More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2759 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2759  transposase (class II)  100 
 
 		 174 aa  344  5e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.195506  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1747  transposase IS4 family protein  61.96 
 
 		 359 aa  205  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.25501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4812  transposase IS4 family protein  55.76 
 
 		 363 aa  186  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5109  IS4 family transposase  57.49 
 
 		 358 aa  183  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0975401  normal  0.0840327 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2457  transposase IS4 family protein  52.5 
 
 		 338 aa  170  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000063174  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2638  transposase IS4 family protein  52.5 
 
 		 338 aa  170  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0500483  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3091  transposase IS4 family protein  52.5 
 
 		 338 aa  170  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0222  transposase IS4 family protein  47.59 
 
 		 348 aa  151  2.9999999999999998e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0712  transposase IS4 family protein  47.27 
 
 		 352 aa  149  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0829  transposase IS4 family protein  47.27 
 
 		 352 aa  149  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0147  IS5 family transposase  48.15 
 
 		 316 aa  145  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5319  transposase IS4 family protein  43.29 
 
 		 353 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.316405 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2450  transposase IS4 family protein  43.64 
 
 		 348 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.348584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2324  transposase IS4 family protein  43.64 
 
 		 348 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.552067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1665  transposase IS4 family protein  46.41 
 
 		 367 aa  139  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.114037  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1361  transposase IS4 family protein  43.03 
 
 		 240 aa  137  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.873798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1196  IS5 family transposase  42.42 
 
 		 334 aa  134  6.0000000000000005e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.107807  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24710  Transposase, IS4  43.48 
 
 		 335 aa  129  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49770  IS4 family transposase  42.24 
 
 		 335 aa  125  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36450  Transposase, IS4  42.24 
 
 		 335 aa  125  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16640  Transposase, IS4  42.24 
 
 		 335 aa  125  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24660  Transposase, IS4  42.24 
 
 		 335 aa  125  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26840  Transposase, IS4  42.24 
 
 		 335 aa  125  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0396  transposase IS116/IS110/IS902  47.97 
 
 		 370 aa  117  9e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.29591 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0955  transposase IS4 family protein  40.88 
 
 		 360 aa  115  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3123  transposase IS4 family protein  40.88 
 
 		 360 aa  115  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0318  transposase IS4 family protein  37.09 
 
 		 314 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.356657  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0260  transposase IS4 family protein  37.67 
 
 		 345 aa  108  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0337  transposase IS4 family protein  37.67 
 
 		 345 aa  108  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0479  transposase IS4 family protein  35.33 
 
 		 345 aa  103  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1943  transposase IS4 family protein  35.33 
 
 		 345 aa  103  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0044381  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1923  transposase, IS4  34.48 
 
 		 313 aa  91.3  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1639  transposase, IS4  34.48 
 
 		 313 aa  91.3  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0785  transposase, IS4  34.48 
 
 		 313 aa  91.3  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2019  transposase, IS4  34.48 
 
 		 313 aa  91.3  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2160  transposase, IS4  34.48 
 
 		 313 aa  91.3  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2137  transposase, IS4  34.48 
 
 		 313 aa  91.3  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1446  transposase, IS4  34.48 
 
 		 313 aa  91.3  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2442  transposase, IS4  34.48 
 
 		 313 aa  91.3  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2173  transposase, IS4  34.48 
 
 		 313 aa  91.3  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.460433  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1279  transposase, IS4  34.48 
 
 		 313 aa  91.3  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0131  transposase, IS4  34.48 
 
 		 313 aa  91.3  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0566  transposase, IS4  34.48 
 
 		 313 aa  91.3  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0132  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0567  transposase, IS4  34.48 
 
 		 313 aa  91.3  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.330478  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0584  transposase, IS4  34.48 
 
 		 313 aa  91.3  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.810717  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2971  IS1246 transposase  42.86 
 
 		 280 aa  90.9  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0918  transposase, IS4  33.79 
 
 		 313 aa  88.6  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0912  transposase, IS4  33.79 
 
 		 313 aa  88.6  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.216188  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1991  transposase, IS4  33.79 
 
 		 313 aa  88.6  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0398  transposase, IS4  33.79 
 
 		 313 aa  88.6  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.3293  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0756  transposase, IS4  33.79 
 
