More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1943 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0479  transposase IS4 family protein  100 
 
 
345 aa  721    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1943  transposase IS4 family protein  100 
 
 
345 aa  721    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0044381  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0337  transposase IS4 family protein  80.87 
 
 
345 aa  591  1e-168  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0260  transposase IS4 family protein  80.87 
 
 
345 aa  591  1e-168  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0318  transposase IS4 family protein  81.36 
 
 
314 aa  504  9.999999999999999e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.356657  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2971  IS1246 transposase  79.29 
 
 
280 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24660  Transposase, IS4  53.99 
 
 
335 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16640  Transposase, IS4  53.99 
 
 
335 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24710  Transposase, IS4  53.99 
 
 
335 aa  371  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49770  IS4 family transposase  53.99 
 
 
335 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26840  Transposase, IS4  53.99 
 
 
335 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36450  Transposase, IS4  53.99 
 
 
335 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2638  transposase IS4 family protein  43.54 
 
 
338 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0500483  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2457  transposase IS4 family protein  43.54 
 
 
338 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000063174  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3091  transposase IS4 family protein  43.54 
 
 
338 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3123  transposase IS4 family protein  42.73 
 
 
360 aa  268  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0955  transposase IS4 family protein  42.73 
 
 
360 aa  268  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5319  transposase IS4 family protein  41.27 
 
 
353 aa  232  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.316405 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2324  transposase IS4 family protein  37.06 
 
 
348 aa  231  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.552067  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4812  transposase IS4 family protein  36.47 
 
 
363 aa  231  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2450  transposase IS4 family protein  37.06 
 
 
348 aa  231  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.348584  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1196  IS5 family transposase  38.18 
 
 
334 aa  223  4e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.107807  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0712  transposase IS4 family protein  35.93 
 
 
352 aa  220  3e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1665  transposase IS4 family protein  37.24 
 
 
367 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.114037  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0829  transposase IS4 family protein  35.63 
 
 
352 aa  218  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0222  transposase IS4 family protein  34.41 
 
 
348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1747  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 
359 aa  207  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.25501  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0147  IS5 family transposase  36.69 
 
 
316 aa  205  1e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5109  IS4 family transposase  33.91 
 
 
358 aa  200  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0975401  normal  0.0840327 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1361  transposase IS4 family protein  38.6 
 
 
240 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.873798  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2137  transposase, IS4  34.85 
 
 
313 aa  156  4e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2173  transposase, IS4  34.85 
 
 
313 aa  156  4e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.460433  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2160  transposase, IS4  34.85 
 
 
313 aa  156  4e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2019  transposase, IS4  34.85 
 
 
313 aa  156  4e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1923  transposase, IS4  34.85 
 
 
313 aa  156  4e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2442  transposase, IS4  34.85 
 
 
313 aa  156  4e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1639  transposase, IS4  34.85 
 
 
313 aa  156  4e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1446  transposase, IS4  34.85 
 
 
313 aa  156  4e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0131  transposase, IS4  34.85 
 
 
313 aa  156  4e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0566  transposase, IS4  34.85 
 
 
313 aa  156  4e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0132  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0567  transposase, IS4  34.85 
 
 
313 aa  156  4e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.330478  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0584  transposase, IS4  34.85 
 
 
313 aa  156  4e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.810717  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0785  transposase, IS4  34.85 
 
 
313 aa  156  4e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1279  transposase, IS4  34.85 
 
 
313 aa  156  4e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1991  transposase, IS4  34.85 
 
 
313 aa  155  8e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0398  transposase, IS4  34.85 
 
 
313 aa  155  8e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.3293  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0756  transposase, IS4  34.85 
 
 
313 aa  155  8e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.443512  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0912  transposase, IS4  34.85 
 
 
313 aa  155  8e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.216188  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0918  transposase, IS4  34.85 
 
 
313 aa  155  8e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4989  transposase IS4 family protein  31.63 
 
 
320 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0078  transposase, IS4  31.65 
 
