More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3816 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3816  transposase IS116/IS110/IS902  100 
 
 
340 aa  702    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.531906  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0372  ISPsy7, transposase  72.84 
 
 
340 aa  521  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2167  ISPsy7, transposase  72.84 
 
 
340 aa  521  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0378398  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2465  ISPsy7, transposase  72.84 
 
 
340 aa  521  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142037  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3146  ISPsy7, transposase  72.84 
 
 
340 aa  521  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0791519  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3325  ISPsy7, transposase  72.84 
 
 
340 aa  521  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0495526  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3746  ISPsy7, transposase  72.84 
 
 
340 aa  521  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26483  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3800  ISPsy7, transposase  72.84 
 
 
340 aa  521  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.561237  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5571  ISPsy7, transposase  72.84 
 
 
340 aa  521  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2485  ISPsy7, transposase  72.54 
 
 
340 aa  520  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00294179  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3274  ISPsy7, transposase  72.54 
 
 
340 aa  520  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0336107  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5872  transposase IS116/IS110/IS902  51.79 
 
 
341 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0505  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.79 
 
 
341 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0567  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.79 
 
 
341 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0767  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.79 
 
 
341 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2205  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.79 
 
 
341 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2966  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.79 
 
 
341 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220936  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09760  Transposase, IS111A/IS1328/IS1533  49.4 
 
 
346 aa  347  1e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0169  transposase InsD2 for insertion sequence IS4321L  47.92 
 
 
334 aa  328  7e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0125  IS5075 transposase  47.32 
 
 
334 aa  325  9e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0140  transposase InsD1 for insertion sequence IS4321R  47.32 
 
 
334 aa  325  9e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.72 
 
 
346 aa  308  8e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07105  hypothetical protein  46.73 
 
 
391 aa  304  1.0000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09560  transposase IS116/IS110/IS902  47.31 
 
 
338 aa  303  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.927637  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30230  Transposase IS116/IS110/IS902  47.31 
 
 
338 aa  303  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44660  Transposase IS116/IS110/IS902  47.31 
 
 
338 aa  303  3.0000000000000004e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35590  Transposase IS116/IS110/IS902  47.31 
 
 
338 aa  302  6.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13560  Transposase IS116/IS110/IS902  47.31 
 
 
338 aa  302  6.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.682801  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45790  Transposase IS116/IS110/IS902  47.31 
 
 
338 aa  302  6.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.997681  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0345  transposase IS116/IS110/IS902  45.67 
 
 
343 aa  298  8e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222608  normal  0.211948 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1921  transposase IS116/IS110/IS902  45.67 
 
 
343 aa  298  8e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.876079  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3076  transposase IS116/IS110/IS902  45.67 
 
 
343 aa  298  8e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2447  transposase IS116/IS110/IS902  45.67 
 
 
343 aa  298  9e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3074  transposase IS116/IS110/IS902  45.67 
 
 
343 aa  298  9e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2472  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.07 
 
 
344 aa  298  1e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4532  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.18 
 
 
499 aa  298  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4139  transposase IS116/IS110/IS902  44.98 
 
 
349 aa  295  7e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.81 
 
 
347 aa  290  4e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3976  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.14 
 
 
338 aa  288  8e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.015525  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4213  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.14 
 
 
338 aa  288  8e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3467  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.14 
 
 
338 aa  288  8e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0406  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.14 
 
 
338 aa  288  8e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0222  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.14 
 
 
338 aa  288  8e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0137309  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3161  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.14 
 
 
338 aa  288  8e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1170  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.14 
 
 
338 aa  288  8e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.621929  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1114  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.14 
 
 
338 aa  288  8e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0592  transposase IS116/IS110/IS902  43.98 
 
 
338 aa  288  9e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0881  transposase IS116/IS110/IS902  43.98 
 
 
338 aa  288  9e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1332  transposase IS116/IS110/IS902  43.98 
 
 
338 aa  288  9e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3445  transposase IS116/IS110/IS902  43.98 
 
 
338 aa  288  9e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0993  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.18 
 
 
341 aa  283  3.0000000000000004e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0995  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.18 
 
 
341 aa  283  3.0000000000000004e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2066  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.03 
 
 
343 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.819245  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.03 
 
 
343 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437625  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1939  transposase IS116/IS110/IS902  44.31 
 
 
374 aa  281  1e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.143032  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7431  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.94 
 
 
338 aa  280  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.44 
 
 
345 aa  280  4e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.533752  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2657  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.47 
 
 
350 aa  279  5e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0268  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.47 
 
 
350 aa  279  5e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0803488 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3083  transposase IS116/IS110/IS902  44.88 
 
 
343 aa  276  4e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1779  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.07 
 
 
338 aa  276  4e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3664  hypothetical protein  43.37 
 
 
338 aa  275  7e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000781858 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3666  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.37 
 
 
338 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0314805 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3939  transposase IS116/IS110/IS902  42.18 
 
 
341 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0079  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.37 
 
 
338 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0841  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.37 
 
 
338 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767297 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3805  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.07 
 
 
338 aa  272  6e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3155  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.02 
 
 
346 aa  271  1e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3116  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.02 
 
 
346 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.914842  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2806  transposase IS116/IS110/IS902  39.82 
 
 
337 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3360  transposase IS116/IS110/IS902  39.82 
 
 
337 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1640  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.77 
 
 
338 aa  269  4e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000188647  unclonable  0.00000000000190741 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0834  transposase IS116/IS110/IS902  41.59 
 
 
343 aa  269  5.9999999999999995e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220678  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0808  transposase IS116/IS110/IS902  42.06 
 
 
342 aa  268  1e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.586145  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0943  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.47 
 
 
338 aa  264  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0944  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.47 
 
 
338 aa  264  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0643  ISAfe1, transposase  43.85 
 
 
322 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3955  transposase IS116/IS110/IS902  40.88 
 
 
342 aa  262  8e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3118  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.14 
 
 
338 aa  261  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5594  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.59 
 
 
340 aa  260  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2518  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.96 
 
 
332 aa  259  4e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1453  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.96 
 
 
332 aa  259  4e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4167  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.96 
 
 
332 aa  259  4e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4005  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.96 
 
 
332 aa  259  4e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0904  IS110 family transposase  38.53 
 
 
341 aa  258  9e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05053  hypothetical protein  40 
 
 
338 aa  258  1e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08193  transposase  40 
 
 
338 aa  258  1e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01475  hypothetical protein  40 
 
 
338 aa  258  1e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2286  IS110 family transposase  38.53 
 
 
341 aa  258  1e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  hitchhiker  0.00653664 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02812  hypothetical protein  40 
 
 
338 aa  258  1e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0742  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.88 
 
 
350 aa  256  4e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7630  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.67 
 
 
311 aa  255  6e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6016  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.88 
 
 
350 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186566  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0181  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.88 
 
 
350 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0473  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.88 
 
 
350 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6905  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.88 
 
 
350 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7698  IS1111A/IS1328/IS1533 family transposase  41.14 
 
 
342 aa  253  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.951148  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8798  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.29 
 
 
341 aa  253  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2714  hypothetical protein  41.14 
 
 
342 aa  253  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2571  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.19 
 
 
346 aa  253  4.0000000000000004e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>