More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0464 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0464  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 		 332 aa  672    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.18015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4518  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  68.07 
 
 		 337 aa  442  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1017  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  58.18 
 
 		 342 aa  387  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3160  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  58.18 
 
 		 342 aa  387  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.622209  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3561  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  58.18 
 
 		 342 aa  387  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0894579  normal  0.267688 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3844  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  58.18 
 
 		 342 aa  387  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.464911  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0803  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  56.06 
 
 		 340 aa  354  1e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8798  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.58 
 
 		 341 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3939  transposase IS116/IS110/IS902  51.67 
 
 		 341 aa  325  7e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8455  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.6 
 
 		 333 aa  323  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3955  transposase IS116/IS110/IS902  52.58 
 
 		 342 aa  322  4e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0808  transposase IS116/IS110/IS902  51.98 
 
 		 342 aa  322  6e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.586145  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5594  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.67 
 
 		 340 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3170  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.51 
 
 		 348 aa  312  4.999999999999999e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2401  transposase IS110 family protein  45.32 
 
 		 343 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6452  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.83 
 
 		 340 aa  275  8e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.147811  normal  0.356209 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3936  transposase IS116/IS110/IS902  46.06 
 
 		 343 aa  275  8e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0802  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.26 
 
 		 338 aa  275  9e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.890178 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7300  transposase  45.32 
 
 		 341 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.19933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0109  transposase IS116/IS110/IS902  43.5 
 
 		 343 aa  264  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250227  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0132  transposase IS116/IS110/IS902  43.5 
 
 		 343 aa  264  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.020989  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1959  transposase IS116/IS110/IS902  43.2 
 
 		 343 aa  263  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2306  transposase IS116/IS110/IS902  43.5 
 
 		 343 aa  264  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2934  transposase IS116/IS110/IS902  43.5 
 
 		 343 aa  264  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3007  transposase IS116/IS110/IS902  43.5 
 
 		 343 aa  264  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.107293  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3682  transposase IS116/IS110/IS902  43.5 
 
 		 343 aa  264  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4532  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.51 
 
 		 499 aa  263  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1453  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.42 
 
 		 332 aa  263  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4167  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.42 
 
 		 332 aa  263  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4005  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.42 
 
 		 332 aa  263  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2518  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.42 
 
 		 332 aa  263  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.86 
 
 		 343 aa  259  4e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2066  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.86 
 
 		 343 aa  259  4e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.819245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2571  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.9 
 
 		 346 aa  259  5.0000000000000005e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2714  hypothetical protein  42.17 
 
 		 342 aa  259  6e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7698  IS1111A/IS1328/IS1533 family transposase  42.17 
 
 		 342 aa  259  6e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.951148  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3359  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.15 
 
 		 342 aa  257  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2806  transposase IS116/IS110/IS902  40.72 
 
 		 337 aa  256  3e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3360  transposase IS116/IS110/IS902  40.72 
 
 		 337 aa  256  3e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3701  hypothetical protein  46.2 
 
 		 348 aa  256  4e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.921253 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0735  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.2 
 
 		 348 aa  256  4e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5032  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.02 
 
 		 338 aa  255  7e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45790  Transposase IS116/IS110/IS902  42.09 
 
 		 338 aa  255  9e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.997681  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35590  Transposase IS116/IS110/IS902  42.09 
 
 		 338 aa  255  9e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13560  Transposase IS116/IS110/IS902  42.09 
 
 		 338 aa  255  9e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.682801  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44660  Transposase IS116/IS110/IS902  41.84 
 
 		 338 aa  254  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30230  Transposase IS116/IS110/IS902  42.09 
 
 		 338 aa  253  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2472  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.02 
 
 		 344 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09560  transposase IS116/IS110/IS902  42.09 
 
 		 338 aa  253  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.927637  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.86 
 
 		 346 aa  253  3e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.77 
 
 		 347 aa  251  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3595  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.88 
 
 		 315 aa  249  7e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.917263  normal  0.896237 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3156  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.62 
 
 		 338 aa  247  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3216  transposase IS116/IS110/IS902  42.33 
 
 		 385 aa  245  9e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1999  transposase IS116/IS110/IS902  41.61 
 
 		 342 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3769  transposase IS116/IS110/IS902  41.61 
 
 		 342 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153925  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8011  transposase protein  46.79 
 
 		 285 aa  242  6e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0203844  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7431  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.61 
 
 		 338 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8105  IS1111A/IS1328/IS1533 family transposase  45.8 
 
 		 298 aa  240  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162674  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0993  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.42 
 
 		 341 aa  240  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0995  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.42 
 
 		 341 aa  240  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0965  transposase IS116/IS110/IS902  42.12 
 
 		 346 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991458 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1574  transposase IS116/IS110/IS902  42.12 
 
 		 346 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168491 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1966  transposase IS116/IS110/IS902  42.12 
 
 		 346 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2010  transposase IS116/IS110/IS902  42.12 
 
 		 346 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.657114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2061  transposase IS116/IS110/IS902  42.12 
 
 		 346 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.232183  normal  0.150463 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2092  transposase IS116/IS110/IS902  42.12 
 
 		 346 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.854494 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3124  transposase IS116/IS110/IS902  42.12 
 
 		 346 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3160  transposase IS116/IS110/IS902  42.12 
 
 		 346 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0233772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3275  transposase IS116/IS110/IS902  42.12 
 
 		 346 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.145129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3642  transposase IS116/IS110/IS902  42.12 
 
 		 346 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.404408  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4440  transposase IS116/IS110/IS902  42.12 
 
 		 346 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4622  transposase IS116/IS110/IS902  42.12 
 
 		 346 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2122  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.44 
 
 		 337 aa  239  5e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0571042  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2204  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.44 
 
 		 337 aa  239  5e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3233  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  58.33 
 
 		 225 aa  234  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3009  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.58 
 
 		 337 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1141  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.58 
 
 		 337 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0392691 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0928  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.58 
 
 		 337 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2273  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.58 
 
 		 337 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.508057 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3552  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.58 
 
 		 337 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0904  IS110 family transposase  37.46 
 
 		 341 aa  231  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4485  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.47 
 
 		 356 aa  231  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.218146  hitchhiker  0.00890094 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0181  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.36 
 
 		 350 aa  230  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6016  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.36 
 
 		 350 aa  230  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186566  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6905  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.36 
 
 		 350 aa  230  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0473  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.36 
 
 		 350 aa  230  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0742  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.36 
 
 		 350 aa  230  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0834  transposase IS116/IS110/IS902  43.17 
 
 		 343 aa  228  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220678  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2696  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.13 
 
 		 342 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000117153  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3816  transposase IS116/IS110/IS902  37.08 
 
 		 340 aa  226  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.531906  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0592  transposase IS116/IS110/IS902  37.65 
 
 		 338 aa  226  3e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0881  transposase IS116/IS110/IS902  37.65 
 
 		 338 aa  226  3e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1332  transposase IS116/IS110/IS902  37.65 
 
 		 338 aa  226  3e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3445  transposase IS116/IS110/IS902  37.65 
 
 		 338 aa  226  3e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1525  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.83 
 
 		 342 aa  226  6e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.554146  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0668  transposase for insertion sequence element IS1111A  39.76 
 
 		 339 aa  224  1e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119665  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1033  transposase for insertion sequence element IS1111A  39.76 
 
 		 339 aa  224  1e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0847  transposase for insertion sequence element IS1111A  39.76 
 
 		 339 aa  224  1e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000936051  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0636  transposase for insertion sequence element IS1111A  39.76 
 
 		 339 aa  224  1e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.596694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>