More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3445 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_4213  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  90.83 
 
 
338 aa  646    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0592  transposase IS116/IS110/IS902  100 
 
 
338 aa  705    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0881  transposase IS116/IS110/IS902  100 
 
 
338 aa  705    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1332  transposase IS116/IS110/IS902  100 
 
 
338 aa  705    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3445  transposase IS116/IS110/IS902  100 
 
 
338 aa  705    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0406  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  90.83 
 
 
338 aa  646    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0222  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  90.83 
 
 
338 aa  646    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0137309  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1114  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  90.83 
 
 
338 aa  646    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3976  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  90.83 
 
 
338 aa  646    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.015525  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3467  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  90.83 
 
 
338 aa  646    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3161  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  90.83 
 
 
338 aa  646    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1170  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  90.83 
 
 
338 aa  646    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.621929  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3805  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  81.66 
 
 
338 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1779  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  81.95 
 
 
338 aa  593  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0079  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  81.66 
 
 
338 aa  589  1e-167  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0841  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  81.66 
 
 
338 aa  589  1e-167  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767297 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3666  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  81.66 
 
 
338 aa  589  1e-167  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0314805 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1640  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  80.77 
 
 
338 aa  586  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000188647  unclonable  0.00000000000190741 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3664  hypothetical protein  81.07 
 
 
338 aa  585  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000781858 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0524  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  80.13 
 
 
302 aa  518  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3848  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  79.06 
 
 
234 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.00000966346 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0852  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  79.06 
 
 
234 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4532  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.32 
 
 
499 aa  337  1.9999999999999998e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.1 
 
 
346 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44660  Transposase IS116/IS110/IS902  50.15 
 
 
338 aa  336  3.9999999999999995e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7431  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.41 
 
 
338 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09560  transposase IS116/IS110/IS902  50.45 
 
 
338 aa  335  7e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.927637  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30230  Transposase IS116/IS110/IS902  50.45 
 
 
338 aa  335  7e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1138  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.2 
 
 
340 aa  335  9e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.593308  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35590  Transposase IS116/IS110/IS902  50.45 
 
 
338 aa  333  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13560  Transposase IS116/IS110/IS902  50.45 
 
 
338 aa  333  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.682801  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45790  Transposase IS116/IS110/IS902  50.45 
 
 
338 aa  333  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.997681  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3118  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.48 
 
 
338 aa  333  3e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2472  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.46 
 
 
344 aa  331  1e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2806  transposase IS116/IS110/IS902  47.46 
 
 
337 aa  331  1e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3360  transposase IS116/IS110/IS902  47.46 
 
 
337 aa  331  1e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.1 
 
 
343 aa  331  1e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437625  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2066  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.1 
 
 
343 aa  331  1e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.819245  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2242  transposase family protein  48.52 
 
 
455 aa  328  5.0000000000000004e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.860997  normal  0.210427 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0993  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.16 
 
 
341 aa  328  8e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0995  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.16 
 
 
341 aa  328  8e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0612  transposase for insertion sequence element IS1111A  48.65 
 
 
354 aa  327  1.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.531061  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1568  transposase for insertion sequence element IS1111A  48.65 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0135752  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1591  transposase for insertion sequence element IS1111A  48.65 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000798859  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1976  transposase for insertion sequence element IS1111A  48.65 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.629494  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2103  transposase for insertion sequence element IS1111A  48.65 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1963  transposase for insertion sequence element IS1111A  48.65 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1983  transposase for insertion sequence element IS1111A  48.65 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1839  transposase for insertion sequence element IS1111A  48.65 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2209  transposase for insertion sequence element IS1111A  48.65 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000691177  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2197  transposase for insertion sequence element IS1111A  48.65 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1296  transposase for insertion sequence element IS1111A  48.65 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201015  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1338  transposase for insertion sequence element IS1111A  48.65 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00487008  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1361  transposase for insertion sequence element IS1111A  48.65 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.58467  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1835  transposase for insertion sequence element IS1111A  48.65 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1848  transposase for insertion sequence element IS1111A  48.65 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0636  transposase for insertion sequence element IS1111A  48.65 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.596694  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05053  hypothetical protein  49.1 
 
 
338 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1715  transposase for insertion sequence element IS1111A  48.65 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1740  transposase for insertion sequence element IS1111A  48.65 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0495  transposase for insertion sequence element IS1111A  48.65 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375707  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1406  transposase for insertion sequence element IS1111A  48.65 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000279792  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0555  transposase for insertion sequence element IS1111A  48.65 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016494  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0854  transposase for insertion sequence element IS1111A  48.65 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00143492  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1952  transposase for insertion sequence element IS1111A  48.65 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.707191  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02812  hypothetical protein  49.1 
 
 
338 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01475  hypothetical protein  49.1 
 
 
338 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08193  transposase  49.1 
 
 
338 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1826  transposase for insertion sequence element IS1111A  48.65 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0733  transposase for insertion sequence element IS1111A  48.65 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.231607  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0847  transposase for insertion sequence element IS1111A  48.65 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000936051  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0668  transposase for insertion sequence element IS1111A  48.65 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119665  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1595  transposase for insertion sequence element IS1111A  48.65 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000374661  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1652  transposase for insertion sequence element IS1111A  48.65 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00058709  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1419  transposase for insertion sequence element IS1111A  48.65 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1231  transposase for insertion sequence element IS1111A  48.65 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1033  transposase for insertion sequence element IS1111A  48.65 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1256  transposase for insertion sequence element IS1111A  48.65 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0714  transposase for insertion sequence element IS1111A  48.65 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0124  transposase for insertion sequence element IS1111A  48.65 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000332846  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0330  transposase for insertion sequence element IS1111A  48.65 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000188022  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0155  transposase for insertion sequence element IS1111A  48.65 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.239351  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0007  transposase for insertion sequence element IS1111A  48.65 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0306334  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1676  transposase for insertion sequence element IS1111A  48.65 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1529  transposase for insertion sequence element IS1111A  48.65 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0251179  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1389  transposase for insertion sequence element IS1111A  48.65 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1778  transposase for insertion sequence element IS1111A  48.65 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.459014  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3083  transposase IS116/IS110/IS902  48.82 
 
 
343 aa  327  3e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3943  transposase IS116/IS110/IS902  47.48 
 
 
338 aa  325  6e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.147214  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0944  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.32 
 
 
338 aa  323  3e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0943  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.32 
 
 
338 aa  323  3e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0643  ISAfe1, transposase  49.22 
 
 
322 aa  322  4e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7630  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50 
 
 
311 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2122  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.99 
 
 
337 aa  319  3.9999999999999996e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0571042  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2204  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.99 
 
 
337 aa  319  3.9999999999999996e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.13 
 
 
347 aa  319  3.9999999999999996e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1453  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.9 
 
 
332 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2518  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.9 
 
 
332 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4005  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.9 
 
 
332 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4167  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.9 
 
 
332 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>