More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1138 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008760  Pnap_4711  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  97.34 
 
 		 338 aa  665    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.266875 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1138  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 		 338 aa  697    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1637  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 		 338 aa  697    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.571197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5572  transposase IS116/IS110/IS902  73.08 
 
 		 338 aa  513  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1372  IS111A/IS1328/IS1533  67.16 
 
 		 341 aa  463  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0161177 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2041  transposase IS116/IS110/IS902  66.87 
 
 		 341 aa  461  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3434  transposase IS116/IS110/IS902  67.16 
 
 		 341 aa  464  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0006  ISShdy1, transposase  66.57 
 
 		 338 aa  456  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0989062  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4956  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  64.29 
 
 		 341 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.440622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0114  IS110 family transposase  56.85 
 
 		 340 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  4.57339e-19  hitchhiker  1.5997e-89 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0488  putative transposase IS116/IS110/IS902  62.8 
 
 		 341 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.296532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.56 
 
 		 347 aa  332  6e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2472  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.85 
 
 		 344 aa  331  9e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0993  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.21 
 
 		 341 aa  330  2e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0995  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.21 
 
 		 341 aa  330  2e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4532  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50 
 
 		 499 aa  317  3e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.11 
 
 		 346 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0384  putative transposase  48.37 
 
 		 365 aa  306  3e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0381  putative transposase  48.37 
 
 		 365 aa  306  3e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4485  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.07 
 
 		 356 aa  306  4.0000000000000004e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.218146  hitchhiker  0.00890094 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2845  transposase IS116/IS110/IS902  48.37 
 
 		 355 aa  300  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.277268  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1212  transposase IS116/IS110/IS902  47.77 
 
 		 355 aa  298  7e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4712  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.77 
 
 		 356 aa  296  4e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.401794  normal  0.40759 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.45 
 
 		 343 aa  295  5e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2066  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.45 
 
 		 343 aa  295  5e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.819245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44660  Transposase IS116/IS110/IS902  46.04 
 
 		 338 aa  294  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0375  putative transposase  48.61 
 
 		 345 aa  293  3e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09560  transposase IS116/IS110/IS902  46.18 
 
 		 338 aa  293  3e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.927637  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30230  Transposase IS116/IS110/IS902  46.18 
 
 		 338 aa  293  3e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45790  Transposase IS116/IS110/IS902  46.18 
 
 		 338 aa  291  8e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.997681  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35590  Transposase IS116/IS110/IS902  46.18 
 
 		 338 aa  291  8e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13560  Transposase IS116/IS110/IS902  46.18 
 
 		 338 aa  291  8e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.682801  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0592  transposase IS116/IS110/IS902  44.87 
 
 		 338 aa  290  3e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0881  transposase IS116/IS110/IS902  44.87 
 
 		 338 aa  290  3e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1332  transposase IS116/IS110/IS902  44.87 
 
 		 338 aa  290  3e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3445  transposase IS116/IS110/IS902  44.87 
 
 		 338 aa  290  3e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3083  transposase IS116/IS110/IS902  47.83 
 
 		 343 aa  289  5.0000000000000004e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7431  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.57 
 
 		 338 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1779  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.57 
 
 		 338 aa  287  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3161  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.03 
 
 		 338 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1114  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.03 
 
 		 338 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1170  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.03 
 
 		 338 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.621929  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3976  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.03 
 
 		 338 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.015525  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4213  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.03 
 
 		 338 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3467  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.03 
 
 		 338 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0222  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.03 
 
 		 338 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0137309  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0406  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.03 
 
 		 338 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3805  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.03 
 
 		 338 aa  285  5e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3666  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.03 
 
 		 338 aa  285  8e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0314805 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0841  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.03 
 
 		 338 aa  285  8e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000767297 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0079  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.03 
 
 		 338 aa  285  8e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3664  hypothetical protein  44.44 
 
 		 338 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000781858 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0426  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.78 
 
 		 355 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.509366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1748  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.78 
 
 		 355 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1395  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.78 
 
 		 355 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.688347  normal  0.139029 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1640  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.57 
 
 		 338 aa  276  5e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000188647  unclonable  0.00000000000190741 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0643  ISAfe1, transposase  45.2 
 
 		 322 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3118  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.77 
 
 		 338 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2518  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.91 
 
 		 332 aa  272  6e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4167  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.91 
 
 		 332 aa  272  6e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4005  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.91 
 
 		 332 aa  272  6e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1453  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.91 
 
 		 332 aa  272  6e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2571  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.04 
 
 		 346 aa  267  2e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2242  transposase family protein  42.82 
 
 		 455 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.860997  normal  0.210427 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3216  transposase IS116/IS110/IS902  42.47 
 
 		 385 aa  264  2e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3939  transposase IS116/IS110/IS902  43.36 
 
 		 341 aa  263  4e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7630  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.9 
 
 		 311 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3359  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.35 
 
 		 342 aa  262  6e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3943  transposase IS116/IS110/IS902  42.26 
 
 		 338 aa  261  8.999999999999999e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.147214  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0904  IS110 family transposase  41.47 
 
 		 341 aa  261  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7300  transposase  44.02 
 
 		 341 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.19933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2286  IS110 family transposase  41.18 
 
 		 341 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  hitchhiker  0.00653664 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6452  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.49 
 
 		 340 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.147811  normal  0.356209 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0802  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.36 
 
 		 338 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.890178 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0524  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.74 
 
 		 302 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8105  IS1111A/IS1328/IS1533 family transposase  47 
 
 		 298 aa  256  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162674  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2806  transposase IS116/IS110/IS902  43.37 
 
 		 337 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3360  transposase IS116/IS110/IS902  43.37 
 
 		 337 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4642  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.54 
 
 		 318 aa  251  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.882664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1138  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.31 
 
 		 340 aa  251  1e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.593308  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02812  hypothetical protein  41.92 
 
 		 338 aa  251  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05053  hypothetical protein  41.92 
 
 		 338 aa  251  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01475  hypothetical protein  41.92 
 
 		 338 aa  251  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08193  transposase  41.92 
 
 		 338 aa  250  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3936  transposase IS116/IS110/IS902  41.28 
 
 		 343 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0345  transposase IS116/IS110/IS902  43.36 
 
 		 343 aa  249  6e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222608  normal  0.211948 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1921  transposase IS116/IS110/IS902  43.36 
 
 		 343 aa  249  6e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.876079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3076  transposase IS116/IS110/IS902  43.36 
 
 		 343 aa  249  6e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2447  transposase IS116/IS110/IS902  43.36 
 
 		 343 aa  248  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3074  transposase IS116/IS110/IS902  43.36 
 
 		 343 aa  248  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2122  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.47 
 
 		 337 aa  246  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0571042  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2204  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.47 
 
 		 337 aa  246  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0834  transposase IS116/IS110/IS902  43.44 
 
 		 343 aa  245  8e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220678  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.94 
 
 		 345 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.533752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3116  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.05 
 
 		 346 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.914842  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0109  transposase IS116/IS110/IS902  39.71 
 
 		 343 aa  242  5e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250227  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0132  transposase IS116/IS110/IS902  39.71 
 
 		 343 aa  242  5e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.020989  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2306  transposase IS116/IS110/IS902  39.71 
 
 		 343 aa  242  5e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2934  transposase IS116/IS110/IS902  39.71 
 
 		 343 aa  242  5e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3007  transposase IS116/IS110/IS902  39.71 
 
 		 343 aa  242  5e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.107293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>