77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3425 on replicon NC_009468
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009468  Acry_3425  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
233 aa  481  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5109  IS4 family transposase  61.74 
 
 
358 aa  284  9e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0975401  normal  0.0840327 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1747  transposase IS4 family protein  51.08 
 
 
359 aa  231  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.25501  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4812  transposase IS4 family protein  53.02 
 
 
363 aa  229  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0775  hypothetical protein  78.45 
 
 
152 aa  194  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.894102  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2457  transposase IS4 family protein  37 
 
 
338 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000063174  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2638  transposase IS4 family protein  37 
 
 
338 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0500483  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3091  transposase IS4 family protein  37 
 
 
338 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5319  transposase IS4 family protein  38.03 
 
 
353 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.316405 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2450  transposase IS4 family protein  35.4 
 
 
348 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.348584  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2324  transposase IS4 family protein  35.4 
 
 
348 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.552067  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0955  transposase IS4 family protein  35.37 
 
 
360 aa  123  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3123  transposase IS4 family protein  35.37 
 
 
360 aa  123  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0222  transposase IS4 family protein  35.4 
 
 
348 aa  123  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0712  transposase IS4 family protein  35.93 
 
 
352 aa  123  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1665  transposase IS4 family protein  34.51 
 
 
367 aa  122  4e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.114037  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0337  transposase IS4 family protein  36.56 
 
 
345 aa  121  7e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24710  Transposase, IS4  36.65 
 
 
335 aa  121  7e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0260  transposase IS4 family protein  36.56 
 
 
345 aa  121  9e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0777  hypothetical protein  92.19 
 
 
68 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.817177  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2971  IS1246 transposase  35.68 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16640  Transposase, IS4  36.2 
 
 
335 aa  119  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24660  Transposase, IS4  36.2 
 
 
335 aa  119  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26840  Transposase, IS4  36.2 
 
 
335 aa  119  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36450  Transposase, IS4  36.2 
 
 
335 aa  119  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49770  IS4 family transposase  36.2 
 
 
335 aa  119  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0829  transposase IS4 family protein  35.5 
 
 
352 aa  118  9e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1943  transposase IS4 family protein  34.96 
 
 
345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0044381  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0479  transposase IS4 family protein  34.96 
 
 
345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1196  IS5 family transposase  35.68 
 
 
334 aa  107  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.107807  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0147  IS5 family transposase  32.74 
 
 
316 aa  95.9  4e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3159  hypothetical protein  75.41 
 
 
90 aa  95.5  6e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0318  transposase IS4 family protein  35.16 
 
 
314 aa  90.5  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.356657  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1361  transposase IS4 family protein  39.52 
 
 
240 aa  79.3  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.873798  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4989  transposase IS4 family protein  30.45 
 
 
320 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0078  transposase, IS4  29.55 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.512756  normal  0.0332159 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0213  transposase, IS4  29.55 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0925745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4411  transposase, IS4  29.55 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.434109  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0216  transposase, IS4  29.55 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0826  transposase, IS4  29.55 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.33945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1226  transposase, IS4  29.55 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3344  transposase IS4 family protein  28.23 
 
 
336 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4916  transposase IS4 family protein  29.54 
 
 
324 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.387666  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0549  ISPg1, transposase  25.63 
 
 
361 aa  59.3  0.00000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0460  ISPg1, transposase  25.63 
 
 
361 aa  59.3  0.00000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.835664 
 
 
-
 
NC_002950  PG1244  ISPg1, transposase  25.63 
 
 
361 aa  59.3  0.00000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2759  transposase (class II)  54.17 
 
 
174 aa  58.9  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.195506  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2276  transposase, IS4  29.78 
 
 
323 aa  56.6  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1906  ISPg1, transposase  25.63 
 
 
361 aa  55.5  0.0000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1624  ISPg1, transposase  25.63 
 
 
361 aa  55.5  0.0000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1448  ISPg1, transposase  25.63 
 
 
361 aa  55.5  0.0000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1197  ISPg1, transposase  25.63 
 
 
361 aa  55.5  0.0000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_002950  PG1177  ISPg1, transposase  25.63 
 
 
361 aa  55.5  0.0000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1031  ISPg1, transposase  25.63 
 
 
361 aa  55.5  0.0000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000307461 
 
 
-
 
NC_002950  PG0825  ISPg1, transposase  25.63 
 
 
361 aa  55.5  0.0000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0184  ISPg1, transposase  25.63 
 
 
361 aa  55.5  0.0000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5532  IS4 family transposase  37.31 
 
 
320 aa  53.9  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4268  transposase, IS4  24.51 
 
 
330 aa  52  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.45537  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0942  transposase, IS4  27.71 
 
 
322 aa  51.6  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04450  transposase  29.01 
 
 
178 aa  51.2  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.468258  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1042  transposase, IS4 family protein  26.36 
 
 
317 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.077617  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1156  transposase, IS4 family protein  26.36 
 
 
317 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1714  transposase IS4 family protein  26.36 
 
 
317 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2847  transposase IS4 family protein  26.36 
 
 
317 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2748  transposase, IS4  30.86 
 
 
311 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.327226  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4149  transposase, IS4  23.83 
 
 
358 aa  49.7  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4261  transposase, IS4  23.83 
 
 
349 aa  49.7  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0257321  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2774  transposase, degenerate  31.87 
 
 
80 aa  49.3  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.142274  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4041  transposase, IS4  23.83 
 
 
445 aa  48.9  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.923218  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0604  transposase, IS4 family protein  25.57 
 
 
314 aa  48.9  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3712  transposase, IS4 family protein  25.57 
 
 
314 aa  48.9  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.216949  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3832  transposase, IS4 family protein  25.57 
 
 
314 aa  48.9  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0655  transposase IS4 family protein  25.25 
 
 
311 aa  47.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.927973  normal  0.11164 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4027  transposase, IS4 family protein  25.11 
 
 
326 aa  45.8  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0970154  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3354  transposase IS4 family protein  29.55 
 
 
326 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4142  IS4 family transposase  25 
 
 
326 aa  42.4  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.282209 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0096  transposase IS4  25.11 
 
 
327 aa  42  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>