More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0488 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0488  putative transposase IS116/IS110/IS902  100 
 
 
341 aa  694    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.296532  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4956  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  93.84 
 
 
341 aa  637    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.440622  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1372  IS111A/IS1328/IS1533  73.43 
 
 
341 aa  507  1e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0161177 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3434  transposase IS116/IS110/IS902  73.43 
 
 
341 aa  508  1e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2041  transposase IS116/IS110/IS902  73.13 
 
 
341 aa  505  9.999999999999999e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0114  IS110 family transposase  65.88 
 
 
340 aa  478  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  4.57339e-19  hitchhiker  1.5997e-89 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4711  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  63.39 
 
 
338 aa  433  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.266875 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5572  transposase IS116/IS110/IS902  63.1 
 
 
338 aa  430  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1138  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  62.8 
 
 
338 aa  419  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1637  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  62.8 
 
 
338 aa  419  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.571197  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0006  ISShdy1, transposase  59.82 
 
 
338 aa  401  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0989062  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0993  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.77 
 
 
341 aa  348  9e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0995  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.77 
 
 
341 aa  348  9e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2472  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.33 
 
 
344 aa  338  5.9999999999999996e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4532  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.76 
 
 
499 aa  335  5e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.97 
 
 
347 aa  325  1e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4485  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.66 
 
 
356 aa  322  9.000000000000001e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.218146  hitchhiker  0.00890094 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.71 
 
 
346 aa  320  3e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4712  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.66 
 
 
356 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.401794  normal  0.40759 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0381  putative transposase  47.34 
 
 
365 aa  301  7.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0384  putative transposase  47.34 
 
 
365 aa  301  7.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.34 
 
 
343 aa  296  3e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437625  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2066  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.34 
 
 
343 aa  296  3e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.819245  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1212  transposase IS116/IS110/IS902  46.29 
 
 
355 aa  292  7e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1748  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.13 
 
 
355 aa  291  9e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1395  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.13 
 
 
355 aa  291  9e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.688347  normal  0.139029 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0426  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.13 
 
 
355 aa  291  9e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.509366  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2845  transposase IS116/IS110/IS902  45.99 
 
 
355 aa  291  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.277268  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3083  transposase IS116/IS110/IS902  45.77 
 
 
343 aa  286  4e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13560  Transposase IS116/IS110/IS902  45.93 
 
 
338 aa  284  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.682801  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35590  Transposase IS116/IS110/IS902  45.93 
 
 
338 aa  284  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45790  Transposase IS116/IS110/IS902  45.93 
 
 
338 aa  284  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.997681  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44660  Transposase IS116/IS110/IS902  46.09 
 
 
338 aa  285  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0375  putative transposase  47.06 
 
 
345 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09560  transposase IS116/IS110/IS902  45.93 
 
 
338 aa  283  3.0000000000000004e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.927637  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30230  Transposase IS116/IS110/IS902  45.93 
 
 
338 aa  283  3.0000000000000004e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3118  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.6 
 
 
338 aa  280  4e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3805  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.12 
 
 
338 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4167  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.25 
 
 
332 aa  277  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0079  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.53 
 
 
338 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4005  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.25 
 
 
332 aa  277  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3666  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.53 
 
 
338 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0314805 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1779  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.71 
 
 
338 aa  276  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0841  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.53 
 
 
338 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767297 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1453  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.25 
 
 
332 aa  277  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2518  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.25 
 
 
332 aa  277  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3943  transposase IS116/IS110/IS902  44.35 
 
 
338 aa  276  3e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.147214  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7431  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.2 
 
 
338 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3467  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.94 
 
 
338 aa  273  3e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4213  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.94 
 
 
338 aa  273  3e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0222  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.94 
 
 
338 aa  273  3e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0137309  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1170  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.94 
 
 
338 aa  273  3e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.621929  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0592  transposase IS116/IS110/IS902  42.65 
 
 
338 aa  273  3e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0881  transposase IS116/IS110/IS902  42.65 
 
 
338 aa  273  3e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1332  transposase IS116/IS110/IS902  42.65 
 
 
338 aa  273  3e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3445  transposase IS116/IS110/IS902  42.65 
 
 
338 aa  273  3e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0406  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.94 
 
 
338 aa  273  3e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1114  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.94 
 
 
338 aa  273  3e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3161  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.94 
 
 
338 aa  273  3e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3976  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.94 
 
 
338 aa  273  3e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.015525  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0643  ISAfe1, transposase  45.2 
 
 
322 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1640  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.24 
 
 
338 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000188647  unclonable  0.00000000000190741 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3664  hypothetical protein  43.24 
 
 
338 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000781858 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2286  IS110 family transposase  42.44 
 
 
341 aa  272  7e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  hitchhiker  0.00653664 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0904  IS110 family transposase  42.65 
 
 
341 aa  271  8.000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4642  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.92 
 
 
318 aa  268  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.882664  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6452  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.08 
 
 
340 aa  265  5.999999999999999e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.147811  normal  0.356209 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3359  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.9 
 
 
342 aa  262  8e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7300  transposase  43.9 
 
 
341 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.19933  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3939  transposase IS116/IS110/IS902  43.15 
 
 
341 aa  258  1e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5872  transposase IS116/IS110/IS902  41.32 
 
 
341 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0505  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.32 
 
 
341 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0567  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.32 
 
 
341 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0767  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.32 
 
 
341 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2205  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.32 
 
 
341 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2966  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.32 
 
 
341 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220936  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2242  transposase family protein  40.18 
 
 
455 aa  255  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.860997  normal  0.210427 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0802  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.48 
 
 
338 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.890178 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2806  transposase IS116/IS110/IS902  41 
 
 
337 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3360  transposase IS116/IS110/IS902  41 
 
 
337 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0834  transposase IS116/IS110/IS902  41.42 
 
 
343 aa  250  3e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220678  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1138  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.24 
 
 
340 aa  249  4e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.593308  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7630  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.67 
 
 
311 aa  249  5e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2571  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.35 
 
 
346 aa  247  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7698  IS1111A/IS1328/IS1533 family transposase  43.2 
 
 
342 aa  246  4e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.951148  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2714  hypothetical protein  43.2 
 
 
342 aa  246  4e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8011  transposase protein  47.89 
 
 
285 aa  244  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0203844  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0181  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.62 
 
 
350 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0473  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.62 
 
 
350 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6016  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.62 
 
 
350 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186566  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6905  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.62 
 
 
350 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3116  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.35 
 
 
346 aa  242  6e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.914842  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0742  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.62 
 
 
350 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3155  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.06 
 
 
346 aa  241  1e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0524  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.33 
 
 
302 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0944  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.32 
 
 
338 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0943  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.32 
 
 
338 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.23 
 
 
345 aa  239  5e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.533752  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1966  transposase IS116/IS110/IS902  41.62 
 
 
346 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2010  transposase IS116/IS110/IS902  41.62 
 
 
346 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.657114  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>