More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2971 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2971  IS1246 transposase  100 
 
 		 280 aa  587  1e-167  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0337  transposase IS4 family protein  82.5 
 
 		 345 aa  494  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0260  transposase IS4 family protein  82.5 
 
 		 345 aa  493  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0479  transposase IS4 family protein  79.29 
 
 		 345 aa  474  1e-133  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1943  transposase IS4 family protein  79.29 
 
 		 345 aa  474  1e-133  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0044381  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0318  transposase IS4 family protein  81.74 
 
 		 314 aa  402  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.356657  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26840  Transposase, IS4  53.7 
 
 		 335 aa  301  6.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16640  Transposase, IS4  53.7 
 
 		 335 aa  301  6.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24660  Transposase, IS4  53.7 
 
 		 335 aa  301  6.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49770  IS4 family transposase  53.7 
 
 		 335 aa  301  6.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36450  Transposase, IS4  53.7 
 
 		 335 aa  301  6.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24710  Transposase, IS4  52.96 
 
 		 335 aa  299  4e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3091  transposase IS4 family protein  48.56 
 
 		 338 aa  273  3e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2457  transposase IS4 family protein  48.56 
 
 		 338 aa  273  3e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000063174  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2638  transposase IS4 family protein  48.56 
 
 		 338 aa  273  3e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0500483  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0955  transposase IS4 family protein  41.52 
 
 		 360 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3123  transposase IS4 family protein  41.52 
 
 		 360 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1196  IS5 family transposase  42.91 
 
 		 334 aa  219  3e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.107807  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2450  transposase IS4 family protein  41.2 
 
 		 348 aa  217  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.348584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2324  transposase IS4 family protein  41.2 
 
 		 348 aa  217  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.552067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5319  transposase IS4 family protein  41.52 
 
 		 353 aa  214  9e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.316405 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1665  transposase IS4 family protein  40.7 
 
 		 367 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.114037  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4812  transposase IS4 family protein  36.82 
 
 		 363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0712  transposase IS4 family protein  38.85 
 
 		 352 aa  199  5e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0222  transposase IS4 family protein  38.03 
 
 		 348 aa  198  7e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0829  transposase IS4 family protein  38.49 
 
 		 352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1747  transposase IS4 family protein  37.12 
 
 		 359 aa  195  6e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.25501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0147  IS5 family transposase  38.61 
 
 		 316 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5109  IS4 family transposase  35.49 
 
 		 358 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0975401  normal  0.0840327 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1361  transposase IS4 family protein  46.51 
 
 		 240 aa  156  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.873798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2442  transposase, IS4  34.93 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0131  transposase, IS4  34.93 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0566  transposase, IS4  34.93 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0132  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0567  transposase, IS4  34.93 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.330478  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0584  transposase, IS4  34.93 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.810717  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0785  transposase, IS4  34.93 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1279  transposase, IS4  34.93 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1446  transposase, IS4  34.93 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1639  transposase, IS4  34.93 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1923  transposase, IS4  34.93 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2019  transposase, IS4  34.93 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2137  transposase, IS4  34.93 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2160  transposase, IS4  34.93 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2173  transposase, IS4  34.93 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.460433  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0398  transposase, IS4  34.56 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.3293  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0756  transposase, IS4  34.56 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.443512  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0912  transposase, IS4  34.56 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.216188  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0918  transposase, IS4  34.56 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1991  transposase, IS4  34.56 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4989  transposase IS4 family protein  31.25 
 
 		 320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0078  transposase, IS4  31.5 
 
 		 320 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.512756  normal  0.0332159 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3425  transposase, IS4 family protein  35.68 
 
 		 233 aa  120  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0826  transposase, IS4  31.5 
 
 		 320 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.33945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4411  transposase, IS4  31.5 
 
 		 320 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.434109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0216  transposase, IS4  31.5 
 
 		 320 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0213  transposase, IS4  31.5 
 
 		 320 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0925745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1226  transposase, IS4  31.5 
 
 		 320 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0184  ISPg1, transposase  29.27 
 
 		 361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0825  ISPg1, transposase  29.27 
 
 		 361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1031  ISPg1, transposase  29.27 
 
 		 361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000307461 
 
 
-
 
NC_002950  PG1177  ISPg1, transposase  29.27 
 
 		 361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1197  ISPg1, transposase  29.27 
 
 		 361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_002950  PG1448  ISPg1, transposase  29.27 
 
 		 361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1624  ISPg1, transposase  29.27 
 
 		 361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1906  ISPg1, transposase  29.27 
 
 		 361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0460  ISPg1, transposase  29.62 
 
 		 361 aa  110  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.835664 
 
 
-
 
NC_002950  PG0549  ISPg1, transposase  29.62 
 
 		 361 aa  110  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1244  ISPg1, transposase  29.62 
 
 		 361 aa  110  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04450  transposase  39.87 
 
 		 178 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.468258  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4261  transposase, IS4  32.49 
 
 		 349 aa  107  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0257321  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4149  transposase, IS4  32.49 
 
 		 358 aa  107  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4268  transposase, IS4  31.62 
 
 		 330 aa  107  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.45537  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4041  transposase, IS4  32.49 
 
 		 445 aa  107  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.923218  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4027  transposase, IS4 family protein  29.56 
 
 		 326 aa  96.3  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0970154  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1308  ISRSO18-transposase protein  29.67 
 
 		 320 aa  94.7  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0618  ISRSO18-transposase protein  29.67 
 
 		 320 aa  94  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0604  transposase, IS4 family protein  28.21 
 
 		 314 aa  92.8  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3832  transposase, IS4 family protein  28.21 
 
 		 314 aa  92.8  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3712  transposase, IS4 family protein  28.21 
 
 		 314 aa  92.8  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.216949  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06239  ISXo1 transposase  29.45 
 
 		 322 aa  92  8e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368633  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04707  ISXo1 transposase  29.45 
 
 		 322 aa  92  8e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01080  ISXo1 transposase  29.45 
 
 		 322 aa  92  8e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000904995  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01858  ISXo1 transposase  29.45 
 
 		 322 aa  92  8e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00491  ISXo1 transposase  29.45 
 
 		 322 aa  92  8e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06088  ISXo1 transposase  29.45 
 
 		 322 aa  92  8e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04722  ISXo1 transposase  29.45 
 
 		 322 aa  92  8e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.24864  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05625  ISXo1 transposase  29.45 
 
 		 322 aa  92  8e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0316217  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05516  ISXo1 transposase  29.45 
 
 		 322 aa  92  8e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04850  ISXo1 transposase  29.45 
 
 		 322 aa  92  8e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0577284  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3344  transposase IS4 family protein  27.02 
 
 		 336 aa  92.4  8e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04603  ISXo1 transposase  29.45 
 
 		 322 aa  92  8e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05689  ISXo1 transposase  29.45 
 
 		 322 aa  92  8e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00368  ISXo1 transposase  29.45 
 
 		 322 aa  92  9e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.161909  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04767  ISXo1 transposase  29.45 
 
 		 322 aa  92  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01500  ISXo1 transposase  29.45 
 
 		 322 aa  91.7  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.549499  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04167  ISXo1 transposase  29.45 
 
 		 322 aa  91.7  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02304  ISXo1 transposase  29.45 
 
 		 322 aa  92  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05526  ISXo1 transposase  29.45 
 
 		 322 aa  92  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.423562  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00267  ISXo1 transposase  29.45 
 
 		 322 aa  92  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05577  ISXo1 transposase  29.45 
 
 		 322 aa  92  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.461805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>