More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4485 on replicon NC_008758
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008760  Pnap_4712  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  94.38 
 
 		 356 aa  673    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.401794  normal  0.40759 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4485  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 		 356 aa  734    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.218146  hitchhiker  0.00890094 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2845  transposase IS116/IS110/IS902  73.8 
 
 		 355 aa  549  1e-155  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.277268  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1212  transposase IS116/IS110/IS902  73.45 
 
 		 355 aa  543  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0426  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  69.3 
 
 		 355 aa  501  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.509366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1748  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  69.3 
 
 		 355 aa  501  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1395  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  69.3 
 
 		 355 aa  501  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.688347  normal  0.139029 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0384  putative transposase  66.76 
 
 		 365 aa  496  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0381  putative transposase  66.76 
 
 		 365 aa  496  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0375  putative transposase  66.47 
 
 		 345 aa  479  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4642  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  65.23 
 
 		 318 aa  414  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.882664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0993  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50 
 
 		 341 aa  322  5e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0995  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50 
 
 		 341 aa  322  5e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4532  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.2 
 
 		 499 aa  320  1.9999999999999998e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.4 
 
 		 346 aa  319  6e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2066  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.2 
 
 		 343 aa  318  1e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.819245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.2 
 
 		 343 aa  318  1e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2472  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.45 
 
 		 344 aa  313  3.9999999999999997e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.95 
 
 		 347 aa  311  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0006  ISShdy1, transposase  48.94 
 
 		 338 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0989062  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0114  IS110 family transposase  46.88 
 
 		 340 aa  305  6e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  4.57339e-19  hitchhiker  1.5997e-89 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7431  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.94 
 
 		 338 aa  305  7e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1779  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.03 
 
 		 338 aa  301  1e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09560  transposase IS116/IS110/IS902  46.76 
 
 		 338 aa  300  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.927637  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30230  Transposase IS116/IS110/IS902  46.76 
 
 		 338 aa  300  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3664  hypothetical protein  44.24 
 
 		 338 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000781858 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4956  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.77 
 
 		 341 aa  300  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.440622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0841  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.24 
 
 		 338 aa  299  6e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000767297 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0079  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.24 
 
 		 338 aa  299  6e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3666  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.24 
 
 		 338 aa  299  6e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0314805 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4711  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.66 
 
 		 338 aa  298  7e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.266875 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4213  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.61 
 
 		 338 aa  298  7e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0406  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.61 
 
 		 338 aa  298  7e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1114  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.61 
 
 		 338 aa  298  7e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3976  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.61 
 
 		 338 aa  298  7e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.015525  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1170  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.61 
 
 		 338 aa  298  7e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.621929  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3161  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.61 
 
 		 338 aa  298  7e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3467  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.61 
 
 		 338 aa  298  7e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0222  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.61 
 
 		 338 aa  298  7e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0137309  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13560  Transposase IS116/IS110/IS902  46.47 
 
 		 338 aa  298  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.682801  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35590  Transposase IS116/IS110/IS902  46.47 
 
 		 338 aa  298  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45790  Transposase IS116/IS110/IS902  46.47 
 
 		 338 aa  298  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.997681  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3083  transposase IS116/IS110/IS902  44.84 
 
 		 343 aa  297  2e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44660  Transposase IS116/IS110/IS902  47.16 
 
 		 338 aa  297  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5572  transposase IS116/IS110/IS902  47.77 
 
 		 338 aa  296  4e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3805  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.64 
 
 		 338 aa  296  4e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1640  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.64 
 
 		 338 aa  296  5e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000188647  unclonable  0.00000000000190741 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0592  transposase IS116/IS110/IS902  43.03 
 
 		 338 aa  294  2e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0881  transposase IS116/IS110/IS902  43.03 
 
 		 338 aa  294  2e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1332  transposase IS116/IS110/IS902  43.03 
 
 		 338 aa  294  2e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3445  transposase IS116/IS110/IS902  43.03 
 