 
320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.512756  normal  0.0332159 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4411  transposase, IS4  31.65 
 
 
320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.434109  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0826  transposase, IS4  31.65 
 
 
320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.33945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0216  transposase, IS4  31.65 
 
 
320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0213  transposase, IS4  31.65 
 
 
320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0925745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1226  transposase, IS4  31.65 
 
 
320 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4149  transposase, IS4  32.76 
 
 
358 aa  129  6e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4041  transposase, IS4  32.76 
 
 
445 aa  129  9.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.923218  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4261  transposase, IS4  32.85 
 
 
349 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0257321  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4268  transposase, IS4  30.47 
 
 
330 aa  127  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.45537  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3344  transposase IS4 family protein  26.81 
 
 
336 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0184  ISPg1, transposase  25.85 
 
 
361 aa  119  7.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0825  ISPg1, transposase  25.85 
 
 
361 aa  119  7.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1031  ISPg1, transposase  25.85 
 
 
361 aa  119  7.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000307461 
 
 
-
 
NC_002950  PG1177  ISPg1, transposase  25.85 
 
 
361 aa  119  7.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1197  ISPg1, transposase  25.85 
 
 
361 aa  119  7.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_002950  PG1448  ISPg1, transposase  25.85 
 
 
361 aa  119  7.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1624  ISPg1, transposase  25.85 
 
 
361 aa  119  7.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1906  ISPg1, transposase  25.85 
 
 
361 aa  119  7.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3425  transposase, IS4 family protein  34.96 
 
 
233 aa  117  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0460  ISPg1, transposase  25.54 
 
 
361 aa  112  9e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.835664 
 
 
-
 
NC_002950  PG0549  ISPg1, transposase  25.54 
 
 
361 aa  112  9e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1244  ISPg1, transposase  25.54 
 
 
361 aa  112  9e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1308  ISRSO18-transposase protein  28.8 
 
 
320 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4142  IS4 family transposase  28.21 
 
 
326 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.282209 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0618  ISRSO18-transposase protein  28.8 
 
 
320 aa  110  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16560  hypothetical protein  54.26 
 
 
116 aa  108  9.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2276  transposase, IS4  29.02 
 
 
323 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2718  transposase, IS4 family protein  28.84 
 
 
330 aa  108  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00012414  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4027  transposase, IS4 family protein  30.1 
 
 
326 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0970154  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0206  TIS1021 transposase  26.92 
 
 
328 aa  105  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1179  TIS1021 transposase  26.92 
 
 
328 aa  105  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2748  transposase, IS4  28.12 
 
 
311 aa  105  8e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.327226  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2759  transposase (class II)  35.33 
 
 
174 aa  103  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.195506  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0642  IS5 transposase  28.53 
 
 
330 aa  103  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0956986  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2257  IS5 transposase  28.53 
 
 
330 aa  103  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.705619  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2276  transposase IS4 family protein  28.53 
 
 
326 aa  103  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.540999  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04450  transposase  41.45 
 
 
178 aa  103  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.468258  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2847  transposase IS4 family protein  29.3 
 
 
317 aa  102  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1156  transposase, IS4 family protein  29.3 
 
 
317 aa  102  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1714  transposase IS4 family protein  29.3 
 
 
317 aa  102  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1042  transposase, IS4 family protein  29.3 
 
 
317 aa  102  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.077617  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3314  IS5 transposase  28.21 
 
 
326 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0652  IS5 transposase  28.21 
 
 
326 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.834508  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0604  transposase, IS4 family protein  28.9 
 
 
314 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3712  transposase, IS4 family protein  28.9 
 
 
314 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.216949  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3832  transposase, IS4 family protein  28.9 
 
 
314 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1124  IS5 transposase  28.21 
 
 
326 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.756281 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0023  IS5 transposase  28.21 
 
 
326 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.938635  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01370  ISXoo6 transposase  29.02 
 
 
329 aa  101  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>