32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2774 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2774  transposase, degenerate  100 
 
 		 80 aa  169  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.142274  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2457  transposase IS4 family protein  52.7 
 
 		 338 aa  83.6  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000063174  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2638  transposase IS4 family protein  52.7 
 
 		 338 aa  83.6  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0500483  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3091  transposase IS4 family protein  52.7 
 
 		 338 aa  83.6  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0712  transposase IS4 family protein  52.94 
 
 		 352 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0829  transposase IS4 family protein  51.47 
 
 		 352 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1361  transposase IS4 family protein  46.67 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.873798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0337  transposase IS4 family protein  47.3 
 
 		 345 aa  74.7  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0260  transposase IS4 family protein  47.3 
 
 		 345 aa  74.7  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0318  transposase IS4 family protein  47.3 
 
 		 314 aa  74.7  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.356657  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0222  transposase IS4 family protein  44 
 
 		 348 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2324  transposase IS4 family protein  50 
 
 		 348 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.552067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2450  transposase IS4 family protein  50 
 
 		 348 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.348584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1665  transposase IS4 family protein  47.06 
 
 		 367 aa  72.4  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.114037  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2971  IS1246 transposase  44.44 
 
 		 280 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24710  Transposase, IS4  46.48 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24660  Transposase, IS4  47.89 
 
 		 335 aa  65.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26840  Transposase, IS4  47.89 
 
 		 335 aa  65.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16640  Transposase, IS4  47.89 
 
 		 335 aa  65.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36450  Transposase, IS4  47.89 
 
 		 335 aa  65.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49770  IS4 family transposase  47.89 
 
 		 335 aa  65.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1943  transposase IS4 family protein  40.85 
 
 		 345 aa  64.7  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0044381  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0479  transposase IS4 family protein  40.85 
 
 		 345 aa  64.7  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4812  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 		 363 aa  64.3  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3123  transposase IS4 family protein  38.36 
 
 		 360 aa  59.7  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0955  transposase IS4 family protein  38.36 
 
 		 360 aa  59.7  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0147  IS5 family transposase  37.84 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5319  transposase IS4 family protein  40.32 
 
 		 353 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.316405 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1196  IS5 family transposase  39.19 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.107807  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1747  transposase IS4 family protein  31.87 
 
 		 359 aa  55.5  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.25501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5109  IS4 family transposase  33.33 
 
 		 358 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0975401  normal  0.0840327 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3425  transposase, IS4 family protein  31.87 
 
 		 233 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>