More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1031 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0184  ISPg1, transposase  100 
 
 
361 aa  755    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0460  ISPg1, transposase  97.23 
 
 
361 aa  734    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.835664 
 
 
-
 
NC_002950  PG0549  ISPg1, transposase  97.23 
 
 
361 aa  734    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0825  ISPg1, transposase  100 
 
 
361 aa  755    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1031  ISPg1, transposase  100 
 
 
361 aa  755    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000307461 
 
 
-
 
NC_002950  PG1177  ISPg1, transposase  100 
 
 
361 aa  755    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1197  ISPg1, transposase  100 
 
 
361 aa  755    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_002950  PG1244  ISPg1, transposase  97.23 
 
 
361 aa  734    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1448  ISPg1, transposase  100 
 
 
361 aa  755    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1624  ISPg1, transposase  100 
 
 
361 aa  755    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1906  ISPg1, transposase  100 
 
 
361 aa  755    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1320  ISPg1, transposase, internal deletion  92.86 
 
 
211 aa  312  4.999999999999999e-84  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5319  transposase IS4 family protein  30.89 
 
 
353 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.316405 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3344  transposase IS4 family protein  32.1 
 
 
336 aa  160  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0222  transposase IS4 family protein  31.19 
 
 
348 aa  155  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0216  transposase, IS4  32.28 
 
 
320 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4411  transposase, IS4  32.28 
 
 
320 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.434109  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1226  transposase, IS4  32.28 
 
 
320 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0826  transposase, IS4  32.28 
 
 
320 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.33945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0213  transposase, IS4  32.28 
 
 
320 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0925745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0078  transposase, IS4  32.28 
 
 
320 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.512756  normal  0.0332159 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4989  transposase IS4 family protein  31.12 
 
 
320 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0712  transposase IS4 family protein  28.74 
 
 
352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1665  transposase IS4 family protein  30.4 
 
 
367 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.114037  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0829  transposase IS4 family protein  28.45 
 
 
352 aa  146  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2450  transposase IS4 family protein  27.9 
 
 
348 aa  145  8.000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.348584  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2324  transposase IS4 family protein  27.9 
 
 
348 aa  145  8.000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.552067  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2442  transposase, IS4  26.9 
 
 
313 aa  144  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0131  transposase, IS4  26.9 
 
 
313 aa  144  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0566  transposase, IS4  26.9 
 
 
313 aa  144  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0132  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0567  transposase, IS4  26.9 
 
 
313 aa  144  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.330478  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0584  transposase, IS4  26.9 
 
 
313 aa  144  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.810717  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0785  transposase, IS4  26.9 
 
 
313 aa  144  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1279  transposase, IS4  26.9 
 
 
313 aa  144  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1446  transposase, IS4  26.9 
 
 
313 aa  144  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1639  transposase, IS4  26.9 
 
 
313 aa  144  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1923  transposase, IS4  26.9 
 
 
313 aa  144  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2019  transposase, IS4  26.9 
 
 
313 aa  144  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2137  transposase, IS4  26.9 
 
 
313 aa  144  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2160  transposase, IS4  26.9 
 
 
313 aa  144  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2173  transposase, IS4  26.9 
 
 
313 aa  144  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.460433  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2638  transposase IS4 family protein  29.94 
 
 
338 aa  144  4e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0500483  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2457  transposase IS4 family protein  29.94 
 
 
338 aa  144  4e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000063174  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3091  transposase IS4 family protein  29.94 
 
 
338 aa  144  4e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0398  transposase, IS4  26.9 
 
 
313 aa  143  5e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.3293  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0756  transposase, IS4  26.9 
 
 
313 aa  143  5e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.443512  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0912  transposase, IS4  26.9 
 
 
313 aa  143  5e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.216188  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0918  transposase, IS4  26.9 
 
 
313 aa  143  5e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1991  transposase, IS4  26.9 
 
 
313 aa  143  5e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2718  transposase, IS4 family protein  30.79 
 
