More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3936 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3936  transposase IS116/IS110/IS902  100 
 
 		 343 aa  691    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0109  transposase IS116/IS110/IS902  85.42 
 
 		 343 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250227  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0132  transposase IS116/IS110/IS902  85.42 
 
 		 343 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.020989  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2306  transposase IS116/IS110/IS902  85.42 
 
 		 343 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2934  transposase IS116/IS110/IS902  85.42 
 
 		 343 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3007  transposase IS116/IS110/IS902  85.42 
 
 		 343 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.107293  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3682  transposase IS116/IS110/IS902  85.42 
 
 		 343 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1959  transposase IS116/IS110/IS902  85.13 
 
 		 343 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2401  transposase IS110 family protein  52.37 
 
 		 343 aa  359  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3939  transposase IS116/IS110/IS902  51.46 
 
 		 341 aa  350  2e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0802  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.73 
 
 		 338 aa  348  5e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.890178 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5594  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.74 
 
 		 340 aa  343  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3701  hypothetical protein  52.71 
 
 		 348 aa  342  7e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.921253 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0735  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.71 
 
 		 348 aa  342  7e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3359  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.82 
 
 		 342 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6452  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.82 
 
 		 340 aa  332  4e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.147811  normal  0.356209 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8798  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.29 
 
 		 341 aa  325  5e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3955  transposase IS116/IS110/IS902  48.54 
 
 		 342 aa  324  1e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0808  transposase IS116/IS110/IS902  48.25 
 
 		 342 aa  323  2e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.586145  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5032  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.03 
 
 		 338 aa  323  3e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7300  transposase  47.45 
 
 		 341 aa  323  4e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.19933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2571  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.85 
 
 		 346 aa  322  4e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1999  transposase IS116/IS110/IS902  47.9 
 
 		 342 aa  318  7.999999999999999e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3769  transposase IS116/IS110/IS902  47.9 
 
 		 342 aa  318  7.999999999999999e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153925  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8105  IS1111A/IS1328/IS1533 family transposase  52.56 
 
 		 298 aa  316  4e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162674  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4532  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.25 
 
 		 499 aa  314  9.999999999999999e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8455  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.7 
 
 		 333 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.48 
 
 		 347 aa  310  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1017  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.37 
 
 		 342 aa  308  8e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3160  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.37 
 
 		 342 aa  308  8e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.622209  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3561  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.37 
 
 		 342 aa  308  8e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0894579  normal  0.267688 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3844  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.37 
 
 		 342 aa  308  8e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.464911  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.15 
 
 		 346 aa  306  3e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2472  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.52 
 
 		 344 aa  306  4.0000000000000004e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8011  transposase protein  52.65 
 
 		 285 aa  305  7e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0203844  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3156  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.48 
 
 		 338 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0742  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.18 
 
 		 350 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0181  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.88 
 
 		 350 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6905  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.88 
 
 		 350 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0473  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.88 
 
 		 350 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6016  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.88 
 
 		 350 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186566  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0965  transposase IS116/IS110/IS902  42.99 
 
 		 346 aa  298  9e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991458 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1574  transposase IS116/IS110/IS902  42.99 
 
 		 346 aa  298  9e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168491 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1966  transposase IS116/IS110/IS902  42.99 
 
 		 346 aa  298  9e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2010  transposase IS116/IS110/IS902  42.99 
 
 		 346 aa  298  9e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.657114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2061  transposase IS116/IS110/IS902  42.99 
 
 		 346 aa  298  9e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.232183  normal  0.150463 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2092  transposase IS116/IS110/IS902  42.99 
 
 		 346 aa  298  9e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.854494 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3124  transposase IS116/IS110/IS902  42.99 
 
 		 346 aa  298  9e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3160  transposase IS116/IS110/IS902  42.99 
 
 		 346 aa  298  9e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0233772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3275  transposase IS116/IS110/IS902  42.99 
 
 		 346 aa  298  9e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.145129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3642  transposase IS116/IS110/IS902  42.99 
 
 		 346 aa  298  9e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.404408  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4440  transposase IS116/IS110/IS902  42.99 
 
 		 346 aa  298  9e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4622  transposase IS116/IS110/IS902  42.99 
 
 		 346 aa  298  9e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3170  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.51 
 
 		 348 aa  295  7e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3216  transposase IS116/IS110/IS902  46.36 
 
 		 385 aa  295  8e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30230  Transposase IS116/IS110/IS902  42.99 
 
 		 338 aa  293  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09560  transposase IS116/IS110/IS902  42.99 
 
 		 338 aa  293  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.927637  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44660  Transposase IS116/IS110/IS902  42.99 
 
 		 338 aa  293  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0904  IS110 family transposase  42.26 
 
 		 341 aa  291  8e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2286  IS110 family transposase  41.96 
 
 		 341 aa  291  1e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  hitchhiker  0.00653664 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35590  Transposase IS116/IS110/IS902  42.69 
 
 		 338 aa  290  3e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45790  Transposase IS116/IS110/IS902  42.69 
 
 		 338 aa  290  3e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.997681  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13560  Transposase IS116/IS110/IS902  42.69 
 
 		 338 aa  290  3e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.682801  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2714  hypothetical protein  46.43 
 
 		 342 aa  289  5.0000000000000004e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7698  IS1111A/IS1328/IS1533 family transposase  46.43 
 
 		 342 aa  289  5.0000000000000004e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.951148  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.81 
 
 		 343 aa  286  2e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2066  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.81 
 
 		 343 aa  286  2e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.819245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0803  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.97 
 
 		 340 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3083  transposase IS116/IS110/IS902  43.66 
 
 		 343 aa  276  3e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0993  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.71 
 
 		 341 aa  275  7e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0995  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.71 
 
 		 341 aa  275  7e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3595  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.02 
 
 		 315 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.917263  normal  0.896237 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4518  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.35 
 
 		 337 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0643  ISAfe1, transposase  42.63 
 
 		 322 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0464  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.06 
 
 		 332 aa  258  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.18015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0114  IS110 family transposase  39.76 
 
 		 340 aa  255  6e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  4.57339e-19  hitchhiker  1.5997e-89 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0592  transposase IS116/IS110/IS902  37.91 
 
 		 338 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0881  transposase IS116/IS110/IS902  37.91 
 
 		 338 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1332  transposase IS116/IS110/IS902  37.91 
 
 		 338 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3445  transposase IS116/IS110/IS902  37.91 
 
 		 338 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1779  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.5 
 
 		 338 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3666  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.2 
 
 		 338 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0314805 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0841  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.2 
 
 		 338 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000767297 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0079  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.2 
 
 		 338 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3664  hypothetical protein  37.5 
 
 		 338 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000781858 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3816  transposase IS116/IS110/IS902  37.68 
 
 		 340 aa  248  8e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.531906  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3805  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.9 
 
 		 338 aa  248  9e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0406  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.61 
 
 		 338 aa  248  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3161  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.61 
 
 		 338 aa  248  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0222  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.61 
 
 		 338 aa  248  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0137309  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4213  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.61 
 
 		 338 aa  248  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1170  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.61 
 
 		 338 aa  248  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.621929  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1114  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.61 
 
 		 338 aa  248  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3467  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.61 
 
 		 338 aa  248  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3976  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.61 
 
 		 338 aa  248  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.015525  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7431  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.24 
 
 		 338 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4711  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.47 
 
 		 338 aa  243  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.266875 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3274  ISPsy7, transposase  38.12 
 
 		 340 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0336107  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4485  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.35 
 
 		 356 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.218146  hitchhiker  0.00890094 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0427  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.55 
 
 		 346 aa  242  7.999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.674473  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>