
339 aa  108  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000279792  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1568  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.71 
 
 
339 aa  108  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0135752  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3118  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.82 
 
 
338 aa  107  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0567a  transposase  29.67 
 
 
288 aa  107  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.569839  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1256  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.71 
 
 
339 aa  108  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1591  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.71 
 
 
339 aa  108  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000798859  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1389  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.71 
 
 
339 aa  108  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0733  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.71 
 
 
339 aa  108  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.231607  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0714  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.71 
 
 
339 aa  108  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0124  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.71 
 
 
339 aa  108  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000332846  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>