More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_26840 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_49770  IS4 family transposase  100 
 
 
335 aa  684    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24660  Transposase, IS4  100 
 
 
335 aa  684    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16640  Transposase, IS4  100 
 
 
335 aa  684    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36450  Transposase, IS4  100 
 
 
335 aa  684    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26840  Transposase, IS4  100 
 
 
335 aa  684    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24710  Transposase, IS4  90.75 
 
 
335 aa  626  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0260  transposase IS4 family protein  55.21 
 
 
345 aa  386  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0337  transposase IS4 family protein  55.21 
 
 
345 aa  386  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1943  transposase IS4 family protein  53.99 
 
 
345 aa  369  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0044381  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0479  transposase IS4 family protein  53.99 
 
 
345 aa  369  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0318  transposase IS4 family protein  55.94 
 
 
314 aa  335  9e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.356657  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2971  IS1246 transposase  53.7 
 
 
280 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3123  transposase IS4 family protein  46.48 
 
 
360 aa  276  4e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0955  transposase IS4 family protein  46.48 
 
 
360 aa  276  4e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2638  transposase IS4 family protein  43.03 
 
 
338 aa  267  2e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0500483  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2457  transposase IS4 family protein  43.03 
 
 
338 aa  267  2e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000063174  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3091  transposase IS4 family protein  43.03 
 
 
338 aa  267  2e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2324  transposase IS4 family protein  40.12 
 
 
348 aa  243  3e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.552067  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2450  transposase IS4 family protein  40.12 
 
 
348 aa  243  3e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.348584  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4812  transposase IS4 family protein  37.54 
 
 
363 aa  230  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0712  transposase IS4 family protein  37.72 
 
 
352 aa  223  3e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1665  transposase IS4 family protein  38.7 
 
 
367 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.114037  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0829  transposase IS4 family protein  37.13 
 
 
352 aa  219  7e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5109  IS4 family transposase  36.92 
 
 
358 aa  218  8.999999999999998e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0975401  normal  0.0840327 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0222  transposase IS4 family protein  36.45 
 
 
348 aa  217  2e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1747  transposase IS4 family protein  35.47 
 
 
359 aa  210  3e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.25501  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1196  IS5 family transposase  36.75 
 
 
334 aa  199  7e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.107807  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5319  transposase IS4 family protein  36.78 
 
 
353 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.316405 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0147  IS5 family transposase  35.48 
 
 
316 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1361  transposase IS4 family protein  44.2 
 
 
240 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.873798  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0398  transposase, IS4  35.03 
 
 
313 aa  159  5e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.3293  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0756  transposase, IS4  35.03 
 
 
313 aa  159  5e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.443512  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0912  transposase, IS4  35.03 
 
 
313 aa  159  5e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.216188  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0918  transposase, IS4  35.03 
 
 
313 aa  159  5e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1991  transposase, IS4  35.03 
 
 
313 aa  159  5e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2173  transposase, IS4  35.03 
 
 
313 aa  159  6e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.460433  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2160  transposase, IS4  35.03 
 
 
313 aa  159  6e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2137  transposase, IS4  35.03 
 
 
313 aa  159  6e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2442  transposase, IS4  35.03 
 
 
313 aa  159  6e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0131  transposase, IS4  35.03 
 
 
313 aa  159  6e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0566  transposase, IS4  35.03 
 
 
313 aa  159  6e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0132  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0567  transposase, IS4  35.03 
 
 
313 aa  159  6e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.330478  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0584  transposase, IS4  35.03 
 
 
313 aa  159  6e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.810717  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0785  transposase, IS4  35.03 
 
 
313 aa  159  6e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1279  transposase, IS4  35.03 
 
 
313 aa  159  6e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1446  transposase, IS4  35.03 
 
 
313 aa  159  6e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1639  transposase, IS4  35.03 
 
 
313 aa  159  6e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1923  transposase, IS4  35.03 
 
 
313 aa  159  6e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2019  transposase, IS4  35.03 
 
 
313 aa  159  6e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16560  hypothetical protein  73.2 
 
