More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4086 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4086  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  421  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.396271  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0655  transposase IS4 family protein  65.82 
 
 		 311 aa  210  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.927973  normal  0.11164 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2748  transposase, IS4  66.46 
 
 		 311 aa  208  6e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.327226  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4989  transposase IS4 family protein  39.08 
 
 		 320 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1226  transposase, IS4  42.76 
 
 		 320 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0078  transposase, IS4  42.76 
 
 		 320 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.512756  normal  0.0332159 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0213  transposase, IS4  42.76 
 
 		 320 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0925745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4411  transposase, IS4  42.76 
 
 		 320 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.434109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0826  transposase, IS4  42.76 
 
 		 320 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.33945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0216  transposase, IS4  42.76 
 
 		 320 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_002950  PG0184  ISPg1, transposase  35.29 
 
 		 361 aa  87.4  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0825  ISPg1, transposase  35.29 
 
 		 361 aa  87.4  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1031  ISPg1, transposase  35.29 
 
 		 361 aa  87.4  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000307461 
 
 
-
 
NC_002950  PG1177  ISPg1, transposase  35.29 
 
 		 361 aa  87.4  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1197  ISPg1, transposase  35.29 
 
 		 361 aa  87.4  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_002950  PG1448  ISPg1, transposase  35.29 
 
 		 361 aa  87.4  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1624  ISPg1, transposase  35.29 
 
 		 361 aa  87.4  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1906  ISPg1, transposase  35.29 
 
 		 361 aa  87.4  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0460  ISPg1, transposase  35.29 
 
 		 361 aa  87.4  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.835664 
 
 
-
 
NC_002950  PG0549  ISPg1, transposase  35.29 
 
 		 361 aa  87.4  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1244  ISPg1, transposase  35.29 
 
 		 361 aa  87.4  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1704  ISRSO18-transposase protein  33.97 
 
 		 321 aa  87  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0125656  normal  0.151951 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3344  transposase IS4 family protein  29.73 
 
 		 336 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2718  transposase, IS4 family protein  31.64 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00012414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1557  transposase, IS4 family protein  31.4 
 
 		 320 aa  83.2  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2494  transposase, IS4 family protein  31.4 
 
 		 320 aa  83.2  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0455823  decreased coverage  0.00299337 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3460  transposase, IS4 family protein  31.4 
 
 		 320 aa  83.2  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1356  transposase, IS4 family protein  33.33 
 
 		 327 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0724993 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0942  transposase, IS4  33.76 
 
 		 322 aa  82  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2276  transposase, IS4  32.1 
 
 		 323 aa  82  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0714  hypothetical protein  35.11 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.76992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4863  transposase IS4 family protein  38.46 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0853188  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3793  transposase family protein  32.3 
 
 		 326 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1136  ISRSO18-transposase protein  33.33 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.835296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2295  transposase IS4 family protein  32.72 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0556761  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3395  transposase, IS4 family protein  32.64 
 
 		 328 aa  78.6  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_002950  PG1320  ISPg1, transposase, internal deletion  34.4 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5581  transposase IS4 family protein  35.56 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4057  transposase IS4 family protein  35.56 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3478  transposase IS4 family protein  35.56 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.594385 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5692  transposase IS4 family protein  35.56 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2612  transposase IS4 family protein  35.56 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4760  transposase IS4 family protein  35.56 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6186  transposase IS4 family protein  35.56 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.62598 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5567  transposase IS4 family protein  35.56 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.60838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4823  transposase IS4 family protein  31.33 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5619  transposase IS4 family protein  35.56 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.659177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3555  transposase IS4 family protein  35.56 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0206  TIS1021 transposase  35.57 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1179  TIS1021 transposase  35.57 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1714  transposase IS4 family protein  30.59 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0947  IS5 transposase  35.83 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2847  transposase IS4 family protein  30.59 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1042  transposase, IS4 family protein  30.59 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.077617  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2350  ISPsy10, transposase, truncation  35.38 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4027  transposase, IS4 family protein  29.3 
 
 		 326 aa  76.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0970154  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1156  transposase, IS4 family protein  30.59 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3832  transposase, IS4 family protein  28.86 
 
 		 314 aa  76.3  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0603  transposase, IS4 family protein  28.97 
 
 		 314 aa  76.3  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3712  transposase, IS4 family protein  28.86 
 
 		 314 aa  76.3  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.216949  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0604  transposase, IS4 family protein  28.86 
 
 		 314 aa  76.3  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0800  IS5 transposase  34.96 
 
 		 326 aa  75.9  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0569  IS5 transposase  34.96 
 
 		 326 aa  75.9  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24590  ISPssy, transposase  32.61 
 
 		 177 aa  75.1  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1753  transposase, IS4 family protein  31.65 
 
 		 327 aa  75.1  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.808639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3838  transposase, IS4 family protein  29.81 
 
 		 326 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000231978 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0096  transposase IS4  32.08 
 
 		 327 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5648  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1665  transposase IS4 family protein  28.17 
 
 		 367 aa  73.6  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.114037  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01501  ISXoo6 transposase  33.59 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.543852  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3354  transposase IS4 family protein  31.16 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02304  ISXo1 transposase  33.59 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04767  ISXo1 transposase  33.59 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01747  IS5 transposase  30.71 
 
 		 326 aa  72.8  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.548346  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02453  IS5 transposase  30.71 
 
 		 326 aa  72.8  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0522589  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4916  transposase IS4 family protein  31.9 
 
 		 324 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.387666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04439  ISXoo6 transposase  33.81 
 
 		 320 aa  72.4  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00368  ISXo1 transposase  32.82 
 
 		 322 aa  72  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.161909  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5532  IS4 family transposase  32.08 
 
 		 320 aa  72.4  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04707  ISXo1 transposase  32.82 
 
 		 322 aa  72  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04676  ISXo1 transposase  32.82 
 
 		 322 aa  72  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04748  ISXo1 transposase  32.82 
 
 		 322 aa  72  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588159  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04722  ISXo1 transposase  32.82 
 
 		 322 aa  72  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.24864  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04850  ISXo1 transposase  32.82 
 
 		 322 aa  72  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0577284  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05526  ISXo1 transposase  32.82 
 
 		 322 aa  72  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.423562  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05577  ISXo1 transposase  32.82 
 
 		 322 aa  72  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.461805  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05625  ISXo1 transposase  32.82 
 
 		 322 aa  72  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0316217  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06088  ISXo1 transposase  32.82 
 
 		 322 aa  72  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05689  ISXo1 transposase  32.82 
 
 		 322 aa  72  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06239  ISXo1 transposase  32.82 
 
 		 322 aa  72  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368633  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0436  transposase IS4 family protein  30.43 
 
 		 326 aa  72  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0489496  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00284  ISXo1 transposase  32.82 
 
 		 322 aa  72  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.454777  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01080  ISXo1 transposase  32.82 
 
 		 322 aa  72  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000904995  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00491  ISXo1 transposase  32.82 
 
 		 322 aa  72  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01858  ISXo1 transposase  32.82 
 
 		 322 aa  72  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01751  ISXo1 transposase  32.82 
 
 		 322 aa  72  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03194  ISXo1 transposase  32.82 
 
 		 322 aa  72  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01862  ISXo1 transposase  32.82 
 
 		 322 aa  72  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.854322  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04034  ISXo1 transposase  32.82 
 
 		 322 aa  72  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04603  ISXo1 transposase  32.82 
 
 		 322 aa  72  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>