More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0676 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0676  transposase IS116/IS110/IS902  100 
 
 		 343 aa  688    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3442  transposase IS116/IS110/IS902  99.42 
 
 		 343 aa  686    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.150686  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3996  transposase IS116/IS110/IS902  68.8 
 
 		 343 aa  480  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4092  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  56.56 
 
 		 343 aa  392  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.293783 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4637  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  56.59 
 
 		 343 aa  386  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4651  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  56.59 
 
 		 343 aa  386  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0807  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.23 
 
 		 343 aa  382  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5311  transposase  56.42 
 
 		 344 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.414868  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3207  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.94 
 
 		 367 aa  379  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3759  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.43 
 
 		 342 aa  368  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.076485  normal  0.271017 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4035  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.43 
 
 		 342 aa  368  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.327975  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3994  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.64 
 
 		 347 aa  360  2e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.25 
 
 		 340 aa  359  3e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4003  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.25 
 
 		 340 aa  359  3e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.428142 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1355  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.93 
 
 		 348 aa  349  5e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847555 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0338  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.93 
 
 		 348 aa  349  5e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4496  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.03 
 
 		 345 aa  344  1e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0504708  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7964  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.85 
 
 		 348 aa  340  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00546664  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0880  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.85 
 
 		 348 aa  340  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0133961  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7202  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.85 
 
 		 348 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0639  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.85 
 
 		 348 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.611621  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4120  transposase IS116/IS110/IS902  47.79 
 
 		 374 aa  339  5e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0373  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.56 
 
 		 360 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0910679  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0740  transposase  56.04 
 
 		 307 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0332922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3767  transposase  56.04 
 
 		 307 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.961104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7069  transposase  56.04 
 
 		 307 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.944245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5101  transposase  56.04 
 
 		 307 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.744435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6332  transposase  56.04 
 
 		 307 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.121397 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0474  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.2 
 
 		 350 aa  323  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0599215 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4626  transposase IS116/IS110/IS902  62.31 
 
 		 266 aa  322  5e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.878988  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3506  hypothetical protein  47.9 
 
 		 350 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.194292  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2805  transposase IS110 family protein  45.16 
 
 		 362 aa  311  1e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2419  transposase IS110 family protein  45.16 
 
 		 362 aa  311  1e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.930996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1068  transposase IS110 family protein  45.16 
 
 		 362 aa  311  1e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1027  transposase IS110 family protein  45.16 
 
 		 362 aa  311  1e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.111206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1602  transposase IS110 family protein  45.16 
 
 		 362 aa  311  1e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1742  transposase IS110 family protein  45.16 
 
 		 362 aa  311  1e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3008  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.57 
 
 		 362 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4009  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.57 
 
 		 362 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.143996 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0753  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.57 
 
 		 362 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2874  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.57 
 
 		 362 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0819902 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0703  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.57 
 
 		 362 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0587  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.57 
 
 		 362 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.347833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1095  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.49 
 
 		 342 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0853  transposase IS116/IS110/IS902  44.57 
 
 		 363 aa  282  6.000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0549911 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0804  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.59 
 
 		 374 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3820  hypothetical protein  40.59 
 
 		 346 aa  256  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.930447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4338  hypothetical protein  40.59 
 
 		 348 aa  256  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.589616  normal  0.0891494 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4556  transposase IS116/IS110/IS902  41.45 
 
 		 381 aa  251  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0733262  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0240  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.99 
 
 		 340 aa  250  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.828436  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.99 
 
 		 340 aa  250  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.420607  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2265  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.99 
 
 		 340 aa  250  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6141  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.99 
 
 		 340 aa  250  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3381  hypothetical protein  38.94 
 
 		 343 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.439907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3111  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.92 
 
 		 347 aa  241  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.609339  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3963  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50 
 
 		 226 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.408958  normal  0.426773 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3900  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  35.59 
 
 		 226 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.528596  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0396  transposase IS116/IS110/IS902  38.03 
 
 		 370 aa  139  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.29591 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1561  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.2 
 
 		 354 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.627114 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1575  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.2 
 
 		 354 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0511159  normal  0.740121 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0064  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.2 
 
 		 354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0056  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.2 
 
 		 354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0993  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.03 
 
 		 341 aa  119  7.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0995  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.03 
 
 		 341 aa  119  7.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0612  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.28 
 
 		 354 aa  116  5e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.531061  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0847  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.28 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000936051  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0854  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.28 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00143492  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1256  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.28 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1568  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.28 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0135752  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0733  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.28 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.231607  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1389  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.28 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1231  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.28 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1033  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.28 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1361  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.28 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.58467  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1338  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.28 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00487008  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1839  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.28 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1963  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.28 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1740  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.28 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1848  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.28 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1952  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.28 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.707191  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1778  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.28 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.459014  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1835  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.28 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1826  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.28 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1715  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.28 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2209  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.28 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000691177  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2197  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.28 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1976  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.28 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.629494  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1591  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.28 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000798859  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1595  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.28 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000374661  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0668  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.28 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119665  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0714  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.28 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0636  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.28 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.596694  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0124  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.28 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000332846  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0007  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.28 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0306334  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1676  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.28 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0155  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.28 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.239351  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1529  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.28 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0251179  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0495  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.28 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375707  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1296  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.28 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201015  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1406  transposase for insertion sequence element IS1111A  29.28 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000279792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>