More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3359 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_3359  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
342 aa  687    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6452  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.55 
 
 
340 aa  359  3e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.147811  normal  0.356209 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7300  transposase  51.46 
 
 
341 aa  355  5.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.19933  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5032  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  57.69 
 
 
338 aa  348  9e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5594  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.82 
 
 
340 aa  342  5e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2571  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.22 
 
 
346 aa  342  7e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0802  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.84 
 
 
338 aa  341  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.890178 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3701  hypothetical protein  52.79 
 
 
348 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.921253 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0735  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.79 
 
 
348 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3936  transposase IS116/IS110/IS902  48.82 
 
 
343 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4532  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.19 
 
 
499 aa  333  2e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8105  IS1111A/IS1328/IS1533 family transposase  55.56 
 
 
298 aa  332  4e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162674  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3939  transposase IS116/IS110/IS902  50.44 
 
 
341 aa  329  3e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2472  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.8 
 
 
344 aa  325  5e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.38 
 
 
347 aa  325  7e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1959  transposase IS116/IS110/IS902  46.59 
 
 
343 aa  323  2e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.4 
 
 
346 aa  322  5e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0109  transposase IS116/IS110/IS902  46.59 
 
 
343 aa  322  7e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250227  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0132  transposase IS116/IS110/IS902  46.59 
 
 
343 aa  322  7e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.020989  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2306  transposase IS116/IS110/IS902  46.59 
 
 
343 aa  322  7e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2934  transposase IS116/IS110/IS902  46.59 
 
 
343 aa  322  7e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3007  transposase IS116/IS110/IS902  46.59 
 
 
343 aa  322  7e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.107293  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3682  transposase IS116/IS110/IS902  46.59 
 
 
343 aa  322  7e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3216  transposase IS116/IS110/IS902  48.79 
 
 
385 aa  321  9.999999999999999e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118777  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3955  transposase IS116/IS110/IS902  49.41 
 
 
342 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8011  transposase protein  57.14 
 
 
285 aa  320  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0203844  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0808  transposase IS116/IS110/IS902  49.12 
 
 
342 aa  320  3e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.586145  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2066  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.66 
 
 
343 aa  317  2e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.819245  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.66 
 
 
343 aa  317  2e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437625  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3170  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.85 
 
 
348 aa  317  3e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2401  transposase IS110 family protein  46.88 
 
 
343 aa  315  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1999  transposase IS116/IS110/IS902  48.8 
 
 
342 aa  315  8e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3769  transposase IS116/IS110/IS902  48.8 
 
 
342 aa  315  8e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153925  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8798  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.41 
 
 
341 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09560  transposase IS116/IS110/IS902  47.32 
 
 
338 aa  307  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.927637  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7698  IS1111A/IS1328/IS1533 family transposase  50 
 
 
342 aa  307  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.951148  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44660  Transposase IS116/IS110/IS902  46.61 
 
 
338 aa  308  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30230  Transposase IS116/IS110/IS902  47.32 
 
 
338 aa  307  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2714  hypothetical protein  50 
 
 
342 aa  307  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2286  IS110 family transposase  45.1 
 
 
341 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  hitchhiker  0.00653664 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0904  IS110 family transposase  45.13 
 
 
341 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13560  Transposase IS116/IS110/IS902  47.32 
 
 
338 aa  305  5.0000000000000004e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.682801  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35590  Transposase IS116/IS110/IS902  47.32 
 
 
338 aa  305  5.0000000000000004e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45790  Transposase IS116/IS110/IS902  47.32 
 
 
338 aa  305  5.0000000000000004e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.997681  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8455  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.1 
 
 
333 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0742  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.55 
 
 
350 aa  298  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0965  transposase IS116/IS110/IS902  47.15 
 
 
346 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991458 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1574  transposase IS116/IS110/IS902  47.15 
 
 
346 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00168491 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1966  transposase IS116/IS110/IS902  47.15 
 
