155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9214 on replicon NC_011984
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011984  Avi_9214  transposase for insertion sequence  100 
 
 
185 aa  384  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3111  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.86 
 
 
347 aa  149  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.609339  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3900  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  41.07 
 
 
226 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.528596  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0804  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.13 
 
 
374 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3820  hypothetical protein  38.38 
 
 
346 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.930447  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4338  hypothetical protein  38.38 
 
 
348 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.589616  normal  0.0891494 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1095  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.12 
 
 
342 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.48 
 
 
340 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4003  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.48 
 
 
340 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.428142 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1355  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.76 
 
 
348 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00847555 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0338  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.76 
 
 
348 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7202  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.1 
 
 
348 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7964  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.1 
 
 
348 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00546664  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0639  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.1 
 
 
348 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.611621  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0880  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.1 
 
 
348 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0133961  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3994  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.69 
 
 
347 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0373  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.46 
 
 
360 aa  125  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0910679  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3381  hypothetical protein  39.05 
 
 
343 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.439907  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4120  transposase IS116/IS110/IS902  39.35 
 
 
374 aa  124  6e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0807  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.46 
 
 
343 aa  124  9e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4496  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.06 
 
 
345 aa  123  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0504708  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3207  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.82 
 
 
367 aa  122  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4092  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.88 
 
 
343 aa  120  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.293783 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.46 
 
 
340 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.420607  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0240  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.46 
 
 
340 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.828436  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2265  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.46 
 
 
340 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6141  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.46 
 
 
340 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4637  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.69 
 
 
343 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4651  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.69 
 
 
343 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3759  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.09 
 
 
342 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.076485  normal  0.271017 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4035  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.09 
 
 
342 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.327975  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2419  transposase IS110 family protein  34.5 
 
 
362 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.930996  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1602  transposase IS110 family protein  34.5 
 
 
362 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1742  transposase IS110 family protein  34.5 
 
 
362 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1027  transposase IS110 family protein  34.5 
 
 
362 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.111206  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1068  transposase IS110 family protein  34.5 
 
 
362 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2805  transposase IS110 family protein  34.5 
 
 
362 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0587  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.09 
 
 
362 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.347833  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0703  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.09 
 
 
362 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0753  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.09 
 
 
362 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2874  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.09 
 
 
362 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0819902 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3008  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.09 
 
 
362 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4009  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.09 
 
 
362 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.143996 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3153  hypothetical protein  48.18 
 
 
115 aa  111  6e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.740304  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0676  transposase IS116/IS110/IS902  33.14 
 
 
343 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3442  transposase IS116/IS110/IS902  33.14 
 
 
343 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.150686  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5311  transposase  30.77 
 
 
344 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.414868  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0474  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.94 
 
 
350 aa  108  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0599215 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3506  hypothetical protein  36.31 
 
 
350 aa  104  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.194292  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1966  hypothetical protein  39.26 
 
 
193 aa  104  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.931135  normal  0.418034 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3186  hypothetical protein  46.67 
 
 
106 aa  102  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.271971  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3484  hypothetical protein  41.61 
 
 
145 aa  101  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.157894 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4556  transposase IS116/IS110/IS902  34.78 
 
 
381 aa  99.4  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0733262  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4626  transposase IS116/IS110/IS902  31.95 
 
 
266 aa  97.4  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.878988  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3996  transposase IS116/IS110/IS902  30.77 
 
 
343 aa  96.7  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0853  transposase IS116/IS110/IS902  34.12 
 
 
363 aa  92.8  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0549911 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3963  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.79 
 
 
226 aa  87  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.408958  normal  0.426773 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0740  transposase  31.86 
 
 
307 aa  80.5  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0332922  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3767  transposase  31.86 
 
 
307 aa  80.5  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.961104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5101  transposase  31.86 
 
 
307 aa  80.5  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.744435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6332  transposase  31.86 
 
 
307 aa  80.5  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.121397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7069  transposase  31.86 
 
