More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3083 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3083  transposase IS116/IS110/IS902  100 
 
 		 343 aa  697    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  55.69 
 
 		 346 aa  372  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09560  transposase IS116/IS110/IS902  55.79 
 
 		 338 aa  368  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.927637  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4532  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.33 
 
 		 499 aa  371  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30230  Transposase IS116/IS110/IS902  55.79 
 
 		 338 aa  368  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45790  Transposase IS116/IS110/IS902  55.79 
 
 		 338 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.997681  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44660  Transposase IS116/IS110/IS902  55.65 
 
 		 338 aa  365  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13560  Transposase IS116/IS110/IS902  55.79 
 
 		 338 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.682801  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35590  Transposase IS116/IS110/IS902  55.79 
 
 		 338 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2066  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.25 
 
 		 343 aa  363  2e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.819245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.25 
 
 		 343 aa  363  2e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0643  ISAfe1, transposase  54.83 
 
 		 322 aa  359  5e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.52 
 
 		 347 aa  354  1e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2472  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.74 
 
 		 344 aa  352  5e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0993  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.13 
 
 		 341 aa  340  2e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0995  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.13 
 
 		 341 aa  340  2e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3118  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.48 
 
 		 338 aa  329  4e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1779  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.1 
 
 		 338 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3664  hypothetical protein  48.8 
 
 		 338 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000781858 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0841  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.8 
 
 		 338 aa  327  3e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000767297 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0592  transposase IS116/IS110/IS902  48.82 
 
 		 338 aa  327  3e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0881  transposase IS116/IS110/IS902  48.82 
 
 		 338 aa  327  3e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1332  transposase IS116/IS110/IS902  48.82 
 
 		 338 aa  327  3e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3445  transposase IS116/IS110/IS902  48.82 
 
 		 338 aa  327  3e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3666  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.8 
 
 		 338 aa  327  3e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0314805 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0079  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.8 
 
 		 338 aa  327  3e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3805  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.5 
 
 		 338 aa  325  7e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2286  IS110 family transposase  47.34 
 
 		 341 aa  324  2e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  hitchhiker  0.00653664 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7431  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.6 
 
 		 338 aa  323  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0222  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.2 
 
 		 338 aa  323  2e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0137309  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1114  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.2 
 
 		 338 aa  323  2e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0406  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.2 
 
 		 338 aa  323  2e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3161  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.2 
 
 		 338 aa  323  2e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1170  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.2 
 
 		 338 aa  323  2e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.621929  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3976  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.2 
 
 		 338 aa  323  2e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.015525  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4213  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.2 
 
 		 338 aa  323  2e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3467  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.2 
 
 		 338 aa  323  2e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2242  transposase family protein  47.92 
 
 		 455 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.860997  normal  0.210427 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0904  IS110 family transposase  46.9 
 
 		 341 aa  322  4e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3943  transposase IS116/IS110/IS902  46.45 
 
 		 338 aa  318  1e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.147214  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1640  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.6 
 
 		 338 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000188647  unclonable  0.00000000000190741 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7630  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.85 
 
 		 311 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0943  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.7 
 
 		 338 aa  297  2e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0944  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.7 
 
 		 338 aa  297  2e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4485  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.84 
 
 		 356 aa  297  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.218146  hitchhiker  0.00890094 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4712  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.25 
 
 		 356 aa  293  3e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.401794  normal  0.40759 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.83 
 
 		 345 aa  293  4e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.533752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2845  transposase IS116/IS110/IS902  45.92 
 
 		 355 aa  288  6e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.277268  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2447  transposase IS116/IS110/IS902  45.51 
 
 		 343 aa  288  9e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3074  transposase IS116/IS110/IS902  45.51 
 
 		 343 aa  288  9e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1983  transposase for insertion sequence element IS1111A  46.5 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1361  transposase for insertion sequence element IS1111A  46.5 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.58467  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1419  transposase for insertion sequence element IS1111A  46.5 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1296  transposase for insertion sequence element IS1111A  46.5 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201015  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1591  transposase for insertion sequence element IS1111A  46.5 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000798859  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1338  transposase for insertion sequence element IS1111A  46.5 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00487008  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1256  transposase for insertion sequence element IS1111A  46.5 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1406  transposase for insertion sequence element IS1111A  46.5 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000279792  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1389  transposase for insertion sequence element IS1111A  46.5 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1568  transposase for insertion sequence element IS1111A  46.5 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0135752  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1529  transposase for insertion sequence element IS1111A  46.5 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0251179  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0155  transposase for insertion sequence element IS1111A  46.5 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.239351  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0330  transposase for insertion sequence element IS1111A  46.5 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000188022  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0495  transposase for insertion sequence element IS1111A  46.5 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375707  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0636  transposase for insertion sequence element IS1111A  46.5 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.596694  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0612  transposase for insertion sequence element IS1111A  46.5 
 
 		 354 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.531061  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0555  transposase for insertion sequence element IS1111A  46.5 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016494  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1839  transposase for insertion sequence element IS1111A  46.5 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1231  transposase for insertion sequence element IS1111A  46.5 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0733  transposase for insertion sequence element IS1111A  46.5 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.231607  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0714  transposase for insertion sequence element IS1111A  46.5 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2806  transposase IS116/IS110/IS902  43.71 
 
 		 337 aa  288  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2209  transposase for insertion sequence element IS1111A  46.5 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000691177  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3360  transposase IS116/IS110/IS902  43.71 
 
 		 337 aa  288  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2103  transposase for insertion sequence element IS1111A  46.5 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0854  transposase for insertion sequence element IS1111A  46.5 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00143492  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1595  transposase for insertion sequence element IS1111A  46.5 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000374661  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1033  transposase for insertion sequence element IS1111A  46.5 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0668  transposase for insertion sequence element IS1111A  46.5 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119665  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1848  transposase for insertion sequence element IS1111A  46.5 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1952  transposase for insertion sequence element IS1111A  46.5 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.707191  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1963  transposase for insertion sequence element IS1111A  46.5 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0847  transposase for insertion sequence element IS1111A  46.5 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000936051  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1976  transposase for insertion sequence element IS1111A  46.5 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.629494  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1652  transposase for insertion sequence element IS1111A  46.5 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00058709  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1676  transposase for insertion sequence element IS1111A  46.5 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0007  transposase for insertion sequence element IS1111A  46.5 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0306334  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0124  transposase for insertion sequence element IS1111A  46.5 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000332846  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1715  transposase for insertion sequence element IS1111A  46.5 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1740  transposase for insertion sequence element IS1111A  46.5 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1778  transposase for insertion sequence element IS1111A  46.5 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.459014  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1826  transposase for insertion sequence element IS1111A  46.5 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1835  transposase for insertion sequence element IS1111A  46.5 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2197  transposase for insertion sequence element IS1111A  46.5 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0345  transposase IS116/IS110/IS902  45.21 
 
 		 343 aa  287  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222608  normal  0.211948 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1921  transposase IS116/IS110/IS902  45.21 
 
 		 343 aa  287  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.876079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3076  transposase IS116/IS110/IS902  45.21 
 
 		 343 aa  287  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0802  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.8 
 
 		 338 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.890178 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4711  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.4 
 
 		 338 aa  287  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.266875 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0381  putative transposase  46.53 
 
 		 365 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>