 
330 aa  139  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00012414  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0955  transposase IS4 family protein  32.34 
 
 
360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3123  transposase IS4 family protein  32.34 
 
 
360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1196  IS5 family transposase  29.5 
 
 
334 aa  134  3e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.107807  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2748  transposase, IS4  28.45 
 
 
311 aa  132  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.327226  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4812  transposase IS4 family protein  26.74 
 
 
363 aa  133  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3025  transposase IS4 family protein  28.77 
 
 
326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.965699  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0436  transposase IS4 family protein  28.77 
 
 
326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0489496  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0909  transposase IS4 family protein  28.77 
 
 
326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2101  transposase IS4 family protein  28.77 
 
 
326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3354  transposase IS4 family protein  28.21 
 
 
326 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0096  transposase IS4  27.56 
 
 
327 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32190  Transposase, IS4 protein  27.64 
 
 
326 aa  127  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0147  IS5 family transposase  29.41 
 
 
316 aa  125  1e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3712  transposase, IS4 family protein  27.44 
 
 
314 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.216949  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0604  transposase, IS4 family protein  27.44 
 
 
314 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3832  transposase, IS4 family protein  27.44 
 
 
314 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1714  transposase IS4 family protein  27.84 
 
 
317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1042  transposase, IS4 family protein  27.84 
 
 
317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.077617  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1156  transposase, IS4 family protein  27.84 
 
 
317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2847  transposase IS4 family protein  27.84 
 
 
317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2276  transposase, IS4  26.28 
 
 
323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05639  ISXo1 transposase  29.67 
 
 
322 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0655  transposase IS4 family protein  27.4 
 
 
311 aa  120  4.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.927973  normal  0.11164 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4027  transposase, IS4 family protein  27.03 
 
 
326 aa  120  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0970154  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1662  transposase IS4 family protein  26.14 
 
 
326 aa  119  7e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.627269  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04767  ISXo1 transposase  29.38 
 
 
322 aa  119  7.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02304  ISXo1 transposase  29.38 
 
 
322 aa  119  7.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0210  transposase IS4 family protein  26.14 
 
 
326 aa  119  9e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0489  transposase IS4 family protein  26.14 
 
 
326 aa  119  9e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0714  transposase IS4 family protein  26.14 
 
 
326 aa  119  9e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1467  transposase IS4 family protein  26.14 
 
 
326 aa  119  9e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0317213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1565  transposase IS4 family protein  26.14 
 
 
326 aa  119  9e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.004757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1627  transposase IS4 family protein  26.14 
 
 
326 aa  119  9e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0994008  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1816  transposase IS4 family protein  26.14 
 
 
326 aa  119  9e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000243459  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2310  transposase IS4 family protein  26.14 
 
 
326 aa  119  9e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0945239  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2314  transposase IS4 family protein  26.14 
 
 
326 aa  119  9e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0761785  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2619  transposase IS4 family protein  26.14 
 
 
326 aa  119  9e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2970  transposase IS4 family protein  26.14 
 
 
326 aa  119  9e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.646128  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3076  transposase IS4 family protein  26.14 
 
 
326 aa  119  9e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3325  transposase IS4 family protein  26.14 
 
 
326 aa  119  9e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3346  transposase IS4 family protein  26.14 
 
 
326 aa  119  9e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02738  ISXo1 transposase  29.38 
 
 
322 aa  119  9e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.273323  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3107  transposase IS4 family protein  26.14 
 
 
326 aa  119  9e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01080  ISXo1 transposase  29.38 
 
 
322 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000904995  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03194  ISXo1 transposase  29.38 
 
 
322 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04603  ISXo1 transposase  29.38 
 
 
322 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04676  ISXo1 transposase  29.38 
 
 
322 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04707  ISXo1 transposase  29.38 
 
 
322 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04722  ISXo1 transposase  29.38 
 
 
322 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.24864  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05689  ISXo1 transposase  29.38 
 
 
322 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>