More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0377 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0377  ISCps1, transposase  100 
 
 
342 aa  706    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.417861  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1138  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.14 
 
 
340 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.593308  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.11 
 
 
347 aa  281  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0241  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.47 
 
 
343 aa  280  2e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.578488  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3127  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.76 
 
 
344 aa  278  1e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2472  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.06 
 
 
344 aa  275  9e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0592  transposase IS116/IS110/IS902  40.6 
 
 
338 aa  271  1e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0881  transposase IS116/IS110/IS902  40.6 
 
 
338 aa  271  1e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1332  transposase IS116/IS110/IS902  40.6 
 
 
338 aa  271  1e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3445  transposase IS116/IS110/IS902  40.6 
 
 
338 aa  271  1e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4213  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.32 
 
 
338 aa  270  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0222  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.32 
 
 
338 aa  270  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0137309  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0406  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.32 
 
 
338 aa  270  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1114  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.32 
 
 
338 aa  270  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1170  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.32 
 
 
338 aa  270  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.621929  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3467  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.32 
 
 
338 aa  270  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3161  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.32 
 
 
338 aa  270  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3976  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.32 
 
 
338 aa  270  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.015525  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.48 
 
 
346 aa  267  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1653  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.41 
 
 
345 aa  267  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.359761  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2847  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.41 
 
 
345 aa  267  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.025332  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2932  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.41 
 
 
345 aa  267  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.82 
 
 
343 aa  264  1e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437625  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2066  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.82 
 
 
343 aa  264  1e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.819245  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4532  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.69 
 
 
499 aa  261  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0079  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.19 
 
 
338 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3666  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.19 
 
 
338 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0314805 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0841  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.19 
 
 
338 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767297 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4485  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.88 
 
 
356 aa  259  3e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.218146  hitchhiker  0.00890094 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1779  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.9 
 
 
338 aa  259  4e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3805  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.6 
 
 
338 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03766  ISCps1, transposase  43.66 
 
 
345 aa  256  3e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01826  ISCps1, transposase  43.66 
 
 
345 aa  256  3e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.116041  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02176  ISCps1, transposase  43.66 
 
 
345 aa  256  3e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00204773  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03744  ISCps1, transposase  43.66 
 
 
345 aa  256  3e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.880066  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3664  hypothetical protein  40.3 
 
 
338 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000781858 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4712  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40 
 
 
356 aa  251  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.401794  normal  0.40759 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01545  ISCps1, transposase  43.07 
 
 
345 aa  251  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08193  transposase  39.47 
 
 
338 aa  250  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1640  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.4 
 
 
338 aa  249  5e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000188647  unclonable  0.00000000000190741 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01475  hypothetical protein  39.47 
 
 
338 aa  249  5e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02812  hypothetical protein  39.47 
 
 
338 aa  249  5e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05053  hypothetical protein  39.47 
 
 
338 aa  249  5e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02380  ISCps1, transposase  43.07 
 
 
345 aa  249  6e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.274494  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01182  ISCps1, transposase  43.07 
 
 
345 aa  249  6e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0943  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.87 
 
 
338 aa  247  3e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0944  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.87 
 
 
338 aa  247  3e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7431  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.54 
 
 
338 aa  247  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2286  IS110 family transposase  36.07 
 
 
341 aa  246  4e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  hitchhiker  0.00653664 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2845  transposase IS116/IS110/IS902  40.52 
 
 
355 aa  245  9e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.277268  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0904  IS110 family transposase  36.15 
 
 
341 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3083  transposase IS116/IS110/IS902  36.23 
 
 
343 aa  241  1e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0993  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.99 
 
 
341 aa  241  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0995  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.99 
 
 
341 aa  241  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1212  transposase IS116/IS110/IS902  38.82 
 
 
355 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0612  transposase for insertion sequence element IS1111A  37.09 
 
 
354 aa  239  2.9999999999999997e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.531061  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0007  transposase for insertion sequence element IS1111A  37.09 
 
 
339 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0306334  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1839  transposase for insertion sequence element IS1111A  37.09 
 
 
339 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1952  transposase for insertion sequence element IS1111A  37.09 
 
 
339 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.707191  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2197  transposase for insertion sequence element IS1111A  37.09 
 
 
339 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1676  transposase for insertion sequence element IS1111A  37.09 
 
 
339 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1983  transposase for insertion sequence element IS1111A  37.09 
 
 
339 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1389  transposase for insertion sequence element IS1111A  37.09 
 
 
339 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0847  transposase for insertion sequence element IS1111A  37.09 
 
 
339 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000936051  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0733  transposase for insertion sequence element IS1111A  37.09 
 
 
339 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.231607  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1976  transposase for insertion sequence element IS1111A  37.09 
 
 
339 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.629494  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0714  transposase for insertion sequence element IS1111A  37.09 
 
 
339 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2209  transposase for insertion sequence element IS1111A  37.09 
 
 
339 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000691177  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1826  transposase for insertion sequence element IS1111A  37.09 
 
 
339 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1361  transposase for insertion sequence element IS1111A  37.09 
 
 
339 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.58467  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1338  transposase for insertion sequence element IS1111A  37.09 
 
 
339 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00487008  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0854  transposase for insertion sequence element IS1111A  37.09 
 
 
339 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00143492  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1740  transposase for insertion sequence element IS1111A  37.09 
 
 
339 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1778  transposase for insertion sequence element IS1111A  37.09 
 
 
339 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.459014  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0668  transposase for insertion sequence element IS1111A  37.09 
 
 
339 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119665  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0555  transposase for insertion sequence element IS1111A  37.09 
 
 
339 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016494  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1568  transposase for insertion sequence element IS1111A  37.09 
 
 
339 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0135752  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1715  transposase for insertion sequence element IS1111A  37.09 
 
 
339 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1529  transposase for insertion sequence element IS1111A  37.09 
 
 
339 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0251179  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1591  transposase for insertion sequence element IS1111A  37.09 
 
 
339 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000798859  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1963  transposase for insertion sequence element IS1111A  37.09 
 
 
339 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1848  transposase for insertion sequence element IS1111A  37.09 
 
 
339 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1835  transposase for insertion sequence element IS1111A  37.09 
 
 
339 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1296  transposase for insertion sequence element IS1111A  37.09 
 
 
339 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201015  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2103  transposase for insertion sequence element IS1111A  37.09 
 
 
339 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1033  transposase for insertion sequence element IS1111A  37.09 
 
 
339 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1231  transposase for insertion sequence element IS1111A  37.09 
 
 
339 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1406  transposase for insertion sequence element IS1111A  37.09 
 
 
339 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000279792  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1419  transposase for insertion sequence element IS1111A  37.09 
 
 
339 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1256  transposase for insertion sequence element IS1111A  37.09 
 
 
339 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1652  transposase for insertion sequence element IS1111A  37.09 
 
 
339 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00058709  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1595  transposase for insertion sequence element IS1111A  37.09 
 
 
339 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000374661  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0155  transposase for insertion sequence element IS1111A  37.09 
 
 
339 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.239351  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0495  transposase for insertion sequence element IS1111A  37.09 
 
 
339 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375707  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0330  transposase for insertion sequence element IS1111A  37.09 
 
 
339 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000188022  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0124  transposase for insertion sequence element IS1111A  37.09 
 
 
339 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000332846  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0636  transposase for insertion sequence element IS1111A  37.09 
 
 
339 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.596694  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1748  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.18 
 
 
355 aa  238  8e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1395  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.18 
 
 
355 aa  238  8e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.688347  normal  0.139029 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0426  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.18 
 
 
355 aa  238  8e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.509366  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>