46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0775 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0775  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  312  8e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.894102  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3425  transposase, IS4 family protein  78.45 
 
 
233 aa  194  5.000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5109  IS4 family transposase  56.52 
 
 
358 aa  128  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0975401  normal  0.0840327 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4812  transposase IS4 family protein  49.58 
 
 
363 aa  107  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1747  transposase IS4 family protein  42.11 
 
 
359 aa  97.8  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.25501  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5319  transposase IS4 family protein  39.64 
 
 
353 aa  74.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.316405 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3091  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 
338 aa  66.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2638  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 
338 aa  66.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0500483  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2457  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 
338 aa  66.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000063174  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1665  transposase IS4 family protein  32 
 
 
367 aa  57  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.114037  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2450  transposase IS4 family protein  31.96 
 
 
348 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.348584  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2324  transposase IS4 family protein  31.96 
 
 
348 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.552067  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24710  Transposase, IS4  34.02 
 
 
335 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26840  Transposase, IS4  34.02 
 
 
335 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36450  Transposase, IS4  34.02 
 
 
335 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49770  IS4 family transposase  34.02 
 
 
335 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16640  Transposase, IS4  34.02 
 
 
335 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24660  Transposase, IS4  34.02 
 
 
335 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0318  transposase IS4 family protein  30.56 
 
 
314 aa  54.3  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.356657  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0337  transposase IS4 family protein  30.56 
 
 
345 aa  54.3  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0260  transposase IS4 family protein  30.56 
 
 
345 aa  54.3  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0222  transposase IS4 family protein  30.09 
 
 
348 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0955  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 
360 aa  53.5  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0712  transposase IS4 family protein  32.99 
 
 
352 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3123  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 
360 aa  53.5  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0829  transposase IS4 family protein  30.09 
 
 
352 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0479  transposase IS4 family protein  29.63 
 
 
345 aa  50.8  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1943  transposase IS4 family protein  29.63 
 
 
345 aa  50.8  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0044381  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2971  IS1246 transposase  29.59 
 
 
280 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1196  IS5 family transposase  34.52 
 
 
334 aa  48.9  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.107807  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0147  IS5 family transposase  35.16 
 
 
316 aa  45.4  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3344  transposase IS4 family protein  30.85 
 
 
336 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4989  transposase IS4 family protein  34.29 
 
 
320 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4411  transposase, IS4  34.29 
 
 
320 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.434109  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1226  transposase, IS4  34.29 
 
 
320 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0826  transposase, IS4  34.29 
 
 
320 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.33945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0216  transposase, IS4  34.29 
 
 
320 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0213  transposase, IS4  34.29 
 
 
320 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0925745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0078  transposase, IS4  34.29 
 
 
320 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.512756  normal  0.0332159 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1323  transposase IS4 family protein  28.12 
 
 
508 aa  40.4  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.555247  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1387  transposase IS4 family protein  28.12 
 
 
508 aa  40.4  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.311179  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1399  transposase IS4 family protein  28.12 
 
 
508 aa  40.4  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.943473  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1477  transposase IS4 family protein  28.12 
 
 
508 aa  40.4  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1487  transposase IS4 family protein  28.12 
 
 
508 aa  40.4  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.0024926  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1842  transposase IS4 family protein  28.12 
 
 
508 aa  40.4  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2032  transposase IS4 family protein  27.87 
 
 
508 aa  40.4  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.214067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>