65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3186 on replicon NC_009467
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009467  Acry_3186  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  217  5e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.271971  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3111  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  98.11 
 
 
347 aa  215  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.609339  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3153  hypothetical protein  92.45 
 
 
115 aa  201  4e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.740304  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6141  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.88 
 
 
340 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2265  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.88 
 
 
340 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0240  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.88 
 
 
340 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.828436  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.88 
 
 
340 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.420607  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1095  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.17 
 
 
342 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3900  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  45.28 
 
 
226 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.528596  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3484  hypothetical protein  50 
 
 
145 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.157894 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9214  transposase for insertion sequence  46.67 
 
 
185 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0338  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.47 
 
 
348 aa  101  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1355  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.47 
 
 
348 aa  101  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00847555 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3008  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.17 
 
 
362 aa  98.2  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2874  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.17 
 
 
362 aa  98.2  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0819902 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0753  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.17 
 
 
362 aa  98.2  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4009  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.17 
 
 
362 aa  98.2  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.143996 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0703  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.17 
 
 
362 aa  98.2  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0587  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.17 
 
 
362 aa  98.2  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.347833  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0639  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.28 
 
 
348 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.611621  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7964  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.28 
 
 
348 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00546664  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1966  hypothetical protein  47.12 
 
 
193 aa  95.5  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.931135  normal  0.418034 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0880  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.28 
 
 
348 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0133961  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7202  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.28 
 
 
348 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0807  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.34 
 
 
343 aa  94  6e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0373  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.19 
 
 
360 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0910679  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3207  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.23 
 
 
367 aa  92.4  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3994  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.19 
 
 
347 aa  92  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1971  hypothetical protein  45.19 
 
 
193 aa  91.7  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.582599  normal  0.197965 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3381  hypothetical protein  45.28 
 
 
343 aa  91.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.439907  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4496  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.57 
 
 
345 aa  90.1  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0504708  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4120  transposase IS116/IS110/IS902  42.45 
 
 
374 aa  88.6  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3506  hypothetical protein  44.34 
 
 
350 aa  88.2  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.194292  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0474  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.34 
 
 
350 aa  88.2  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0599215 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1742  transposase IS110 family protein  40.57 
 
 
362 aa  87  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1602  transposase IS110 family protein  40.57 
 
 
362 aa  87  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2805  transposase IS110 family protein  40.57 
 
 
362 aa  87  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2419  transposase IS110 family protein  40.57 
 
 
362 aa  87  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.930996  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1027  transposase IS110 family protein  40.57 
 
 
362 aa  87  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.111206  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1068  transposase IS110 family protein  40.57 
 
 
362 aa  87  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0853  transposase IS116/IS110/IS902  40.78 
 
 
363 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0549911 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0804  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.57 
 
 
374 aa  84  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4338  hypothetical protein  40.57 
 
 
348 aa  84  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.589616  normal  0.0891494 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3820  hypothetical protein  40.57 
 
 
346 aa  84  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.930447  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4556  transposase IS116/IS110/IS902  37.74 
 
 
381 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0733262  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5311  transposase  39.62 
 
 
344 aa  80.9  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.414868  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3996  transposase IS116/IS110/IS902  37.74 
 
 
343 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4003  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.92 
 
 
340 aa  73.9  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.428142 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.92 
 
 
340 aa  73.9  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4626  transposase IS116/IS110/IS902  38.68 
 
 
266 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.878988  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3442  transposase IS116/IS110/IS902  33.96 
 
 
343 aa  70.1  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.150686  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0676  transposase IS116/IS110/IS902  33.96 
 
 
343 aa  70.1  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4092  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.24 
 
 
343 aa  68.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.293783 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4035  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.38 
 
 
342 aa  64.3  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.327975  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3759  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.38 
 
 
342 aa  64.3  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.076485  normal  0.271017 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4651  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.52 
 
 
343 aa  57.4  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4637  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.52 
 
 
343 aa  57.4  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0158  hypothetical protein  45.59 
 
 
73 aa  52  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3963  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.51 
 
 
226 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.408958  normal  0.426773 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7069  transposase  35.38 
 
 
307 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.944245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6332  transposase  35.38 
 
 
307 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.121397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5101  transposase  35.38 
 
 
307 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.744435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3767  transposase  35.38 
 
 
307 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.961104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0740  transposase  35.38 
 
 
307 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0332922  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0396  transposase IS116/IS110/IS902  44.68 
 
 
370 aa  45.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.29591 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>