 
116 aa  150  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3344  transposase IS4 family protein  33.22 
 
 
336 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4989  transposase IS4 family protein  33.55 
 
 
320 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1226  transposase, IS4  34.62 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0078  transposase, IS4  34.62 
 
 
320 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.512756  normal  0.0332159 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0213  transposase, IS4  34.62 
 
 
320 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0925745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0216  transposase, IS4  34.62 
 
 
320 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0826  transposase, IS4  34.62 
 
 
320 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.33945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4411  transposase, IS4  34.62 
 
 
320 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.434109  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2847  transposase IS4 family protein  34.63 
 
 
317 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1042  transposase, IS4 family protein  34.63 
 
 
317 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.077617  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1156  transposase, IS4 family protein  34.63 
 
 
317 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1714  transposase IS4 family protein  34.63 
 
 
317 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2759  transposase (class II)  42.24 
 
 
174 aa  125  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.195506  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5532  IS4 family transposase  30.38 
 
 
320 aa  119  7.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3425  transposase, IS4 family protein  36.2 
 
 
233 aa  119  9e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4268  transposase, IS4  30.32 
 
 
330 aa  119  9e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.45537  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4027  transposase, IS4 family protein  32.27 
 
 
326 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0970154  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4149  transposase, IS4  30.93 
 
 
358 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0460  ISPg1, transposase  28.33 
 
 
361 aa  116  5e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.835664 
 
 
-
 
NC_002950  PG0549  ISPg1, transposase  28.33 
 
 
361 aa  116  5e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1244  ISPg1, transposase  28.33 
 
 
361 aa  116  5e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2718  transposase, IS4 family protein  32.11 
 
 
330 aa  116  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00012414  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4041  transposase, IS4  30.93 
 
 
445 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.923218  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0184  ISPg1, transposase  27.99 
 
 
361 aa  115  8.999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0825  ISPg1, transposase  27.99 
 
 
361 aa  115  8.999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1031  ISPg1, transposase  27.99 
 
 
361 aa  115  8.999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000307461 
 
 
-
 
NC_002950  PG1177  ISPg1, transposase  27.99 
 
 
361 aa  115  8.999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1197  ISPg1, transposase  27.99 
 
 
361 aa  115  8.999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_002950  PG1448  ISPg1, transposase  27.99 
 
 
361 aa  115  8.999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1624  ISPg1, transposase  27.99 
 
 
361 aa  115  8.999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1906  ISPg1, transposase  27.99 
 
 
361 aa  115  8.999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4261  transposase, IS4  31.27 
 
 
349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0257321  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0604  transposase, IS4 family protein  30.99 
 
 
314 aa  114  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3832  transposase, IS4 family protein  30.99 
 
 
314 aa  114  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3712  transposase, IS4 family protein  30.99 
 
 
314 aa  114  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.216949  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32270  hypothetical protein  65.93 
 
 
237 aa  114  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3460  transposase, IS4 family protein  31.51 
 
 
320 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2494  transposase, IS4 family protein  31.51 
 
 
320 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0455823  decreased coverage  0.00299337 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1557  transposase, IS4 family protein  31.51 
 
 
320 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0590  transposase, IS4 family protein  30.9 
 
 
326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.605879  normal  0.456772 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1459  transposase, IS4 family protein  30.9 
 
 
326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2004  transposase, IS4 family protein  30.9 
 
 
326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.094383  normal  0.686139 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3367  transposase, IS4 family protein  30.9 
 
 
326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.105389  normal  0.324658 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3766  transposase, IS4 family protein  30.9 
 
 
326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3426  transposase, IS4 family protein  30.9 
 
 
326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3096  transposase, IS4 family protein  30.9 
 
 
326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0728273  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2954  transposase, IS4 family protein  30.9 
 
 
320 aa  110  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0168264  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0206  TIS1021 transposase  29.81 
 
 
328 aa  109  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1308  ISRSO18-transposase protein  30.94 
 
 
320 aa  108  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1179  TIS1021 transposase  29.81 
 
 
328 aa  109  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>