More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8798 on replicon NC_011893
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011892  Mnod_8455  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  99.4 
 
 
333 aa  658    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8798  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
341 aa  676    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3939  transposase IS116/IS110/IS902  68.91 
 
 
341 aa  472  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0808  transposase IS116/IS110/IS902  67.74 
 
 
342 aa  448  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.586145  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3955  transposase IS116/IS110/IS902  68.04 
 
 
342 aa  451  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5594  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  64.12 
 
 
340 aa  426  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3170  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  62.18 
 
 
348 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1017  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  58.06 
 
 
342 aa  407  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3160  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  58.06 
 
 
342 aa  407  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.622209  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3561  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  58.06 
 
 
342 aa  407  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0894579  normal  0.267688 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3844  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  58.06 
 
 
342 aa  407  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.464911  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0803  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  56.38 
 
 
340 aa  358  9e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0109  transposase IS116/IS110/IS902  51.18 
 
 
343 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250227  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0132  transposase IS116/IS110/IS902  51.18 
 
 
343 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.020989  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1959  transposase IS116/IS110/IS902  50.88 
 
 
343 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2306  transposase IS116/IS110/IS902  51.18 
 
 
343 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2934  transposase IS116/IS110/IS902  51.18 
 
 
343 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3007  transposase IS116/IS110/IS902  51.18 
 
 
343 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.107293  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3682  transposase IS116/IS110/IS902  51.18 
 
 
343 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3936  transposase IS116/IS110/IS902  50.29 
 
 
343 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2401  transposase IS110 family protein  51.62 
 
 
343 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6452  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.44 
 
 
340 aa  332  5e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.147811  normal  0.356209 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0802  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.78 
 
 
338 aa  329  4e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.890178 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5032  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.1 
 
 
338 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2571  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.5 
 
 
346 aa  324  1e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3359  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.41 
 
 
342 aa  324  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0464  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.58 
 
 
332 aa  319  3.9999999999999996e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.18015  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7300  transposase  46.73 
 
 
341 aa  317  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.19933  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7698  IS1111A/IS1328/IS1533 family transposase  48.05 
 
 
342 aa  312  4.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.951148  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2714  hypothetical protein  48.05 
 
 
342 aa  312  4.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3701  hypothetical protein  48.39 
 
 
348 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.921253 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0735  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.39 
 
 
348 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4518  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.36 
 
 
337 aa  301  8.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44660  Transposase IS116/IS110/IS902  45.97 
 
 
338 aa  300  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0965  transposase IS116/IS110/IS902  47.16 
 
 
346 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991458 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1574  transposase IS116/IS110/IS902  47.16 
 
 
346 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00168491 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1966  transposase IS116/IS110/IS902  47.16 
 
 
346 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2010  transposase IS116/IS110/IS902  47.16 
 
 
346 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.657114  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2061  transposase IS116/IS110/IS902  47.16 
 
 
346 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.232183  normal  0.150463 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2092  transposase IS116/IS110/IS902  47.16 
 
 
346 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.854494 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3124  transposase IS116/IS110/IS902  47.16 
 
 
346 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3160  transposase IS116/IS110/IS902  47.16 
 
 
346 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0233772  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3275  transposase IS116/IS110/IS902  47.16 
 
 
346 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.145129  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3642  transposase IS116/IS110/IS902  47.16 
 
 
346 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.404408  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4440  transposase IS116/IS110/IS902  47.16 
 
 
346 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4622  transposase IS116/IS110/IS902  47.16 
 
 
346 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30230  Transposase IS116/IS110/IS902  45.97 
 
 
338 aa  300  3e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09560  transposase IS116/IS110/IS902  45.97 
 
 
338 aa  300  3e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.927637  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35590  Transposase IS116/IS110/IS902  45.67 
 
 
338 aa  297  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45790  Transposase IS116/IS110/IS902  45.67 
 
 
338 aa  297  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.997681  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13560  Transposase IS116/IS110/IS902  45.67 
 
 
338 aa  297  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.682801  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.35 
 
 
346 aa  298  1e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0742  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.87 
 
 
350 aa  293  3e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1999  transposase IS116/IS110/IS902  45.81 
 
 
342 aa  291  7e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3769  transposase IS116/IS110/IS902  45.81 
 
 
342 aa  291  7e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153925  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0473  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.87 
 
 
350 aa  291  8e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0181  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.87 
 
 
350 aa  291  8e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6016  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.87 
 
 
350 aa  291  8e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186566  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6905  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.87 
 
 
350 aa  291  8e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.74 
 
 
347 aa  290  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4532  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.65 
 
 
499 aa  289  4e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2472  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.94 
 
 
344 aa  288  1e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3156  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.9 
 
 
338 aa  288  1e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3216  transposase IS116/IS110/IS902  46.22 
 
 
385 aa  286  4e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118777  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8011  transposase protein  52.11 
 
 
285 aa  285  9e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0203844  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2066  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.14 
 
 
343 aa  281  9e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.819245  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.14 
 
 
343 aa  281  9e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437625  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8105  IS1111A/IS1328/IS1533 family transposase  48.62 
 
 
298 aa  279  6e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162674  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0993  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.37 
 
 
341 aa  276  3e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0995  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.37 
 
 
341 aa  276  3e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0904  IS110 family transposase  40.9 
 
 
341 aa  276  5e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3816  transposase IS116/IS110/IS902  40.29 
 
 
340 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.531906  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2286  IS110 family transposase  40 
 
 
341 aa  268  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  hitchhiker  0.00653664 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5872  transposase IS116/IS110/IS902  43.15 
 
 
341 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0505  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.15 
 
 
341 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0567  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.15 
 
 
341 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0767  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.15 
 
 
341 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2205  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.15 
 
 
341 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2966  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.15 
 
 
341 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220936  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3595  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.91 
 
 
315 aa  265  7e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.917263  normal  0.896237 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3083  transposase IS116/IS110/IS902  43.06 
 
 
343 aa  265  1e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1453  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.32 
 
 
332 aa  263  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4167  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.32 
 
 
332 aa  263  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2518  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.32 
 
 
332 aa  263  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4005  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.32 
 
 
332 aa  263  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0834  transposase IS116/IS110/IS902  43.66 
 
 
343 aa  260  3e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220678  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7431  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.19 
 
 
338 aa  256  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6180  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.97 
 
 
336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.626192  hitchhiker  0.00140825 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09760  Transposase, IS111A/IS1328/IS1533  41.84 
 
 
346 aa  254  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3183  ISAfe1, transposase  43.84 
 
 
342 aa  249  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.487441  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2781  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.84 
 
 
342 aa  249  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1895  ISAfe1, transposase  43.84 
 
 
342 aa  249  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1571  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.84 
 
 
342 aa  249  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000595927 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1569  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.84 
 
 
342 aa  249  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000196029 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0114  IS110 family transposase  38.99 
 
 
340 aa  249  6e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  4.57339e-19  hitchhiker  1.5997e-89 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2465  ISPsy7, transposase  40.24 
 
 
340 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142037  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3325  ISPsy7, transposase  40.24 
 
 
340 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0495526  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3746  ISPsy7, transposase  40.24 
 
 
340 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26483  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3800  ISPsy7, transposase  40.24 
 
 
340 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.561237  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5571  ISPsy7, transposase  40.24 
 
 
340 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>