More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_8105 on replicon NC_011982
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011982  Avi_8105  IS1111A/IS1328/IS1533 family transposase  100 
 
 		 298 aa  603  1.0000000000000001e-171  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162674  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6452  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  58.76 
 
 		 340 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.147811  normal  0.356209 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3359  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  55.56 
 
 		 342 aa  332  3e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7300  transposase  55.56 
 
 		 341 aa  332  3e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.19933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0802  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  58.08 
 
 		 338 aa  332  4e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.890178 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8011  transposase protein  54.23 
 
 		 285 aa  317  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0203844  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3936  transposase IS116/IS110/IS902  52.56 
 
 		 343 aa  316  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5032  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  56.12 
 
 		 338 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0109  transposase IS116/IS110/IS902  50.34 
 
 		 343 aa  311  1e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250227  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0132  transposase IS116/IS110/IS902  50.34 
 
 		 343 aa  311  1e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.020989  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2306  transposase IS116/IS110/IS902  50.34 
 
 		 343 aa  311  1e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2934  transposase IS116/IS110/IS902  50.34 
 
 		 343 aa  311  1e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3007  transposase IS116/IS110/IS902  50.34 
 
 		 343 aa  311  1e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.107293  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3682  transposase IS116/IS110/IS902  50.34 
 
 		 343 aa  311  1e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0735  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.01 
 
 		 348 aa  311  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3701  hypothetical protein  54.01 
 
 		 348 aa  311  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.921253 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3939  transposase IS116/IS110/IS902  55.28 
 
 		 341 aa  308  5.9999999999999995e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2571  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.79 
 
 		 346 aa  308  5.9999999999999995e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1959  transposase IS116/IS110/IS902  49.66 
 
 		 343 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4532  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.12 
 
 		 499 aa  306  2.0000000000000002e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.74 
 
 		 347 aa  304  1.0000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.56 
 
 		 346 aa  300  3e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2472  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.68 
 
 		 344 aa  299  4e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0965  transposase IS116/IS110/IS902  50.52 
 
 		 346 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991458 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1574  transposase IS116/IS110/IS902  50.52 
 
 		 346 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168491 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1966  transposase IS116/IS110/IS902  50.52 
 
 		 346 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2010  transposase IS116/IS110/IS902  50.52 
 
 		 346 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.657114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2061  transposase IS116/IS110/IS902  50.52 
 
 		 346 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.232183  normal  0.150463 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2092  transposase IS116/IS110/IS902  50.52 
 
 		 346 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.854494 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3124  transposase IS116/IS110/IS902  50.52 
 
 		 346 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3160  transposase IS116/IS110/IS902  50.52 
 
 		 346 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0233772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3275  transposase IS116/IS110/IS902  50.52 
 
 		 346 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.145129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3642  transposase IS116/IS110/IS902  50.52 
 
 		 346 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.404408  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4440  transposase IS116/IS110/IS902  50.52 
 
 		 346 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4622  transposase IS116/IS110/IS902  50.52 
 
 		 346 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7698  IS1111A/IS1328/IS1533 family transposase  51.55 
 
 		 342 aa  289  4e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.951148  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2714  hypothetical protein  51.55 
 
 		 342 aa  289  4e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5594  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.9 
 
 		 340 aa  288  6e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.69 
 
 		 343 aa  288  8e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2066  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.69 
 
 		 343 aa  288  8e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.819245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0742  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.8 
 
 		 350 aa  288  9e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1999  transposase IS116/IS110/IS902  48.44 
 
 		 342 aa  288  9e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3769  transposase IS116/IS110/IS902  48.44 
 
 		 342 aa  288  9e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153925  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0993  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.65 
 
 		 341 aa  286  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0995  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.65 
 
 		 341 aa  286  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0181  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.74 
 
 		 350 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6905  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.74 
 
 		 350 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0473  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.74 
 
 		 350 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6016  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.74 
 
 		 350 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186566  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30230  Transposase IS116/IS110/IS902  50 
 
 		 338 aa  285  4e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09560  transposase IS116/IS110/IS902  50 
 
 		 338 aa  285  4e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.927637  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44660  Transposase IS116/IS110/IS902  50 
 
 		 338 aa  286  4e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13560  Transposase IS116/IS110/IS902  50 
 
 		 338 aa  285  5.999999999999999e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.682801  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35590  Transposase IS116/IS110/IS902  50 
 
 		 338 aa  285  5.999999999999999e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45790  Transposase IS116/IS110/IS902  50 
 
 		 338 aa  285  5.999999999999999e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.997681  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2286  IS110 family transposase  47.93 
 
 		 341 aa  281  7.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  hitchhiker  0.00653664 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0904  IS110 family transposase  47.93 
 
 		 341 aa  281  1e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2401  transposase IS110 family protein  47.24 
 
 		 343 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3216  transposase IS116/IS110/IS902  49.46 
 
 		 385 aa  271  8.000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1017  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50 
 
 		 342 aa  271  9e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3160  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50 
 
 		 342 aa  271  9e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.622209  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3561  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50 
 
 		 342 aa  271  9e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0894579  normal  0.267688 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3844  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50 
 
 		 342 aa  271  9e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.464911  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8798  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.62 
 
 		 341 aa  268  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3156  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.24 
 
 		 338 aa  265  5e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3170  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.78 
 
 		 348 aa  262  4.999999999999999e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3955  transposase IS116/IS110/IS902  50.7 
 
 		 342 aa  261  1e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8455  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.74 
 
 		 333 aa  260  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3083  transposase IS116/IS110/IS902  49.32 
 
 		 343 aa  260  2e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0808  transposase IS116/IS110/IS902  50 
 
 		 342 aa  258  7e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.586145  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0006  ISShdy1, transposase  46.92 
 
 		 338 aa  256  3e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0989062  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3434  transposase IS116/IS110/IS902  47.95 
 
 		 341 aa  256  5e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4711  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47 
 
 		 338 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.266875 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1372  IS111A/IS1328/IS1533  47.6 
 
 		 341 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0161177 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2041  transposase IS116/IS110/IS902  47.6 
 
 		 341 aa  253  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3595  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.97 
 
 		 315 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.917263  normal  0.896237 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6180  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.78 
 
 		 336 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.626192  hitchhiker  0.00140825 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1571  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.22 
 
 		 342 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000595927 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3183  ISAfe1, transposase  47.22 
 
 		 342 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.487441  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1895  ISAfe1, transposase  47.22 
 
 		 342 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2781  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.22 
 
 		 342 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1569  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.22 
 
 		 342 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000196029 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0114  IS110 family transposase  44.86 
 
 		 340 aa  249  4e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  4.57339e-19  hitchhiker  1.5997e-89 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0803  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.06 
 
 		 340 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2518  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.74 
 
 		 332 aa  246  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4005  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.74 
 
 		 332 aa  246  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1453  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.74 
 
 		 332 aa  246  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4167  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.74 
 
 		 332 aa  246  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5572  transposase IS116/IS110/IS902  44.33 
 
 		 338 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4213  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.22 
 
 		 338 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3161  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.22 
 
 		 338 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3976  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.22 
 
 		 338 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.015525  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3467  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.22 
 
 		 338 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1170  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.22 
 
 		 338 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.621929  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1114  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.22 
 
 		 338 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0222  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.22 
 
 		 338 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0137309  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0406  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.22 
 
 		 338 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1138  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47 
 
 		 338 aa  240  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1637  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47 
 
 		 338 aa  240  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.571197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18390  Transposase IS116/IS110/IS902 family  42.71 
 
 		 341 aa  238  8e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>