 
307 aa  80.5  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.944245 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0396  transposase IS116/IS110/IS902  37.72 
 
 
370 aa  77.4  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.29591 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1971  hypothetical protein  37.17 
 
 
193 aa  72.8  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.582599  normal  0.197965 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0054  transposase and inactivated derivatives  34.11 
 
 
161 aa  55.8  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1952  transposase for insertion sequence element IS1111A  38.75 
 
 
339 aa  55.1  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.707191  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1839  transposase for insertion sequence element IS1111A  38.75 
 
 
339 aa  55.1  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1715  transposase for insertion sequence element IS1111A  38.75 
 
 
339 aa  55.1  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1778  transposase for insertion sequence element IS1111A  38.75 
 
 
339 aa  55.1  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.459014  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1676  transposase for insertion sequence element IS1111A  38.75 
 
 
339 aa  55.1  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1835  transposase for insertion sequence element IS1111A  38.75 
 
 
339 aa  55.1  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1963  transposase for insertion sequence element IS1111A  38.75 
 
 
339 aa  55.1  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1848  transposase for insertion sequence element IS1111A  38.75 
 
 
339 aa  55.1  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1826  transposase for insertion sequence element IS1111A  38.75 
 
 
339 aa  55.1  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2209  transposase for insertion sequence element IS1111A  38.75 
 
 
339 aa  55.1  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000691177  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0007  transposase for insertion sequence element IS1111A  38.75 
 
 
339 aa  55.1  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0306334  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0124  transposase for insertion sequence element IS1111A  38.75 
 
 
339 aa  55.1  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000332846  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0155  transposase for insertion sequence element IS1111A  38.75 
 
 
339 aa  55.1  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.239351  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0330  transposase for insertion sequence element IS1111A  38.75 
 
 
339 aa  55.1  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000188022  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0495  transposase for insertion sequence element IS1111A  38.75 
 
 
339 aa  55.1  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375707  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0555  transposase for insertion sequence element IS1111A  38.75 
 
 
339 aa  55.1  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016494  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0612  transposase for insertion sequence element IS1111A  38.75 
 
 
354 aa  55.1  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.531061  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0636  transposase for insertion sequence element IS1111A  38.75 
 
 
339 aa  55.1  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.596694  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0668  transposase for insertion sequence element IS1111A  38.75 
 
 
339 aa  55.1  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119665  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0714  transposase for insertion sequence element IS1111A  38.75 
 
 
339 aa  55.1  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0733  transposase for insertion sequence element IS1111A  38.75 
 
 
339 aa  55.1  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.231607  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0847  transposase for insertion sequence element IS1111A  38.75 
 
 
339 aa  55.1  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000936051  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0854  transposase for insertion sequence element IS1111A  38.75 
 
 
339 aa  55.1  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00143492  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1033  transposase for insertion sequence element IS1111A  38.75 
 
 
339 aa  55.1  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1231  transposase for insertion sequence element IS1111A  38.75 
 
 
339 aa  55.1  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1256  transposase for insertion sequence element IS1111A  38.75 
 
 
339 aa  55.1  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1296  transposase for insertion sequence element IS1111A  38.75 
 
 
339 aa  55.1  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201015  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1338  transposase for insertion sequence element IS1111A  38.75 
 
 
339 aa  55.1  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00487008  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1361  transposase for insertion sequence element IS1111A  38.75 
 
 
339 aa  55.1  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.58467  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1389  transposase for insertion sequence element IS1111A  38.75 
 
 
339 aa  55.1  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1406  transposase for insertion sequence element IS1111A  38.75 
 
 
339 aa  55.1  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000279792  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1419  transposase for insertion sequence element IS1111A  38.75 
 
 
339 aa  55.1  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1529  transposase for insertion sequence element IS1111A  38.75 
 
 
339 aa  55.1  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0251179  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1568  transposase for insertion sequence element IS1111A  38.75 
 
 
339 aa  55.1  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0135752  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1591  transposase for insertion sequence element IS1111A  38.75 
 
 
339 aa  55.1  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000798859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>