 
346 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2010  transposase IS116/IS110/IS902  47.15 
 
 
346 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.657114  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2061  transposase IS116/IS110/IS902  47.15 
 
 
346 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.232183  normal  0.150463 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2092  transposase IS116/IS110/IS902  47.15 
 
 
346 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.854494 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3124  transposase IS116/IS110/IS902  47.15 
 
 
346 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3160  transposase IS116/IS110/IS902  47.15 
 
 
346 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0233772  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3275  transposase IS116/IS110/IS902  47.15 
 
 
346 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.145129  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3642  transposase IS116/IS110/IS902  47.15 
 
 
346 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.404408  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4440  transposase IS116/IS110/IS902  47.15 
 
 
346 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4622  transposase IS116/IS110/IS902  47.15 
 
 
346 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1017  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.9 
 
 
342 aa  297  1e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3160  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.9 
 
 
342 aa  297  1e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.622209  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3561  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.9 
 
 
342 aa  297  1e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0894579  normal  0.267688 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3844  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.9 
 
 
342 aa  297  1e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.464911  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6905  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.25 
 
 
350 aa  296  5e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6016  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.25 
 
 
350 aa  296  5e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186566  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0473  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.25 
 
 
350 aa  296  5e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0181  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.25 
 
 
350 aa  296  5e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0993  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.25 
 
 
341 aa  295  7e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0995  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.25 
 
 
341 aa  295  7e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3156  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.45 
 
 
338 aa  290  2e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6180  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.66 
 
 
336 aa  290  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.626192  hitchhiker  0.00140825 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3083  transposase IS116/IS110/IS902  45.99 
 
 
343 aa  282  6.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0803  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.43 
 
 
340 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3595  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.16 
 
 
315 aa  280  3e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.917263  normal  0.896237 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4485  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.32 
 
 
356 aa  269  5e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.218146  hitchhiker  0.00890094 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0006  ISShdy1, transposase  44.15 
 
 
338 aa  265  5.999999999999999e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0989062  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1453  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.64 
 
 
332 aa  265  7e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2518  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.64 
 
 
332 aa  265  7e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4005  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.64 
 
 
332 aa  265  7e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4167  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.64 
 
 
332 aa  265  7e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1372  IS111A/IS1328/IS1533  44.71 
 
 
341 aa  263  3e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0161177 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1569  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.4 
 
 
342 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000196029 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1895  ISAfe1, transposase  42.4 
 
 
342 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2041  transposase IS116/IS110/IS902  44.71 
 
 
341 aa  262  4.999999999999999e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1571  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.4 
 
 
342 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000595927 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3183  ISAfe1, transposase  42.4 
 
 
342 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.487441  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2781  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.4 
 
 
342 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3434  transposase IS116/IS110/IS902  44.41 
 
 
341 aa  261  1e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2806  transposase IS116/IS110/IS902  39.76 
 
 
337 aa  258  8e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3360  transposase IS116/IS110/IS902  39.76 
 
 
337 aa  258  8e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0643  ISAfe1, transposase  42.55 
 
 
322 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0592  transposase IS116/IS110/IS902  39.4 
 
 
338 aa  257  2e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0881  transposase IS116/IS110/IS902  39.4 
 
 
338 aa  257  2e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1332  transposase IS116/IS110/IS902  39.4 
 
 
338 aa  257  2e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3445  transposase IS116/IS110/IS902  39.4 
 
 
338 aa  257  2e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0381  putative transposase  45.03 
 
 
365 aa  256  3e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4712  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.92 
 
 
356 aa  256  3e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.401794  normal  0.40759 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0384  putative transposase  45.03 
 
 
365 aa  256  3e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4711  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.31 
 
 
338 aa  256  4e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.266875 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1779  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.05 
 
 
338 aa  256  4e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3664  hypothetical protein  38.76 
 
 
338 aa  255  8e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000781858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>