 		 338 aa  294  2e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1372  IS111A/IS1328/IS1533  48.07 
 
 		 341 aa  293  3e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0161177 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0488  putative transposase IS116/IS110/IS902  48.66 
 
 		 341 aa  293  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.296532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2041  transposase IS116/IS110/IS902  47.77 
 
 		 341 aa  291  9e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3434  transposase IS116/IS110/IS902  47.48 
 
 		 341 aa  290  3e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1637  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.07 
 
 		 338 aa  287  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.571197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1138  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.07 
 
 		 338 aa  287  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7630  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.19 
 
 		 311 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3943  transposase IS116/IS110/IS902  43.11 
 
 		 338 aa  280  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.147214  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3118  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.28 
 
 		 338 aa  280  3e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2806  transposase IS116/IS110/IS902  42.73 
 
 		 337 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3360  transposase IS116/IS110/IS902  42.73 
 
 		 337 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2286  IS110 family transposase  41.04 
 
 		 341 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  hitchhiker  0.00653664 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0944  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.57 
 
 		 338 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0943  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.57 
 
 		 338 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4167  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.84 
 
 		 332 aa  272  7e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2518  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.84 
 
 		 332 aa  272  7e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4005  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.84 
 
 		 332 aa  272  7e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1453  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.84 
 
 		 332 aa  272  7e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02906  probable transposase  44.22 
 
 		 347 aa  271  2e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.142425  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0904  IS110 family transposase  40.29 
 
 		 341 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3359  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.32 
 
 		 342 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0643  ISAfe1, transposase  42.55 
 
 		 322 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0524  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.19 
 
 		 302 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2122  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.77 
 
 		 337 aa  261  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0571042  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2204  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.77 
 
 		 337 aa  261  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0377  ISCps1, transposase  40.88 
 
 		 342 aa  259  3e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.417861  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2242  transposase family protein  40.96 
 
 		 455 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.860997  normal  0.210427 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1138  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.95 
 
 		 340 aa  260  3e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.593308  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1141  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.07 
 
 		 337 aa  258  9e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0392691 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3009  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.07 
 
 		 337 aa  258  9e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3552  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.07 
 
 		 337 aa  258  9e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2273  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.07 
 
 		 337 aa  258  9e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.508057 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0928  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.07 
 
 		 337 aa  258  9e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0742  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.35 
 
 		 350 aa  257  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0612  transposase for insertion sequence element IS1111A  41.3 
 
 		 354 aa  256  5e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.531061  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2103  transposase for insertion sequence element IS1111A  41.3 
 
 		 339 aa  256  6e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1983  transposase for insertion sequence element IS1111A  41.3 
 
 		 339 aa  256  6e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1952  transposase for insertion sequence element IS1111A  41.3 
 
 		 339 aa  256  6e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.707191  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1976  transposase for insertion sequence element IS1111A  41.3 
 
 		 339 aa  256  6e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.629494  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2197  transposase for insertion sequence element IS1111A  41.3 
 
 		 339 aa  256  6e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0854  transposase for insertion sequence element IS1111A  41.3 
 
 		 339 aa  256  6e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00143492  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0124  transposase for insertion sequence element IS1111A  41.3 
 
 		 339 aa  256  6e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000332846  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0495  transposase for insertion sequence element IS1111A  41.3 
 
 		 339 aa  256  6e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375707  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0555  transposase for insertion sequence element IS1111A  41.3 
 
 		 339 aa  256  6e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016494  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0714  transposase for insertion sequence element IS1111A  41.3 
 
 		 339 aa  256  6e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0733  transposase for insertion sequence element IS1111A  41.3 
 
 		 339 aa  256  6e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.231607  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0636  transposase for insertion sequence element IS1111A  41.3 
 
 		 339 aa  256  6e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.596694  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0668  transposase for insertion sequence element IS1111A  41.3 
 
 		 339 aa  256  6e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119665  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0330  transposase for insertion sequence element IS1111A  41.3 
 
 		 339 aa  256  6e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000188022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>