More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1212 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1212  transposase IS116/IS110/IS902  100 
 
 
355 aa  721    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2845  transposase IS116/IS110/IS902  93.79 
 
 
355 aa  681    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.277268  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4485  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  73.45 
 
 
356 aa  543  1e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.218146  hitchhiker  0.00890094 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4712  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  71.19 
 
 
356 aa  528  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.401794  normal  0.40759 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0384  putative transposase  72.46 
 
 
365 aa  521  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0381  putative transposase  72.46 
 
 
365 aa  521  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0375  putative transposase  72.07 
 
 
345 aa  501  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1395  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  69.3 
 
 
355 aa  496  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.688347  normal  0.139029 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0426  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  69.3 
 
 
355 aa  496  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.509366  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1748  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  69.3 
 
 
355 aa  496  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4642  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  68.21 
 
 
318 aa  427  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.882664  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0993  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.4 
 
 
341 aa  313  3.9999999999999997e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0995  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.4 
 
 
341 aa  313  3.9999999999999997e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.18 
 
 
343 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437625  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2066  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.18 
 
 
343 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.819245  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2472  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.4 
 
 
344 aa  308  6.999999999999999e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.61 
 
 
346 aa  301  8.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4532  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.15 
 
 
499 aa  301  1e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.96 
 
 
347 aa  298  9e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4711  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.66 
 
 
338 aa  292  7e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.266875 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0114  IS110 family transposase  45.7 
 
 
340 aa  288  7e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  4.57339e-19  hitchhiker  1.5997e-89 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7431  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.64 
 
 
338 aa  286  5e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35590  Transposase IS116/IS110/IS902  46.75 
 
 
338 aa  286  5.999999999999999e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45790  Transposase IS116/IS110/IS902  46.75 
 
 
338 aa  286  5.999999999999999e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.997681  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13560  Transposase IS116/IS110/IS902  46.75 
 
 
338 aa  286  5.999999999999999e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.682801  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3083  transposase IS116/IS110/IS902  45.02 
 
 
343 aa  285  8e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44660  Transposase IS116/IS110/IS902  46.75 
 
 
338 aa  285  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30230  Transposase IS116/IS110/IS902  46.75 
 
 
338 aa  285  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09560  transposase IS116/IS110/IS902  46.75 
 
 
338 aa  285  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.927637  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0006  ISShdy1, transposase  45.92 
 
 
338 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0989062  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1372  IS111A/IS1328/IS1533  47.34 
 
 
341 aa  282  5.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0161177 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2041  transposase IS116/IS110/IS902  47.04 
 
 
341 aa  281  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1138  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.77 
 
 
338 aa  280  3e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1637  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.77 
 
 
338 aa  280  3e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.571197  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3434  transposase IS116/IS110/IS902  46.75 
 
 
341 aa  280  4e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5572  transposase IS116/IS110/IS902  45.99 
 
 
338 aa  279  4e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3161  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.77 
 
 
338 aa  277  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1170  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.77 
 
 
338 aa  277  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.621929  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4213  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.77 
 
 
338 aa  277  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1114  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.77 
 
 
338 aa  277  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0406  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.77 
 
 
338 aa  277  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3976  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.77 
 
 
338 aa  277  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.015525  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3467  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.77 
 
 
338 aa  277  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0222  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.77 
 
 
338 aa  277  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0137309  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3118  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.26 
 
 
338 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0592  transposase IS116/IS110/IS902  40.95 
 
 
338 aa  272  6e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0881  transposase IS116/IS110/IS902  40.95 
 
 
338 aa  272  6e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1332  transposase IS116/IS110/IS902  40.95 
 
 
338 aa  272  6e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3445  transposase IS116/IS110/IS902  40.95 
 
 
338 aa  272  6e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3664  hypothetical protein  39.7 
 
 
338 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000781858 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1779  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.58 
 
 
338 aa  268  8e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3666  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.7 
 
 
338 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0314805 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0079  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.7 
 
 
338 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0841  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.7 
 
 
338 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767297 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0643  ISAfe1, transposase  44.1 
 
 
322 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4956  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.1 
 
 
341 aa  267  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.440622  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3805  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.39 
 
 
338 aa  266  5e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0488  putative transposase IS116/IS110/IS902  46.29 
 
 
341 aa  266  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.296532  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3943  transposase IS116/IS110/IS902  41.42 
 
 
338 aa  265  8e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.147214  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2806  transposase IS116/IS110/IS902  41 
 
 
337 aa  263  2e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3360  transposase IS116/IS110/IS902  41 
 
 
337 aa  263  2e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7630  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.84 
 
 
311 aa  263  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1640  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.79 
 
 
338 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000188647  unclonable  0.00000000000190741 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2286  IS110 family transposase  39.02 
 
 
341 aa  258  2e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  hitchhiker  0.00653664 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1138  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.91 
 
 
340 aa  256  5e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.593308  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0943  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.05 
 
 
338 aa  255  9e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0944  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.05 
 
 
338 aa  255  9e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0904  IS110 family transposase  38.55 
 
 
341 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02906  probable transposase  42.82 
 
 
347 aa  250  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.142425  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3359  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.81 
 
 
342 aa  248  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2122  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.83 
 
 
337 aa  245  8e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0571042  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2204  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.83 
 
 
337 aa  245  8e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4167  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.06 
 
 
332 aa  243  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1453  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.06 
 
 
332 aa  243  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4005  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.06 
 
 
332 aa  243  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2518  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.06 
 
 
332 aa  243  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0742  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.79 
 
 
350 aa  243  5e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0399  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.98 
 
 
347 aa  243  5e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2644  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.98 
 
 
347 aa  243  5e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0103758  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3770  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.98 
 
 
347 aa  243  5e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0590738  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0473  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.51 
 
 
350 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0181  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.51 
 
 
350 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0345  transposase IS116/IS110/IS902  38.53 
 
 
343 aa  240  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222608  normal  0.211948 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1921  transposase IS116/IS110/IS902  38.53 
 
 
343 aa  240  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.876079  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3076  transposase IS116/IS110/IS902  38.53 
 
 
343 aa  240  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6905  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.51 
 
 
350 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6016  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.51 
 
 
350 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186566  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0377  ISCps1, transposase  38.82 
 
 
342 aa  240  2.9999999999999997e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.417861  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6452  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.94 
 
 
340 aa  239  5e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.147811  normal  0.356209 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2447  transposase IS116/IS110/IS902  38.24 
 
 
343 aa  238  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3074  transposase IS116/IS110/IS902  38.24 
 
 
343 aa  238  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0524  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.28 
 
 
302 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0802  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.4 
 
 
338 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.890178 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1983  transposase for insertion sequence element IS1111A  39.3 
 
 
339 aa  236  3e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1976  transposase for insertion sequence element IS1111A  39.3 
 
 
339 aa  236  3e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.629494  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1963  transposase for insertion sequence element IS1111A  39.3 
 
 
339 aa  236  3e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0854  transposase for insertion sequence element IS1111A  39.3 
 
 
339 aa  236  3e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00143492  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0714  transposase for insertion sequence element IS1111A  39.3 
 
 
339 aa  236  3e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0847  transposase for insertion sequence element IS1111A  39.3 
 
 
339 aa  236  3e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000936051  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1406  transposase for insertion sequence element IS1111A  39.3 
 
 
339 aa  236  3e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000279792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>