 		 313 aa  88.6  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.443512  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0826  transposase, IS4  35.11 
 
 		 320 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.33945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0216  transposase, IS4  35.11 
 
 		 320 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4411  transposase, IS4  35.11 
 
 		 320 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.434109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0213  transposase, IS4  35.11 
 
 		 320 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0925745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0078  transposase, IS4  35.11 
 
 		 320 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.512756  normal  0.0332159 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4989  transposase IS4 family protein  34.35 
 
 		 320 aa  81.3  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1226  transposase, IS4  35.11 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0460  ISPg1, transposase  33.33 
 
 		 361 aa  79.3  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.835664 
 
 
-
 
NC_002950  PG0549  ISPg1, transposase  33.33 
 
 		 361 aa  79.3  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1244  ISPg1, transposase  33.33 
 
 		 361 aa  79.3  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0184  ISPg1, transposase  33.33 
 
 		 361 aa  78.2  0.00000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0825  ISPg1, transposase  33.33 
 
 		 361 aa  78.2  0.00000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1031  ISPg1, transposase  33.33 
 
 		 361 aa  78.2  0.00000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000307461 
 
 
-
 
NC_002950  PG1177  ISPg1, transposase  33.33 
 
 		 361 aa  78.2  0.00000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1197  ISPg1, transposase  33.33 
 
 		 361 aa  78.2  0.00000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_002950  PG1448  ISPg1, transposase  33.33 
 
 		 361 aa  78.2  0.00000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1624  ISPg1, transposase  33.33 
 
 		 361 aa  78.2  0.00000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1906  ISPg1, transposase  33.33 
 
 		 361 aa  78.2  0.00000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4261  transposase, IS4  35.07 
 
 		 349 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0257321  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4149  transposase, IS4  34.53 
 
 		 358 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4041  transposase, IS4  34.53 
 
 		 445 aa  72.4  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.923218  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4268  transposase, IS4  33.81 
 
 		 330 aa  72.4  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.45537  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1042  transposase, IS4 family protein  34.11 
 
 		 317 aa  70.9  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.077617  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1714  transposase IS4 family protein  34.11 
 
 		 317 aa  70.9  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1156  transposase, IS4 family protein  34.11 
 
 		 317 aa  70.9  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2847  transposase IS4 family protein  34.11 
 
 		 317 aa  70.9  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3223  IS52, transposase  34.27 
 
 		 325 aa  70.9  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.199078  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3528  IS52, transposase  34.27 
 
 		 325 aa  70.9  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.418337  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4725  IS52, transposase  34.27 
 
 		 325 aa  70.9  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2276  transposase, IS4  33.85 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3838  transposase, IS4 family protein  31.01 
 
 		 326 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000231978 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1561  transposase IS4 family protein  31.21 
 
 		 321 aa  68.2  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  0.983286 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1110  transposase IS4 family protein  31.21 
 
 		 321 aa  68.2  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0076  transposase IS4 family protein  31.21 
 
 		 321 aa  68.2  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0258707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0714  hypothetical protein  32 
 
 		 216 aa  67.8  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.76992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0947  IS5 transposase  31.01 
 
 		 326 aa  67.8  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1320  ISPg1, transposase, internal deletion  32.06 
 
 		 211 aa  67.8  0.00000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0800  IS5 transposase  31.01 
 
 		 326 aa  67.8  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0569  IS5 transposase  31.01 
 
 		 326 aa  67.8  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1557  transposase, IS4 family protein  34.06 
 
 		 320 aa  67.4  0.00000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2494  transposase, IS4 family protein  34.06 
 
 		 320 aa  67.4  0.00000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0455823  decreased coverage  0.00299337 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5567  transposase IS4 family protein  33.08 
 
 		 330 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.60838 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5692  transposase IS4 family protein  33.08 
 
 		 330 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00477  ISXoo6 transposase  31.94 
 
 		 327 aa  67.4  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6186  transposase IS4 family protein  33.08 
 
 		 330 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.62598 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2612  transposase IS4 family protein  33.08 
 
 		 330 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4057  transposase IS4 family protein  33.08 
 
 		 330 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3478  transposase IS4 family protein  33.08 
 
 		 330 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.594385 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4760  transposase IS4 family protein  33.08 
 
 		 330 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>