More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0904 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_2286  IS110 family transposase  98.83 
 
 		 341 aa  701    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  hitchhiker  0.00653664 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0904  IS110 family transposase  100 
 
 		 341 aa  710    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2066  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.3 
 
 		 343 aa  385  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.819245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.3 
 
 		 343 aa  385  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.15 
 
 		 347 aa  365  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.64 
 
 		 346 aa  363  3e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4532  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.26 
 
 		 499 aa  361  1e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2472  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.97 
 
 		 344 aa  360  2e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30230  Transposase IS116/IS110/IS902  50.3 
 
 		 338 aa  337  1.9999999999999998e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09560  transposase IS116/IS110/IS902  50.3 
 
 		 338 aa  337  1.9999999999999998e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.927637  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45790  Transposase IS116/IS110/IS902  50.3 
 
 		 338 aa  336  2.9999999999999997e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.997681  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13560  Transposase IS116/IS110/IS902  50.3 
 
 		 338 aa  336  2.9999999999999997e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.682801  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35590  Transposase IS116/IS110/IS902  50.3 
 
 		 338 aa  336  2.9999999999999997e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44660  Transposase IS116/IS110/IS902  50.15 
 
 		 338 aa  333  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0993  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.92 
 
 		 341 aa  328  1.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0995  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.92 
 
 		 341 aa  328  1.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3083  transposase IS116/IS110/IS902  46.9 
 
 		 343 aa  322  4e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0802  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.45 
 
 		 338 aa  320  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.890178 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6452  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.94 
 
 		 340 aa  318  7.999999999999999e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.147811  normal  0.356209 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7431  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.54 
 
 		 338 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3183  ISAfe1, transposase  46.57 
 
 		 342 aa  309  4e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.487441  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1895  ISAfe1, transposase  46.57 
 
 		 342 aa  309  4e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2781  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.57 
 
 		 342 aa  309  4e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1569  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.57 
 
 		 342 aa  309  4e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000196029 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1571  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.57 
 
 		 342 aa  309  4e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000595927 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3359  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.13 
 
 		 342 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0735  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.71 
 
 		 348 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3701  hypothetical protein  46.71 
 
 		 348 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.921253 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.64 
 
 		 345 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.533752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0643  ISAfe1, transposase  45.96 
 
 		 322 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0592  transposase IS116/IS110/IS902  43.15 
 
 		 338 aa  295  9e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0881  transposase IS116/IS110/IS902  43.15 
 
 		 338 aa  295  9e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1332  transposase IS116/IS110/IS902  43.15 
 
 		 338 aa  295  9e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3445  transposase IS116/IS110/IS902  43.15 
 
 		 338 aa  295  9e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3936  transposase IS116/IS110/IS902  42.26 
 
 		 343 aa  291  8e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3976  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.26 
 
 		 338 aa  291  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.015525  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3161  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.26 
 
 		 338 aa  291  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0406  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.26 
 
 		 338 aa  291  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3467  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.26 
 
 		 338 aa  291  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18390  Transposase IS116/IS110/IS902 family  42.86 
 
 		 341 aa  291  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1114  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.26 
 
 		 338 aa  291  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0222  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.26 
 
 		 338 aa  291  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0137309  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4213  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.26 
 
 		 338 aa  291  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1170  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.26 
 
 		 338 aa  291  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.621929  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5872  transposase IS116/IS110/IS902  44.48 
 
 		 341 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0505  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.48 
 
 		 341 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0567  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.48 
 
 		 341 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0767  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.48 
 
 		 341 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2205  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.48 
 
 		 341 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2966  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.48 
 
 		 341 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220936  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3805  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.45 
 
 		 338 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3118  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.31 
 
 		 338 aa  285  5e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3664  hypothetical protein  43.15 
 
 		 338 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000781858 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0841  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.75 
 
 		 338 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000767297 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3666  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.75 
 
 		 338 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0314805 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0079  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.75 
 
 		 338 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5032  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.27 
 
 		 338 aa  285  8e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0109  transposase IS116/IS110/IS902  41.07 
 
 		 343 aa  285  9e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250227  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0132  transposase IS116/IS110/IS902  41.07 
 
 		 343 aa  285  9e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.020989  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2306  transposase IS116/IS110/IS902  41.07 
 
 		 343 aa  285  9e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2934  transposase IS116/IS110/IS902  41.07 
 
 		 343 aa  285  9e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3007  transposase IS116/IS110/IS902  41.07 
 
 		 343 aa  285  9e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.107293  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3682  transposase IS116/IS110/IS902  41.07 
 
 		 343 aa  285  9e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1959  transposase IS116/IS110/IS902  41.07 
 
 		 343 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3939  transposase IS116/IS110/IS902  43.11 
 
 		 341 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0943  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.56 
 
 		 338 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2913  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.15 
 
 		 339 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0944  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.56 
 
 		 338 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2242  transposase family protein  41.67 
 
 		 455 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.860997  normal  0.210427 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7698  IS1111A/IS1328/IS1533 family transposase  43.32 
 
 		 342 aa  282  6.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.951148  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2714  hypothetical protein  43.32 
 
 		 342 aa  282  6.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1779  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.56 
 
 		 338 aa  281  9e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0114  IS110 family transposase  44.12 
 
 		 340 aa  281  1e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  4.57339e-19  hitchhiker  1.5997e-89 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8105  IS1111A/IS1328/IS1533 family transposase  47.93 
 
 		 298 aa  281  1e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162674  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1640  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.56 
 
 		 338 aa  277  1e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000188647  unclonable  0.00000000000190741 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3116  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.67 
 
 		 346 aa  277  2e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.914842  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7300  transposase  42.43 
 
 		 341 aa  277  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.19933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3943  transposase IS116/IS110/IS902  42.25 
 
 		 338 aa  276  3e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.147214  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3155  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.67 
 
 		 346 aa  276  3e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2447  transposase IS116/IS110/IS902  40.47 
 
 		 343 aa  275  6e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3074  transposase IS116/IS110/IS902  40.47 
 
 		 343 aa  275  6e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2806  transposase IS116/IS110/IS902  41.37 
 
 		 337 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3360  transposase IS116/IS110/IS902  41.37 
 
 		 337 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0345  transposase IS116/IS110/IS902  40.18 
 
 		 343 aa  274  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222608  normal  0.211948 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1921  transposase IS116/IS110/IS902  40.18 
 
 		 343 aa  274  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.876079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3076  transposase IS116/IS110/IS902  40.18 
 
 		 343 aa  274  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0834  transposase IS116/IS110/IS902  41.49 
 
 		 343 aa  273  3e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220678  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4167  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.21 
 
 		 332 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3882  transposase, IS1111 family  42.86 
 
 		 339 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2240  transposase, IS1111 family  42.86 
 
 		 339 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000963569  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4005  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.21 
 
 		 332 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1453  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.21 
 
 		 332 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2518  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.21 
 
 		 332 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6180  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.09 
 
 		 336 aa  272  6e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.626192  hitchhiker  0.00140825 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1033  transposase for insertion sequence element IS1111A  42.81 
 
 		 339 aa  271  9e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0636  transposase for insertion sequence element IS1111A  42.81 
 
 		 339 aa  271  9e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.596694  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0847  transposase for insertion sequence element IS1111A  42.81 
 
 		 339 aa  271  9e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000936051  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1568  transposase for insertion sequence element IS1111A  42.81 
 
 		 339 aa  271  9e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0135752  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1839  transposase for insertion sequence element IS1111A  42.81 
 
 		 339 aa  271  9e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1848  transposase for insertion sequence element IS1111A  42.81 
 
 		 339 aa  271  9e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>