More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02906 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02906  probable transposase  100 
 
 
347 aa  717    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.142425  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.61 
 
 
343 aa  321  9.000000000000001e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437625  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2066  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.61 
 
 
343 aa  321  9.000000000000001e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.819245  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.8 
 
 
347 aa  319  3e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35590  Transposase IS116/IS110/IS902  47.63 
 
 
338 aa  318  1e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13560  Transposase IS116/IS110/IS902  47.63 
 
 
338 aa  318  1e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.682801  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45790  Transposase IS116/IS110/IS902  47.63 
 
 
338 aa  318  1e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.997681  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09560  transposase IS116/IS110/IS902  47.63 
 
 
338 aa  317  3e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.927637  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30230  Transposase IS116/IS110/IS902  47.63 
 
 
338 aa  317  3e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44660  Transposase IS116/IS110/IS902  47.48 
 
 
338 aa  313  1.9999999999999998e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2472  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.91 
 
 
344 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0943  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.49 
 
 
338 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0944  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.49 
 
 
338 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.9 
 
 
346 aa  311  9e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4532  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.73 
 
 
499 aa  310  2e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7431  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.61 
 
 
338 aa  295  8e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1138  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.37 
 
 
340 aa  295  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.593308  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7630  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.28 
 
 
311 aa  289  6e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1453  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.41 
 
 
332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2518  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.41 
 
 
332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4005  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.41 
 
 
332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4167  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.41 
 
 
332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4485  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.22 
 
 
356 aa  285  7e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.218146  hitchhiker  0.00890094 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3083  transposase IS116/IS110/IS902  43.36 
 
 
343 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0592  transposase IS116/IS110/IS902  43.28 
 
 
338 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0881  transposase IS116/IS110/IS902  43.28 
 
 
338 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1332  transposase IS116/IS110/IS902  43.28 
 
 
338 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3445  transposase IS116/IS110/IS902  43.28 
 
 
338 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4712  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.32 
 
 
356 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.401794  normal  0.40759 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2286  IS110 family transposase  40.06 
 
 
341 aa  280  3e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  hitchhiker  0.00653664 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0406  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.22 
 
 
338 aa  277  3e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0222  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.22 
 
 
338 aa  277  3e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0137309  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4213  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.22 
 
 
338 aa  277  3e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3976  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.22 
 
 
338 aa  277  3e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.015525  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1170  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.22 
 
 
338 aa  277  3e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.621929  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3161  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.22 
 
 
338 aa  277  3e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3467  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.22 
 
 
338 aa  277  3e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1114  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.22 
 
 
338 aa  277  3e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0904  IS110 family transposase  39.83 
 
 
341 aa  276  4e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0643  ISAfe1, transposase  43.12 
 
 
322 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01349  hypothetical protein  42.86 
 
 
341 aa  273  3e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1779  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.49 
 
 
338 aa  272  7e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0345  transposase IS116/IS110/IS902  41.52 
 
 
343 aa  272  8.000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222608  normal  0.211948 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1921  transposase IS116/IS110/IS902  41.52 
 
 
343 aa  272  8.000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.876079  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3076  transposase IS116/IS110/IS902  41.52 
 
 
343 aa  272  8.000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3805  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.09 
 
 
338 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3666  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.79 
 
 
338 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0314805 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02799  hypothetical protein  42.57 
 
 
341 aa  271  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03330  hypothetical protein  42.57 
 
 
341 aa  271  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02915  hypothetical protein  42.57 
 
 
341 aa  271  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03439  hypothetical protein  42.57 
 
 
341 aa  271  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05550  hypothetical protein  42.57 
 
 
341 aa  271  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05560  hypothetical protein  42.57 
 
 
341 aa  271  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01790  hypothetical protein  42.57 
 
 
341 aa  271  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01775  hypothetical protein  42.57 
 
 
341 aa  271  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01382  hypothetical protein  42.57 
 
 
341 aa  271  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0841  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.79 
 
 
338 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767297 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0079  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.79 
 
 
338 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01381  hypothetical protein  42.57 
 
 
341 aa  271  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00712  hypothetical protein  42.57 
 
 
341 aa  271  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00717  hypothetical protein  42.57 
 
 
341 aa  271  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00718  hypothetical protein  42.57 
 
 
341 aa  271  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01209  hypothetical protein  42.57 
 
 
341 aa  271  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00972  hypothetical protein  42.57 
 
 
341 aa  271  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01210  hypothetical protein  42.57 
 
 
341 aa  271  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00511  transposase  42.57 
 
 
341 aa  271  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2447  transposase IS116/IS110/IS902  40.94 
 
 
343 aa  269  4e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3074  transposase IS116/IS110/IS902  40.94 
 
 
343 aa  269  4e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3664  hypothetical protein  41.49 
 
 
338 aa  269  5e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000781858 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0993  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.01 
 
 
341 aa  269  7e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0995  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.01 
 
 
341 aa  269  7e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03475  hypothetical protein  42.27 
 
 
341 aa  268  8.999999999999999e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1640  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.49 
 
 
338 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000188647  unclonable  0.00000000000190741 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3183  ISAfe1, transposase  42.39 
 
 
342 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.487441  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2781  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.39 
 
 
342 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1569  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.39 
 
 
342 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000196029 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1895  ISAfe1, transposase  42.39 
 
 
342 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1571  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.39 
 
 
342 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000595927 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2845  transposase IS116/IS110/IS902  43.7 
 
 
355 aa  265  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.277268  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3009  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.03 
 
 
337 aa  262  6e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2273  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.03 
 
 
337 aa  262  6e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.508057 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1141  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.03 
 
 
337 aa  262  6e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0392691 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3552  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.03 
 
 
337 aa  262  6e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0928  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.03 
 
 
337 aa  262  6e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4139  transposase IS116/IS110/IS902  42.56 
 
 
349 aa  261  2e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1212  transposase IS116/IS110/IS902  42.82 
 
 
355 aa  260  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2806  transposase IS116/IS110/IS902  40.3 
 
 
337 aa  259  4e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3360  transposase IS116/IS110/IS902  40.3 
 
 
337 aa  259  4e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0372  ISPsy7, transposase  39.29 
 
 
340 aa  259  7e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2167  ISPsy7, transposase  39.29 
 
 
340 aa  259  7e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0378398  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2465  ISPsy7, transposase  39.29 
 
 
340 aa  259  7e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142037  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3146  ISPsy7, transposase  39.29 
 
 
340 aa  259  7e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0791519  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3325  ISPsy7, transposase  39.29 
 
 
340 aa  259  7e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0495526  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3746  ISPsy7, transposase  39.29 
 
 
340 aa  259  7e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26483  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3800  ISPsy7, transposase  39.29 
 
 
340 aa  259  7e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.561237  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5571  ISPsy7, transposase  39.29 
 
 
340 aa  259  7e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2657  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.69 
 
 
350 aa  259  7e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0268  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.69 
 
 
350 aa  259  7e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0803488 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09760  Transposase, IS111A/IS1328/IS1533  40.53 
 
 
346 aa  258  9e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2485  ISPsy7, transposase  39.29 
 
 
340 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00294179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>