More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0375 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0384  putative transposase  100 
 
 		 365 aa  699    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0375  putative transposase  100 
 
 		 345 aa  698    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0381  putative transposase  100 
 
 		 365 aa  699    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2845  transposase IS116/IS110/IS902  71.18 
 
 		 355 aa  504  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.277268  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1212  transposase IS116/IS110/IS902  72.07 
 
 		 355 aa  501  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4485  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  66.47 
 
 		 356 aa  479  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.218146  hitchhiker  0.00890094 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0426  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  65.28 
 
 		 355 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.509366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4712  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  64.71 
 
 		 356 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.401794  normal  0.40759 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1748  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  65.28 
 
 		 355 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1395  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  65.28 
 
 		 355 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.688347  normal  0.139029 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4642  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  63.89 
 
 		 318 aa  386  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.882664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.81 
 
 		 346 aa  306  5.0000000000000004e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4532  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.92 
 
 		 499 aa  300  3e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0993  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.07 
 
 		 341 aa  300  3e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0995  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.07 
 
 		 341 aa  300  3e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0114  IS110 family transposase  47.68 
 
 		 340 aa  298  8e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  4.57339e-19  hitchhiker  1.5997e-89 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2472  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.08 
 
 		 344 aa  296  3e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44660  Transposase IS116/IS110/IS902  50 
 
 		 338 aa  295  7e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09560  transposase IS116/IS110/IS902  50 
 
 		 338 aa  295  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.927637  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30230  Transposase IS116/IS110/IS902  50 
 
 		 338 aa  295  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35590  Transposase IS116/IS110/IS902  50 
 
 		 338 aa  293  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45790  Transposase IS116/IS110/IS902  50 
 
 		 338 aa  293  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.997681  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13560  Transposase IS116/IS110/IS902  50 
 
 		 338 aa  293  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.682801  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2066  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.92 
 
 		 343 aa  292  7e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.819245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.92 
 
 		 343 aa  292  7e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.81 
 
 		 347 aa  292  7e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4711  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.54 
 
 		 338 aa  288  1e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.266875 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1372  IS111A/IS1328/IS1533  48.61 
 
 		 341 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0161177 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2041  transposase IS116/IS110/IS902  48.61 
 
 		 341 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3434  transposase IS116/IS110/IS902  48.3 
 
 		 341 aa  281  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5572  transposase IS116/IS110/IS902  47.68 
 
 		 338 aa  280  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1637  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.61 
 
 		 338 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.571197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1138  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.61 
 
 		 338 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1170  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.86 
 
 		 338 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.621929  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1114  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.86 
 
 		 338 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3161  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.86 
 
 		 338 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0406  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.86 
 
 		 338 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4213  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.86 
 
 		 338 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3467  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.86 
 
 		 338 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3976  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.86 
 
 		 338 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.015525  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0222  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.86 
 
 		 338 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0137309  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0592  transposase IS116/IS110/IS902  42.86 
 
 		 338 aa  271  1e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0881  transposase IS116/IS110/IS902  42.86 
 
 		 338 aa  271  1e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1332  transposase IS116/IS110/IS902  42.86 
 
 		 338 aa  271  1e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3445  transposase IS116/IS110/IS902  42.86 
 
 		 338 aa  271  1e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3083  transposase IS116/IS110/IS902  46.08 
 
 		 343 aa  271  1e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3664  hypothetical protein  40.75 
 
 		 338 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000781858 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1779  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.44 
 
 		 338 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0841  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.75 
 
 		 338 aa  268  7e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000767297 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0079  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.75 
 
 		 338 aa  268  7e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3666  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.75 
 
 		 338 aa  268  7e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0314805 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4956  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.5 
 
 		 341 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.440622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0006  ISShdy1, transposase  47.32 
 
 		 338 aa  268  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0989062  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7431  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.14 
 
 		 338 aa  267  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3805  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.44 
 
 		 338 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1640  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.13 
 
 		 338 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000188647  unclonable  0.00000000000190741 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0643  ISAfe1, transposase  43.79 
 
 		 322 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7630  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.05 
 
 		 311 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0488  putative transposase IS116/IS110/IS902  47.06 
 
 		 341 aa  257  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.296532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0524  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.19 
 
 		 302 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3118  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.36 
 
 		 338 aa  251  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2286  IS110 family transposase  41.46 
 
 		 341 aa  249  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  hitchhiker  0.00653664 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0904  IS110 family transposase  41.46 
 
 		 341 aa  247  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0944  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.37 
 
 		 338 aa  245  6e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0943  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.37 
 
 		 338 aa  245  6e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3943  transposase IS116/IS110/IS902  40.5 
 
 		 338 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.147214  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3359  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.55 
 
 		 342 aa  243  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1138  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.37 
 
 		 340 aa  241  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.593308  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2806  transposase IS116/IS110/IS902  39.45 
 
 		 337 aa  241  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3360  transposase IS116/IS110/IS902  39.45 
 
 		 337 aa  241  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2518  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.59 
 
 		 332 aa  236  4e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4005  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.59 
 
 		 332 aa  236  4e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4167  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.59 
 
 		 332 aa  236  4e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1453  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.59 
 
 		 332 aa  236  4e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3816  transposase IS116/IS110/IS902  40.31 
 
 		 340 aa  233  5e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.531906  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2465  ISPsy7, transposase  39.32 
 
 		 340 aa  230  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142037  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6452  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.22 
 
 		 340 aa  230  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.147811  normal  0.356209 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02906  probable transposase  38.07 
 
 		 347 aa  229  7e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.142425  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0372  ISPsy7, transposase  39.01 
 
 		 340 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2167  ISPsy7, transposase  39.01 
 
 		 340 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0378398  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3146  ISPsy7, transposase  39.01 
 
 		 340 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0791519  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3325  ISPsy7, transposase  39.01 
 
 		 340 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0495526  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3746  ISPsy7, transposase  39.01 
 
 		 340 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26483  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3800  ISPsy7, transposase  39.01 
 
 		 340 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.561237  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5571  ISPsy7, transposase  39.01 
 
 		 340 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3216  transposase IS116/IS110/IS902  39.81 
 
 		 385 aa  228  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0345  transposase IS116/IS110/IS902  40 
 
 		 343 aa  227  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222608  normal  0.211948 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1921  transposase IS116/IS110/IS902  40 
 
 		 343 aa  227  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.876079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3076  transposase IS116/IS110/IS902  40 
 
 		 343 aa  227  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2485  ISPsy7, transposase  38.7 
 
 		 340 aa  227  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00294179  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2122  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.57 
 
 		 337 aa  226  3e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0571042  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2204  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.57 
 
 		 337 aa  226  3e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7698  IS1111A/IS1328/IS1533 family transposase  41.57 
 
 		 342 aa  226  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.951148  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2714  hypothetical protein  41.57 
 
 		 342 aa  226  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0668  transposase for insertion sequence element IS1111A  40.98 
 
 		 339 aa  226  5.0000000000000005e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119665  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0636  transposase for insertion sequence element IS1111A  40.98 
 
 		 339 aa  226  5.0000000000000005e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.596694  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0733  transposase for insertion sequence element IS1111A  40.98 
 
 		 339 aa  226  5.0000000000000005e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.231607  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0714  transposase for insertion sequence element IS1111A  40.98 
 
 		 339 aa  226  5.0000000000000005e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0555  transposase for insertion sequence element IS1111A  40.98 
 
 		 339 aa  226  5.0000000000000005e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016494  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1778  transposase for insertion sequence element IS1111A  40.98 
 
 		 339 aa  226  5.0000000000000005e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.459014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>