More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_0114 on replicon NC_010158
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010158  YpAngola_0114  IS110 family transposase  100 
 
 
340 aa  709    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  4.57339e-19  hitchhiker  1.5997e-89 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1372  IS111A/IS1328/IS1533  65.97 
 
 
341 aa  465  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0161177 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2041  transposase IS116/IS110/IS902  65.97 
 
 
341 aa  464  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3434  transposase IS116/IS110/IS902  65.97 
 
 
341 aa  464  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4956  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  66.37 
 
 
341 aa  456  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.440622  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0488  putative transposase IS116/IS110/IS902  65.88 
 
 
341 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.296532  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5572  transposase IS116/IS110/IS902  59.52 
 
 
338 aa  413  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0006  ISShdy1, transposase  60.12 
 
 
338 aa  409  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0989062  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4711  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  57.74 
 
 
338 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.266875 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1138  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  56.85 
 
 
338 aa  387  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1637  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  56.85 
 
 
338 aa  387  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.571197  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0993  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.42 
 
 
341 aa  335  5.999999999999999e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0995  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.42 
 
 
341 aa  335  5.999999999999999e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2472  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.08 
 
 
344 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4532  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.41 
 
 
499 aa  327  2.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.52 
 
 
343 aa  318  1e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437625  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2066  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.52 
 
 
343 aa  318  1e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.819245  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.02 
 
 
347 aa  315  7e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.89 
 
 
346 aa  312  4.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0381  putative transposase  47.77 
 
 
365 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0384  putative transposase  47.77 
 
 
365 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4485  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.88 
 
 
356 aa  305  6e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.218146  hitchhiker  0.00890094 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44660  Transposase IS116/IS110/IS902  46.04 
 
 
338 aa  300  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0426  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.49 
 
 
355 aa  299  4e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.509366  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1748  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.49 
 
 
355 aa  299  4e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1395  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.49 
 
 
355 aa  299  4e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.688347  normal  0.139029 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30230  Transposase IS116/IS110/IS902  46.18 
 
 
338 aa  299  5e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09560  transposase IS116/IS110/IS902  46.18 
 
 
338 aa  299  5e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.927637  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13560  Transposase IS116/IS110/IS902  46.18 
 
 
338 aa  299  6e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.682801  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35590  Transposase IS116/IS110/IS902  46.18 
 
 
338 aa  299  6e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45790  Transposase IS116/IS110/IS902  46.18 
 
 
338 aa  299  6e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.997681  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0375  putative transposase  47.68 
 
 
345 aa  298  8e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4712  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.7 
 
 
356 aa  291  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.401794  normal  0.40759 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1212  transposase IS116/IS110/IS902  45.7 
 
 
355 aa  288  7e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7431  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.38 
 
 
338 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3083  transposase IS116/IS110/IS902  44.58 
 
 
343 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2845  transposase IS116/IS110/IS902  44.81 
 
 
355 aa  285  5.999999999999999e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.277268  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0904  IS110 family transposase  44.12 
 
 
341 aa  281  1e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2286  IS110 family transposase  43.4 
 
 
341 aa  280  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  hitchhiker  0.00653664 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3118  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.07 
 
 
338 aa  280  4e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4642  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.51 
 
 
318 aa  276  5e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.882664  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0592  transposase IS116/IS110/IS902  42.23 
 
 
338 aa  275  7e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0881  transposase IS116/IS110/IS902  42.23 
 
 
338 aa  275  7e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1332  transposase IS116/IS110/IS902  42.23 
 
 
338 aa  275  7e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3445  transposase IS116/IS110/IS902  42.23 
 
 
338 aa  275  7e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0643  ISAfe1, transposase  43.34 
 
 
322 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4213  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.35 
 
 
338 aa  271  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3467  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.35 
 
 
338 aa  271  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3976  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.35 
 
 
338 aa  271  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.015525  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1170  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.35 
 
 
338 aa  271  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.621929  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3161  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.35 
 
 
338 aa  271  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3943  transposase IS116/IS110/IS902  42.77 
 
 
338 aa  271  1e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.147214  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0222  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.35 
 
 
338 aa  271  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0137309  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1114  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.35 
 
 
338 aa  271  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0406  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.35 
 
 
338 aa  271  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4005  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.22 
 
 
332 aa  269  4e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2518  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.22 
 
 
332 aa  269  4e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4167  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.22 
 
 
332 aa  269  4e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1453  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.22 
 
 
332 aa  269  4e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1779  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.06 
 
 
338 aa  267  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3666  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.47 
 
 
338 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0314805 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0079  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.47 
 
 
338 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0841  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.47 
 
 
338 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767297 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3805  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.76 
 
 
338 aa  266  5e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3664  hypothetical protein  41.64 
 
 
338 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000781858 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1640  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.88 
 
 
338 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000188647  unclonable  0.00000000000190741 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7300  transposase  40.71 
 
 
341 aa  261  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.19933  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7630  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.95 
 
 
311 aa  259  6e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5872  transposase IS116/IS110/IS902  40 
 
 
341 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0505  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40 
 
 
341 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0567  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40 
 
 
341 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0767  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40 
 
 
341 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2205  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40 
 
 
341 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2966  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40 
 
 
341 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220936  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.64 
 
 
345 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.533752  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2806  transposase IS116/IS110/IS902  41.3 
 
 
337 aa  256  3e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3360  transposase IS116/IS110/IS902  41.3 
 
 
337 aa  256  3e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0943  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.37 
 
 
338 aa  255  6e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3936  transposase IS116/IS110/IS902  39.76 
 
 
343 aa  255  6e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0944  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.37 
 
 
338 aa  255  6e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2714  hypothetical protein  41.42 
 
 
342 aa  253  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3216  transposase IS116/IS110/IS902  40.61 
 
 
385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118777  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3359  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.57 
 
 
342 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7698  IS1111A/IS1328/IS1533 family transposase  41.42 
 
 
342 aa  253  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.951148  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0802  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.69 
 
 
338 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.890178 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0345  transposase IS116/IS110/IS902  40.71 
 
 
343 aa  252  5.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222608  normal  0.211948 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1921  transposase IS116/IS110/IS902  40.71 
 
 
343 aa  252  5.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.876079  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3076  transposase IS116/IS110/IS902  40.71 
 
 
343 aa  252  5.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2447  transposase IS116/IS110/IS902  40.71 
 
 
343 aa  252  8.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3074  transposase IS116/IS110/IS902  40.71 
 
 
343 aa  252  8.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3816  transposase IS116/IS110/IS902  39.41 
 
 
340 aa  249  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.531906  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2571  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.38 
 
 
346 aa  250  3e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8105  IS1111A/IS1328/IS1533 family transposase  44.86 
 
 
298 aa  249  5e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162674  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3939  transposase IS116/IS110/IS902  41.96 
 
 
341 aa  248  8e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6452  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.23 
 
 
340 aa  247  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.147811  normal  0.356209 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0109  transposase IS116/IS110/IS902  38.28 
 
 
343 aa  247  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250227  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0132  transposase IS116/IS110/IS902  38.28 
 
 
343 aa  247  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.020989  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2242  transposase family protein  39.34 
 
 
455 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.860997  normal  0.210427 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2306  transposase IS116/IS110/IS902  38.28 
 
 
343 aa  247  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2934  transposase IS116/IS110/IS902  38.28 
 
 
343 aa  247  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>