More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0655 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0655  transposase IS4 family protein  100 
 
 
311 aa  632  1e-180  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.927973  normal  0.11164 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2748  transposase, IS4  72.99 
 
 
311 aa  476  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.327226  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4086  hypothetical protein  65.82 
 
 
207 aa  210  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.396271  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0078  transposase, IS4  36.22 
 
 
320 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.512756  normal  0.0332159 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0213  transposase, IS4  36.22 
 
 
320 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0925745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0216  transposase, IS4  36.22 
 
 
320 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0826  transposase, IS4  36.22 
 
 
320 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.33945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4411  transposase, IS4  36.22 
 
 
320 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.434109  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1226  transposase, IS4  36.22 
 
 
320 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4989  transposase IS4 family protein  35.9 
 
 
320 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2276  transposase, IS4  32.98 
 
 
323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5532  IS4 family transposase  31.35 
 
 
320 aa  135  8e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3344  transposase IS4 family protein  31.89 
 
 
336 aa  132  9e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0942  transposase, IS4  32.86 
 
 
322 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1136  ISRSO18-transposase protein  30.92 
 
 
321 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.835296  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1704  ISRSO18-transposase protein  31.58 
 
 
321 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0125656  normal  0.151951 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00284  ISXo1 transposase  29.25 
 
 
322 aa  124  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.454777  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04167  ISXo1 transposase  29.25 
 
 
322 aa  124  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2718  transposase, IS4 family protein  30.56 
 
 
330 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00012414  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01862  ISXo1 transposase  28.91 
 
 
322 aa  123  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.854322  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02738  ISXo1 transposase  29.05 
 
 
322 aa  122  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.273323  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04748  ISXo1 transposase  28.91 
 
 
322 aa  123  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588159  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00267  ISXo1 transposase  28.91 
 
 
322 aa  122  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00278  ISXo1 transposase  28.91 
 
 
322 aa  122  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04676  ISXo1 transposase  28.91 
 
 
322 aa  122  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04603  ISXo1 transposase  28.91 
 
 
322 aa  122  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04722  ISXo1 transposase  28.91 
 
 
322 aa  122  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.24864  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04707  ISXo1 transposase  28.91 
 
 
322 aa  122  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05516  ISXo1 transposase  28.91 
 
 
322 aa  122  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04850  ISXo1 transposase  28.91 
 
 
322 aa  122  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0577284  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05577  ISXo1 transposase  28.91 
 
 
322 aa  122  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.461805  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05526  ISXo1 transposase  28.91 
 
 
322 aa  122  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.423562  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05625  ISXo1 transposase  28.91 
 
 
322 aa  122  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0316217  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06088  ISXo1 transposase  28.91 
 
 
322 aa  122  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05689  ISXo1 transposase  28.91 
 
 
322 aa  122  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06239  ISXo1 transposase  28.91 
 
 
322 aa  122  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368633  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00491  ISXo1 transposase  28.91 
 
 
322 aa  122  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01080  ISXo1 transposase  28.91 
 
 
322 aa  122  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000904995  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01858  ISXo1 transposase  28.91 
 
 
322 aa  122  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03194  ISXo1 transposase  28.91 
 
 
322 aa  122  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0887  ISMca7, transposase  30.17 
 
 
316 aa  122  8e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.718258  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05639  ISXo1 transposase  28.91 
 
 
322 aa  122  8e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01751  ISXo1 transposase  28.91 
 
 
322 aa  122  8e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0096  transposase IS4  29.93 
 
 
327 aa  122  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3793  transposase family protein  29.69 
 
 
326 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04767  ISXo1 transposase  29.01 
 
 
322 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01500  ISXo1 transposase  28.91 
 
 
322 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.549499  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02304  ISXo1 transposase  29.01 
 
 
322 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04034  ISXo1 transposase  28.57 
 
 
322 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00368  ISXo1 transposase  29.01 
 
 
322 aa  120  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.161909  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0184  ISPg1, transposase  27.25 
 
