More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1895 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_3183  ISAfe1, transposase  100 
 
 
342 aa  700    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.487441  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2781  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
342 aa  700    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1895  ISAfe1, transposase  100 
 
 
342 aa  700    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1571  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
342 aa  700    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000595927 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1569  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
342 aa  700    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000196029 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6180  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  59.35 
 
 
336 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.626192  hitchhiker  0.00140825 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2913  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  56.19 
 
 
339 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18390  Transposase IS116/IS110/IS902 family  52.99 
 
 
341 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2240  transposase, IS1111 family  53.43 
 
 
339 aa  363  2e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000963569  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3882  transposase, IS1111 family  53.43 
 
 
339 aa  363  2e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0485  putative transposase IS116/IS110/IS902  54.49 
 
 
332 aa  350  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0324291  normal  0.781699 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2472  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.71 
 
 
344 aa  347  2e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.71 
 
 
347 aa  345  7e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.7 
 
 
346 aa  342  5e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4532  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.55 
 
 
499 aa  341  1e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1747  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.03 
 
 
346 aa  335  5e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.279205  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1396  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.03 
 
 
346 aa  335  5e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.711895  normal  0.199671 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0427  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.03 
 
 
346 aa  335  5e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.674473  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3762  putative transposase  52.84 
 
 
341 aa  333  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.915156 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.8 
 
 
343 aa  332  6e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437625  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2066  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.8 
 
 
343 aa  332  6e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.819245  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6580  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.2 
 
 
341 aa  325  9e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0128065  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0904  IS110 family transposase  46.57 
 
 
341 aa  323  3e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2286  IS110 family transposase  46.27 
 
 
341 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  hitchhiker  0.00653664 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44660  Transposase IS116/IS110/IS902  49.25 
 
 
338 aa  312  4.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09560  transposase IS116/IS110/IS902  49.25 
 
 
338 aa  312  4.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.927637  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30230  Transposase IS116/IS110/IS902  49.25 
 
 
338 aa  312  4.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13560  Transposase IS116/IS110/IS902  48.96 
 
 
338 aa  310  2.9999999999999997e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.682801  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35590  Transposase IS116/IS110/IS902  48.96 
 
 
338 aa  310  2.9999999999999997e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45790  Transposase IS116/IS110/IS902  48.96 
 
 
338 aa  310  2.9999999999999997e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.997681  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0993  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.8 
 
 
341 aa  305  6e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0995  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.8 
 
 
341 aa  305  6e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7434  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.33 
 
 
275 aa  299  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119711  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3083  transposase IS116/IS110/IS902  47.93 
 
 
343 aa  292  6e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7300  transposase  46.02 
 
 
341 aa  292  7e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.19933  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0643  ISAfe1, transposase  46.54 
 
 
322 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2714  hypothetical protein  46.33 
 
 
342 aa  281  1e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7698  IS1111A/IS1328/IS1533 family transposase  46.33 
 
 
342 aa  281  1e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.951148  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3664  hypothetical protein  44.61 
 
 
338 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000781858 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0079  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.61 
 
 
338 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0841  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.61 
 
 
338 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767297 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3666  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.61 
 
 
338 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0314805 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3805  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.31 
 
 
338 aa  279  4e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0222  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.51 
 
 
338 aa  278  8e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0137309  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1170  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.51 
 
 
338 aa  278  8e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.621929  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3161  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.51 
 
 
338 aa  278  8e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3976  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.51 
 
 
338 aa  278  8e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.015525  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3467  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.51 
 
 
338 aa  278  8e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1114  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.51 
 
 
338 aa  278  8e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0406  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.51 
 
 
338 aa  278  8e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4213  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.51 
 
 
338 aa  278  8e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0592  transposase IS116/IS110/IS902  43.11 
 
 
338 aa  278  9e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0881  transposase IS116/IS110/IS902  43.11 
 
 
338 aa  278  9e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1332  transposase IS116/IS110/IS902  43.11 
 
 
338 aa  278  9e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3445  transposase IS116/IS110/IS902  43.11 
 
 
338 aa  278  9e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7431  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.75 
 
 
338 aa  277  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1640  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.71 
 
 
338 aa  275  6e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000188647  unclonable  0.00000000000190741 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3359  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.4 
 
 
342 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0944  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.95 
 
 
338 aa  273  3e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0943  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.95 
 
 
338 aa  273  3e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1779  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.41 
 
 
338 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02906  probable transposase  42.39 
 
 
347 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.142425  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1138  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.47 
 
 
340 aa  269  5.9999999999999995e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.593308  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0802  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.05 
 
 
338 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.890178 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3701  hypothetical protein  43.98 
 
 
348 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.921253 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0735  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.98 
 
 
348 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4167  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.6 
 
 
332 aa  265  7e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1453  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.6 
 
 
332 aa  265  7e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2518  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.6 
 
 
332 aa  265  7e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4005  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.6 
 
 
332 aa  265  7e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2122  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.15 
 
 
337 aa  264  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0571042  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2204  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.15 
 
 
337 aa  264  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3170  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.19 
 
 
348 aa  263  3e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2806  transposase IS116/IS110/IS902  41.54 
 
 
337 aa  263  4e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3360  transposase IS116/IS110/IS902  41.54 
 
 
337 aa  263  4e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5032  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.27 
 
 
338 aa  263  4e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7630  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.2 
 
 
311 aa  263  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8105  IS1111A/IS1328/IS1533 family transposase  47.22 
 
 
298 aa  262  6e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162674  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3816  transposase IS116/IS110/IS902  41.99 
 
 
340 aa  261  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.531906  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6452  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.1 
 
 
340 aa  261  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.147811  normal  0.356209 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1017  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.5 
 
 
342 aa  261  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3160  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.5 
 
 
342 aa  261  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.622209  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3561  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.5 
 
 
342 aa  261  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0894579  normal  0.267688 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3844  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.5 
 
 
342 aa  261  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.464911  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0345  transposase IS116/IS110/IS902  41.62 
 
 
343 aa  260  3e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222608  normal  0.211948 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1921  transposase IS116/IS110/IS902  41.62 
 
 
343 aa  260  3e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.876079  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3076  transposase IS116/IS110/IS902  41.62 
 
 
343 aa  260  3e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2447  transposase IS116/IS110/IS902  41.62 
 
 
343 aa  259  4e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3074  transposase IS116/IS110/IS902  41.62 
 
 
343 aa  259  4e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4139  transposase IS116/IS110/IS902  41.54 
 
 
349 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0742  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.62 
 
 
350 aa  259  6e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.49 
 
 
345 aa  258  8e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.533752  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4127  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  53.31 
 
 
253 aa  258  8e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.177688  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0181  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.32 
 
 
350 aa  256  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6905  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.32 
 
 
350 aa  256  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0473  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.32 
 
 
350 aa  256  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6016  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.32 
 
 
350 aa  256  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186566  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0567  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.31 
 
 
341 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0767  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.31 
 
 
341 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2205  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.31 
 
 
341 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>