More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1361 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1361  transposase IS4 family protein  100 
 
 
240 aa  491  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.873798  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2324  transposase IS4 family protein  99.58 
 
 
348 aa  488  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.552067  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2450  transposase IS4 family protein  99.58 
 
 
348 aa  488  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.348584  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0829  transposase IS4 family protein  84.75 
 
 
352 aa  431  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0712  transposase IS4 family protein  85.59 
 
 
352 aa  433  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0222  transposase IS4 family protein  83.9 
 
 
348 aa  424  1e-118  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1665  transposase IS4 family protein  80.54 
 
 
367 aa  378  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.114037  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2457  transposase IS4 family protein  51.53 
 
 
338 aa  241  7.999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000063174  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3091  transposase IS4 family protein  51.53 
 
 
338 aa  241  7.999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2638  transposase IS4 family protein  51.53 
 
 
338 aa  241  7.999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0500483  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4812  transposase IS4 family protein  44.58 
 
 
363 aa  222  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1196  IS5 family transposase  48.9 
 
 
334 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.107807  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0147  IS5 family transposase  47.62 
 
 
316 aa  209  3e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5319  transposase IS4 family protein  42.8 
 
 
353 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.316405 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1747  transposase IS4 family protein  42.74 
 
 
359 aa  198  6e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.25501  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36450  Transposase, IS4  44.2 
 
 
335 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16640  Transposase, IS4  44.2 
 
 
335 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49770  IS4 family transposase  44.2 
 
 
335 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26840  Transposase, IS4  44.2 
 
 
335 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24660  Transposase, IS4  44.2 
 
 
335 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24710  Transposase, IS4  42.86 
 
 
335 aa  181  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0260  transposase IS4 family protein  41.67 
 
 
345 aa  174  8e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0337  transposase IS4 family protein  41.67 
 
 
345 aa  174  9e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0318  transposase IS4 family protein  41.92 
 
 
314 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.356657  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1943  transposase IS4 family protein  38.6 
 
 
345 aa  164  9e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0044381  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0479  transposase IS4 family protein  38.6 
 
 
345 aa  164  9e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2971  IS1246 transposase  46.51 
 
 
280 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5109  IS4 family transposase  36.11 
 
 
358 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0975401  normal  0.0840327 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3123  transposase IS4 family protein  39.34 
 
 
360 aa  149  5e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0955  transposase IS4 family protein  39.34 
 
 
360 aa  149  5e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2759  transposase (class II)  43.03 
 
 
174 aa  137  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.195506  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1991  transposase, IS4  34.98 
 
 
313 aa  121  9e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0918  transposase, IS4  34.98 
 
 
313 aa  121  9e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0912  transposase, IS4  34.98 
 
 
313 aa  121  9e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.216188  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0398  transposase, IS4  34.98 
 
 
313 aa  121  9e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.3293  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0756  transposase, IS4  34.98 
 
 
313 aa  121  9e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.443512  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1279  transposase, IS4  34.53 
 
 
313 aa  118  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1923  transposase, IS4  34.53 
 
 
313 aa  118  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2019  transposase, IS4  34.53 
 
 
313 aa  118  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2160  transposase, IS4  34.53 
 
 
313 aa  118  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2173  transposase, IS4  34.53 
 
 
313 aa  118  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.460433  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2137  transposase, IS4  34.53 
 
 
313 aa  118  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1639  transposase, IS4  34.53 
 
 
313 aa  118  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1446  transposase, IS4  34.53 
 
 
313 aa  118  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2442  transposase, IS4  34.53 
 
 
313 aa  118  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0131  transposase, IS4  34.53 
 
 
313 aa  118  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0566  transposase, IS4  34.53 
 
 
313 aa  118  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0132  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0567  transposase, IS4  34.53 
 
 
313 aa  118  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.330478  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0584  transposase, IS4  34.53 
 
 
313 aa  118  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.810717  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0785  transposase, IS4  34.53 
 
