More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1665 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1665  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 367 aa  770    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.114037  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2324  transposase IS4 family protein  76.51 
 
 		 348 aa  542  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.552067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2450  transposase IS4 family protein  76.51 
 
 		 348 aa  542  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.348584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0222  transposase IS4 family protein  73.18 
 
 		 348 aa  532  1e-150  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0712  transposase IS4 family protein  72.7 
 
 		 352 aa  528  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0829  transposase IS4 family protein  71.81 
 
 		 352 aa  521  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1361  transposase IS4 family protein  80.54 
 
 		 240 aa  378  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.873798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2638  transposase IS4 family protein  48.32 
 
 		 338 aa  306  3e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0500483  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3091  transposase IS4 family protein  48.32 
 
 		 338 aa  306  3e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2457  transposase IS4 family protein  48.32 
 
 		 338 aa  306  3e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000063174  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4812  transposase IS4 family protein  44.02 
 
 		 363 aa  288  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1196  IS5 family transposase  46.63 
 
 		 334 aa  287  2e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.107807  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5319  transposase IS4 family protein  42.01 
 
 		 353 aa  262  6e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.316405 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0147  IS5 family transposase  42.68 
 
 		 316 aa  238  1e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0337  transposase IS4 family protein  38.44 
 
 		 345 aa  229  4e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1747  transposase IS4 family protein  38.37 
 
 		 359 aa  229  8e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.25501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0260  transposase IS4 family protein  38.14 
 
 		 345 aa  228  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1943  transposase IS4 family protein  37.24 
 
 		 345 aa  220  3.9999999999999997e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0044381  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0479  transposase IS4 family protein  37.24 
 
 		 345 aa  220  3.9999999999999997e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24710  Transposase, IS4  38.7 
 
 		 335 aa  219  3.9999999999999997e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26840  Transposase, IS4  38.7 
 
 		 335 aa  219  5e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49770  IS4 family transposase  38.7 
 
 		 335 aa  219  5e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24660  Transposase, IS4  38.7 
 
 		 335 aa  219  5e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36450  Transposase, IS4  38.7 
 
 		 335 aa  219  5e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16640  Transposase, IS4  38.7 
 
 		 335 aa  219  5e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2971  IS1246 transposase  40.7 
 
 		 280 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0318  transposase IS4 family protein  40.43 
 
 		 314 aa  206  6e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.356657  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5109  IS4 family transposase  34.71 
 
 		 358 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0975401  normal  0.0840327 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0955  transposase IS4 family protein  34.25 
 
 		 360 aa  172  7.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3123  transposase IS4 family protein  34.25 
 
 		 360 aa  172  7.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1991  transposase, IS4  30.81 
 
 		 313 aa  157  3e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0912  transposase, IS4  30.81 
 
 		 313 aa  157  3e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.216188  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0918  transposase, IS4  30.81 
 
 		 313 aa  157  3e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0398  transposase, IS4  30.81 
 
 		 313 aa  157  3e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.3293  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0756  transposase, IS4  30.81 
 
 		 313 aa  157  3e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.443512  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1279  transposase, IS4  30.7 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1923  transposase, IS4  30.7 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2137  transposase, IS4  30.7 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2173  transposase, IS4  30.7 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.460433  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2160  transposase, IS4  30.7 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2019  transposase, IS4  30.7 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1639  transposase, IS4  30.7 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2442  transposase, IS4  30.7 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1446  transposase, IS4  30.7 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0131  transposase, IS4  30.7 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0566  transposase, IS4  30.7 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0132  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0567  transposase, IS4  30.7 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.330478  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0584  transposase, IS4  30.7 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.810717  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0785  transposase, IS4  30.7 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0460  ISPg1, transposase  30.77 
 
 		 361 aa  146  5e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.835664 
 
 
-
 
NC_002950  PG0549  ISPg1, transposase  30.77 
 
 		 361 aa  146  5e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1244  ISPg1, transposase  30.77 
 
