More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5032 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5032  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
338 aa  669    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0802  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  67.06 
 
 
338 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.890178 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3359  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  57.69 
 
 
342 aa  366  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6452  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  57.78 
 
 
340 aa  366  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.147811  normal  0.356209 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3701  hypothetical protein  57.1 
 
 
348 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.921253 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0735  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  57.1 
 
 
348 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7300  transposase  56.89 
 
 
341 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.19933  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3936  transposase IS116/IS110/IS902  51.03 
 
 
343 aa  346  4e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1959  transposase IS116/IS110/IS902  49.56 
 
 
343 aa  342  5.999999999999999e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0109  transposase IS116/IS110/IS902  49.85 
 
 
343 aa  341  1e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250227  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0132  transposase IS116/IS110/IS902  49.85 
 
 
343 aa  341  1e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.020989  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2306  transposase IS116/IS110/IS902  49.85 
 
 
343 aa  341  1e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2934  transposase IS116/IS110/IS902  49.85 
 
 
343 aa  341  1e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3007  transposase IS116/IS110/IS902  49.85 
 
 
343 aa  341  1e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.107293  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3682  transposase IS116/IS110/IS902  49.85 
 
 
343 aa  341  1e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2714  hypothetical protein  53.75 
 
 
342 aa  334  1e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7698  IS1111A/IS1328/IS1533 family transposase  53.75 
 
 
342 aa  334  1e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.951148  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3955  transposase IS116/IS110/IS902  54.57 
 
 
342 aa  332  4e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2571  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.92 
 
 
346 aa  332  5e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2401  transposase IS110 family protein  49.85 
 
 
343 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8798  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.1 
 
 
341 aa  330  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8105  IS1111A/IS1328/IS1533 family transposase  56.12 
 
 
298 aa  330  2e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162674  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0808  transposase IS116/IS110/IS902  53.98 
 
 
342 aa  329  4e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.586145  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3939  transposase IS116/IS110/IS902  51.92 
 
 
341 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5594  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.78 
 
 
340 aa  324  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8011  transposase protein  60.42 
 
 
285 aa  322  5e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0203844  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4532  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.3 
 
 
499 aa  320  1.9999999999999998e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.37 
 
 
347 aa  318  7.999999999999999e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.9 
 
 
346 aa  316  5e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8455  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.66 
 
 
333 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3170  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.31 
 
 
348 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1017  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.18 
 
 
342 aa  313  3.9999999999999997e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3160  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.18 
 
 
342 aa  313  3.9999999999999997e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.622209  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3561  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.18 
 
 
342 aa  313  3.9999999999999997e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0894579  normal  0.267688 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3844  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.18 
 
 
342 aa  313  3.9999999999999997e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.464911  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0904  IS110 family transposase  46.27 
 
 
341 aa  308  9e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2286  IS110 family transposase  46.59 
 
 
341 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  hitchhiker  0.00653664 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2472  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.81 
 
 
344 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0965  transposase IS116/IS110/IS902  50 
 
 
346 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991458 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1574  transposase IS116/IS110/IS902  50 
 
 
346 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00168491 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1966  transposase IS116/IS110/IS902  50 
 
 
346 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2010  transposase IS116/IS110/IS902  50 
 
 
346 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.657114  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2061  transposase IS116/IS110/IS902  50 
 
 
346 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.232183  normal  0.150463 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2092  transposase IS116/IS110/IS902  50 
 
 
346 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.854494 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3124  transposase IS116/IS110/IS902  50 
 
 
346 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3160  transposase IS116/IS110/IS902  50 
 
 
346 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0233772  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3275  transposase IS116/IS110/IS902  50 
 
 
346 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.145129  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3642  transposase IS116/IS110/IS902  50 
 
 
346 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.404408  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4440  transposase IS116/IS110/IS902  50 
 
 
346 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4622  transposase IS116/IS110/IS902  50 
 
 
346 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3156  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.11 
 
 
338 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44660  Transposase IS116/IS110/IS902  48.51 
 
 
338 aa  303  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09560  transposase IS116/IS110/IS902  48.51 
 
 
338 aa  303  4.0000000000000003e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.927637  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1999  transposase IS116/IS110/IS902  50.15 
 
 
342 aa  302  4.0000000000000003e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3769  transposase IS116/IS110/IS902  50.15 
 
 
342 aa  302  4.0000000000000003e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153925  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30230  Transposase IS116/IS110/IS902  48.51 
 
 
338 aa  303  4.0000000000000003e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35590  Transposase IS116/IS110/IS902  48.21 
 
 
338 aa  300  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45790  Transposase IS116/IS110/IS902  48.21 
 
 
338 aa  300  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.997681  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13560  Transposase IS116/IS110/IS902  48.21 
 
 
338 aa  300  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.682801  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2066  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.65 
 
 
343 aa  299  5e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.819245  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.65 
 
 
343 aa  299  5e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437625  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0742  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.01 
 
 
350 aa  298  7e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0993  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.1 
 
 
341 aa  297  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0995  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.1 
 
 
341 aa  297  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0181  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.01 
 
 
350 aa  296  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6905  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.01 
 
 
350 aa  296  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6016  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.01 
 
 
350 aa  296  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186566  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0473  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.01 
 
 
350 aa  296  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0803  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.55 
 
 
340 aa  289  6e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3216  transposase IS116/IS110/IS902  47.35 
 
 
385 aa  286  2.9999999999999996e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118777  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3083  transposase IS116/IS110/IS902  47.63 
 
 
343 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3664  hypothetical protein  41.96 
 
 
338 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000781858 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4167  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.78 
 
 
332 aa  276  5e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4005  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.78 
 
 
332 aa  276  5e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1453  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.78 
 
 
332 aa  276  5e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2518  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.78 
 
 
332 aa  276  5e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1779  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.67 
 
 
338 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0079  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.14 
 
 
338 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3666  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.14 
 
 
338 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0314805 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0841  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.14 
 
 
338 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767297 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3805  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.84 
 
 
338 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1895  ISAfe1, transposase  46.27 
 
 
342 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3183  ISAfe1, transposase  46.27 
 
 
342 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.487441  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1640  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.84 
 
 
338 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000188647  unclonable  0.00000000000190741 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1571  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.27 
 
 
342 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000595927 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1569  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.27 
 
 
342 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000196029 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2781  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.27 
 
 
342 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4485  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.07 
 
 
356 aa  268  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.218146  hitchhiker  0.00890094 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3467  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.02 
 
 
338 aa  267  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4213  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.02 
 
 
338 aa  267  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3976  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.02 
 
 
338 aa  267  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.015525  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0406  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.02 
 
 
338 aa  267  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0222  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.02 
 
 
338 aa  267  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0137309  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1114  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.02 
 
 
338 aa  267  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3161  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.02 
 
 
338 aa  267  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1170  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.02 
 
 
338 aa  267  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.621929  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18390  Transposase IS116/IS110/IS902 family  45.48 
 
 
341 aa  267  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0592  transposase IS116/IS110/IS902  41.49 
 
 
338 aa  265  7e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0881  transposase IS116/IS110/IS902  41.49 
 
 
338 aa  265  7e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1332  transposase IS116/IS110/IS902  41.49 
 
 
338 aa  265  7e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>