 
313 aa  118  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0460  ISPg1, transposase  30.36 
 
 
361 aa  115  6e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.835664 
 
 
-
 
NC_002950  PG0549  ISPg1, transposase  30.36 
 
 
361 aa  115  6e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1244  ISPg1, transposase  30.36 
 
 
361 aa  115  6e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0184  ISPg1, transposase  29.55 
 
 
361 aa  115  8.999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0825  ISPg1, transposase  29.55 
 
 
361 aa  115  8.999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1031  ISPg1, transposase  29.55 
 
 
361 aa  115  8.999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000307461 
 
 
-
 
NC_002950  PG1177  ISPg1, transposase  29.55 
 
 
361 aa  115  8.999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1197  ISPg1, transposase  29.55 
 
 
361 aa  115  8.999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_002950  PG1448  ISPg1, transposase  29.55 
 
 
361 aa  115  8.999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1624  ISPg1, transposase  29.55 
 
 
361 aa  115  8.999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1906  ISPg1, transposase  29.55 
 
 
361 aa  115  8.999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4989  transposase IS4 family protein  30.56 
 
 
320 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1226  transposase, IS4  30.56 
 
 
320 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0826  transposase, IS4  30.56 
 
 
320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.33945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4411  transposase, IS4  30.56 
 
 
320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.434109  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0216  transposase, IS4  30.56 
 
 
320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0213  transposase, IS4  30.56 
 
 
320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0925745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0078  transposase, IS4  30.56 
 
 
320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.512756  normal  0.0332159 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5532  IS4 family transposase  30.52 
 
 
320 aa  105  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4268  transposase, IS4  28.17 
 
 
330 aa  98.6  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.45537  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4149  transposase, IS4  28.17 
 
 
358 aa  98.2  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4041  transposase, IS4  28.17 
 
 
445 aa  98.2  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.923218  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4261  transposase, IS4  30.53 
 
 
349 aa  97.8  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0257321  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2276  transposase, IS4  29.13 
 
 
323 aa  96.7  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4916  transposase IS4 family protein  28.82 
 
 
324 aa  95.1  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.387666  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3344  transposase IS4 family protein  29.11 
 
 
336 aa  95.1  9e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4142  IS4 family transposase  28.3 
 
 
326 aa  93.6  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.282209 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0942  transposase, IS4  29.61 
 
 
322 aa  92.8  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0800  IS5 transposase  26.89 
 
 
326 aa  92.4  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0569  IS5 transposase  26.89 
 
 
326 aa  92.4  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0947  IS5 transposase  26.89 
 
 
326 aa  91.7  9e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2276  transposase IS4 family protein  27.27 
 
 
326 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.540999  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0652  IS5 transposase  27.27 
 
 
326 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.834508  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1856  IS5 transposase  27.27 
 
 
326 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.859503  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0023  IS5 transposase  27.27 
 
 
326 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.938635  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4088  IS5 transposase  27.27 
 
 
326 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0322419  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4707  IS5 transposase  27.27 
 
 
326 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3314  IS5 transposase  27.27 
 
 
326 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0934  IS5 transposase  27.27 
 
 
326 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4726  IS5 transposase  27.27 
 
 
326 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.301836  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2076  IS5 transposase  27.27 
 
 
326 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1124  IS5 transposase  27.27 
 
 
326 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.756281 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2257  IS5 transposase  27.36 
 
 
330 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.705619  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0642  IS5 transposase  27.36 
 
 
330 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0956986  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1565  transposase IS4 family protein  27.27 
 
 
326 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.004757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1627  transposase IS4 family protein  27.27 
 
 
326 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0994008  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2619  transposase IS4 family protein  27.27 
 
 
326 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2970  transposase IS4 family protein  27.27 
 
 
326 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.646128  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3107  transposase IS4 family protein  27.27 
 
 
326 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3892  transposase IS4 family protein  27.36 
 
 
326 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>