 		 361 aa  146  5e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0184  ISPg1, transposase  30.46 
 
 		 361 aa  145  1e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0825  ISPg1, transposase  30.46 
 
 		 361 aa  145  1e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1031  ISPg1, transposase  30.46 
 
 		 361 aa  145  1e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000307461 
 
 
-
 
NC_002950  PG1177  ISPg1, transposase  30.46 
 
 		 361 aa  145  1e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1197  ISPg1, transposase  30.46 
 
 		 361 aa  145  1e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_002950  PG1448  ISPg1, transposase  30.46 
 
 		 361 aa  145  1e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1624  ISPg1, transposase  30.46 
 
 		 361 aa  145  1e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1906  ISPg1, transposase  30.46 
 
 		 361 aa  145  1e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2759  transposase (class II)  46.41 
 
 		 174 aa  139  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.195506  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5532  IS4 family transposase  28.38 
 
 		 320 aa  123  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3425  transposase, IS4 family protein  34.51 
 
 		 233 aa  122  9e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2276  transposase, IS4  28.7 
 
 		 323 aa  122  9e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4268  transposase, IS4  27.48 
 
 		 330 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.45537  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4041  transposase, IS4  27.93 
 
 		 445 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.923218  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4149  transposase, IS4  27.93 
 
 		 358 aa  120  6e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4261  transposase, IS4  27.4 
 
 		 349 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0257321  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2748  transposase, IS4  26.05 
 
 		 311 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.327226  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4989  transposase IS4 family protein  25.62 
 
 		 320 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1226  transposase, IS4  25.94 
 
 		 320 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3344  transposase IS4 family protein  26.4 
 
 		 336 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0942  transposase, IS4  28.79 
 
 		 322 aa  113  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0826  transposase, IS4  25.94 
 
 		 320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.33945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4411  transposase, IS4  25.94 
 
 		 320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.434109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0216  transposase, IS4  25.94 
 
 		 320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0078  transposase, IS4  25.94 
 
 		 320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.512756  normal  0.0332159 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0213  transposase, IS4  25.94 
 
 		 320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0925745 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0655  transposase IS4 family protein  28.09 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.927973  normal  0.11164 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1156  transposase, IS4 family protein  28.3 
 
 		 317 aa  109  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2847  transposase IS4 family protein  28.3 
 
 		 317 aa  109  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1714  transposase IS4 family protein  28.3 
 
 		 317 aa  109  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4916  transposase IS4 family protein  27.08 
 
 		 324 aa  109  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.387666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1042  transposase, IS4 family protein  28.3 
 
 		 317 aa  109  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.077617  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0206  TIS1021 transposase  25.38 
 
 		 328 aa  109  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1179  TIS1021 transposase  25.38 
 
 		 328 aa  109  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0887  ISMca7, transposase  28.04 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.718258  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5619  transposase IS4 family protein  25.67 
 
 		 330 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.659177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5692  transposase IS4 family protein  25.67 
 
 		 330 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6186  transposase IS4 family protein  25.67 
 
 		 330 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.62598 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3478  transposase IS4 family protein  25.67 
 
 		 330 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.594385 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2612  transposase IS4 family protein  25.67 
 
 		 330 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3555  transposase IS4 family protein  25.67 
 
 		 330 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4760  transposase IS4 family protein  25.67 
 
 		 330 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4057  transposase IS4 family protein  25.67 
 
 		 330 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5567  transposase IS4 family protein  25.67 
 
 		 330 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.60838 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5581  transposase IS4 family protein  25.67 
 
 		 330 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4863  transposase IS4 family protein  25.46 
 
 		 330 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0853188  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0076  transposase IS4 family protein  26.3 
 
 		 321 aa  106  6e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0258707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1561  transposase IS4 family protein  26.3 
 
 		 321 aa  106  6e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  0.983286 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>