 
361 aa  120  3.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0825  ISPg1, transposase  27.25 
 
 
361 aa  120  3.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1031  ISPg1, transposase  27.25 
 
 
361 aa  120  3.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000307461 
 
 
-
 
NC_002950  PG1177  ISPg1, transposase  27.25 
 
 
361 aa  120  3.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1197  ISPg1, transposase  27.25 
 
 
361 aa  120  3.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_002950  PG1448  ISPg1, transposase  27.25 
 
 
361 aa  120  3.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1624  ISPg1, transposase  27.25 
 
 
361 aa  120  3.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1906  ISPg1, transposase  27.25 
 
 
361 aa  120  3.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3460  transposase, IS4 family protein  31.09 
 
 
320 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1557  transposase, IS4 family protein  31.09 
 
 
320 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2494  transposase, IS4 family protein  31.09 
 
 
320 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0455823  decreased coverage  0.00299337 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2016  transposase, IS4 family protein  30.82 
 
 
330 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1356  transposase, IS4 family protein  30.95 
 
 
327 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0724993 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4823  transposase IS4 family protein  29 
 
 
326 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4916  transposase IS4 family protein  31.21 
 
 
324 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.387666  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32190  Transposase, IS4 protein  29.62 
 
 
326 aa  119  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3025  transposase IS4 family protein  30.99 
 
 
326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.965699  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0460  ISPg1, transposase  27.19 
 
 
361 aa  117  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.835664 
 
 
-
 
NC_002950  PG0549  ISPg1, transposase  27.19 
 
 
361 aa  117  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1244  ISPg1, transposase  27.19 
 
 
361 aa  117  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0436  transposase IS4 family protein  30.99 
 
 
326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0489496  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0569  IS5 transposase  29.75 
 
 
326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0800  IS5 transposase  29.75 
 
 
326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2101  transposase IS4 family protein  30.99 
 
 
326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0909  transposase IS4 family protein  30.99 
 
 
326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4863  transposase IS4 family protein  32.3 
 
 
330 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0853188  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0206  TIS1021 transposase  31.33 
 
 
328 aa  117  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1179  TIS1021 transposase  31.33 
 
 
328 aa  117  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4268  transposase, IS4  28.57 
 
 
330 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.45537  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3555  transposase IS4 family protein  31.61 
 
 
330 aa  116  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5692  transposase IS4 family protein  31.61 
 
 
330 aa  116  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5567  transposase IS4 family protein  31.61 
 
 
330 aa  116  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.60838 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4760  transposase IS4 family protein  31.61 
 
 
330 aa  116  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2612  transposase IS4 family protein  31.61 
 
 
330 aa  116  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5619  transposase IS4 family protein  31.61 
 
 
330 aa  116  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.659177  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5581  transposase IS4 family protein  31.61 
 
 
330 aa  116  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4057  transposase IS4 family protein  31.61 
 
 
330 aa  116  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3478  transposase IS4 family protein  31.61 
 
 
330 aa  116  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.594385 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6186  transposase IS4 family protein  31.61 
 
 
330 aa  116  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.62598 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3354  transposase IS4 family protein  30.99 
 
 
326 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01370  ISXoo6 transposase  29.9 
 
 
329 aa  115  6.9999999999999995e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0947  IS5 transposase  29.84 
 
 
326 aa  115  6.9999999999999995e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2324  transposase IS4 family protein  27.78 
 
 
348 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.552067  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00477  ISXoo6 transposase  30.07 
 
 
327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2450  transposase IS4 family protein  27.78 
 
 
348 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.348584  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04439  ISXoo6 transposase  30.31 
 
 
320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0382  ISRSO18-transposase protein  30.16 
 
 
319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0605  ISRSO18-transposase protein  30.16 
 
 
319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012005 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2598  ISRSO18-transposase protein  30.49 
 
 
319 aa  114  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0604  transposase, IS4 family protein  28.91 
 
 
314 aa  113  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>