65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1971 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1971  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  396  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.582599  normal  0.197965 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3484  hypothetical protein  80.17 
 
 		 145 aa  197  9e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.157894 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  63.43 
 
 		 340 aa  176  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.420607  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0240  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  63.43 
 
 		 340 aa  176  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.828436  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6141  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  63.43 
 
 		 340 aa  176  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2265  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  63.43 
 
 		 340 aa  176  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3111  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.86 
 
 		 347 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.609339  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3900  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  43.59 
 
 		 226 aa  103  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.528596  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1095  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.97 
 
 		 342 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3153  hypothetical protein  46.96 
 
 		 115 aa  97.8  8e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.740304  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3186  hypothetical protein  45.19 
 
 		 106 aa  91.7  7e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.271971  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3381  hypothetical protein  42.24 
 
 		 343 aa  90.1  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.439907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0373  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.33 
 
 		 360 aa  87  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0910679  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0804  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.17 
 
 		 374 aa  86.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4120  transposase IS116/IS110/IS902  36.02 
 
 		 374 aa  86.7  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4338  hypothetical protein  39.17 
 
 		 348 aa  86.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.589616  normal  0.0891494 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0880  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.36 
 
 		 348 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0133961  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7964  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.36 
 
 		 348 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00546664  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4496  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.82 
 
 		 345 aa  85.5  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0504708  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3820  hypothetical protein  38.79 
 
 		 346 aa  85.1  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.930447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0639  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.71 
 
 		 348 aa  84.7  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.611621  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7202  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.71 
 
 		 348 aa  84.7  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1966  hypothetical protein  39.66 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.931135  normal  0.418034 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3207  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.17 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0807  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.98 
 
 		 343 aa  79  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1355  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.6 
 
 		 348 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847555 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0338  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.6 
 
 		 348 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3994  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.71 
 
 		 347 aa  78.2  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9214  transposase for insertion sequence  37.17 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0158  hypothetical protein  59.26 
 
 		 73 aa  70.9  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4092  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.19 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.293783 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4003  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.88 
 
 		 340 aa  69.7  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.428142 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.88 
 
 		 340 aa  69.7  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0587  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.86 
 
 		 362 aa  64.7  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.347833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4009  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.86 
 
 		 362 aa  64.7  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.143996 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3008  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.86 
 
 		 362 aa  64.7  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0753  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.86 
 
 		 362 aa  64.7  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0703  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.86 
 
 		 362 aa  64.7  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4651  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.87 
 
 		 343 aa  65.1  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4637  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.87 
 
 		 343 aa  65.1  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2874  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.86 
 
 		 362 aa  64.7  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0819902 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0474  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.45 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0599215 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3506  hypothetical protein  34.45 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.194292  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0853  transposase IS116/IS110/IS902  30.7 
 
 		 363 aa  63.2  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0549911 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3759  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.03 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.076485  normal  0.271017 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4035  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.03 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.327975  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5311  transposase  27.63 
 
 		 344 aa  62.4  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.414868  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4626  transposase IS116/IS110/IS902  34.51 
 
 		 266 aa  61.6  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.878988  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3996  transposase IS116/IS110/IS902  33.61 
 
 		 343 aa  61.2  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3442  transposase IS116/IS110/IS902  30.09 
 
 		 343 aa  61.2  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.150686  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0676  transposase IS116/IS110/IS902  30.09 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1742  transposase IS110 family protein  24.83 
 
 		 362 aa  59.3  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2419  transposase IS110 family protein  24.83 
 
 		 362 aa  59.3  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.930996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2805  transposase IS110 family protein  24.83 
 
 		 362 aa  59.3  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1602  transposase IS110 family protein  24.83 
 
 		 362 aa  59.3  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1068  transposase IS110 family protein  24.83 
 
 		 362 aa  59.3  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1027  transposase IS110 family protein  24.83 
 
 		 362 aa  59.3  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.111206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3963  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.1 
 
 		 226 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.408958  normal  0.426773 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4556  transposase IS116/IS110/IS902  28.95 
 
 		 381 aa  50.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0733262  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5101  transposase  27.03 
 
 		 307 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.744435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3767  transposase  27.03 
 
 		 307 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.961104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0740  transposase  27.03 
 
 		 307 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0332922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6332  transposase  27.03 
 
 		 307 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.121397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7069  transposase  27.03 
 
 		 307 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.944245 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0396  transposase IS116/IS110/IS902  39.29 
 
 		 370 aa  43.5  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.29591 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>