More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1803 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6134  transposase IS4 family protein  86.07 
 
 
368 aa  672    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.647313  normal  0.885579 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4959  transposase IS4 family protein  85.79 
 
 
368 aa  671    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428493  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6786  transposase IS4 family protein  84.15 
 
 
368 aa  655    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1803  putative transposase  100 
 
 
368 aa  766    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4885  transposase IS4 family protein  60.7 
 
 
368 aa  455  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4153  transposase ISRme1  60.16 
 
 
366 aa  439  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.504697 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1171  IS4 family transposase  60.16 
 
 
366 aa  439  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.56171 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4228  transposase ISRme1  60.16 
 
 
366 aa  439  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00917968  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3353  IS4 family transposase  60.16 
 
 
366 aa  439  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5975  IS4 family transposase  60.7 
 
 
366 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.682409  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3230  transposase IS4 family protein  59.78 
 
 
367 aa  431  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.431126  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3889  transposase, IS4  62.02 
 
 
367 aa  421  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00235  putative ISXoo14 transposase  57.97 
 
 
365 aa  421  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0987  transposase, IS4  62.02 
 
 
367 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3131  transposase, IS4  61.48 
 
 
367 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347053  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5376  transposase, IS4  61.48 
 
 
367 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.490407  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3700  transposase, IS4  62.02 
 
 
367 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3687  transposase, IS4  62.02 
 
 
367 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2726  transposase, IS4  62.02 
 
 
367 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0495453  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3984  transposase, IS4  62.02 
 
 
367 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2770  transposase, IS4  62.02 
 
 
367 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1112  transposase, IS4  62.02 
 
 
367 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.325371  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3098  transposase, IS4  62.02 
 
 
367 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2594  transposase, IS4  61.48 
 
 
367 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2279  transposase, IS4  61.48 
 
 
367 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5596  transposase, IS4  61.48 
 
 
367 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5505  transposase, IS4 family protein  61.48 
 
 
367 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.60603  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2894  transposase, IS4 family protein  61.48 
 
 
367 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.457818  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1527  transposase, IS4  61.48 
 
 
367 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.717674  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6302  transposase, IS4 family protein  61.48 
 
 
367 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.801327 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5960  transposase, IS4 family protein  61.48 
 
 
367 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0771683 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00514  putative ISXoo14 transposase  58.61 
 
 
333 aa  378  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0342548  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02785  putative ISXoo14 transposase  56.51 
 
 
369 aa  372  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2772  ISGsu3, transposase  49.73 
 
 
362 aa  360  2e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2168  transposase, IS4  53.28 
 
 
366 aa  355  7.999999999999999e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.238923  normal  0.543726 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2105  transposase, IS4  53.28 
 
 
366 aa  353  4e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2694  transposase IS4 family protein  50 
 
 
360 aa  351  1e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00558684  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2311  transposase IS4 family protein  50 
 
 
360 aa  351  1e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000514015  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0006  transposase IS4 family protein  50 
 
 
360 aa  351  1e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0155  transposase IS4 family protein  50 
 
 
360 aa  351  1e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.193829  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0440  transposase IS4 family protein  50 
 
 
360 aa  351  1e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2513  transposase IS4 family protein  50 
 
 
360 aa  351  1e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000127835  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0839  transposase IS4 family protein  50 
 
 
360 aa  351  1e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000787198  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3116  transposase IS4 family protein  50 
 
 
360 aa  351  1e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000441936  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1681  transposase IS4 family protein  50 
 
 
360 aa  351  1e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0330564  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0559  ISGsu2, transposase  49.32 
 
 
361 aa  347  2e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360108  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1297  ISGsu2, transposase  49.32 
 
 
361 aa  347  2e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274953  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2597  ISGsu2, transposase  49.32 
 
 
361 aa  347  2e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7153  transposase  49.87 
 
 
369 aa  345  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3911  transposase  49.87 
 
 
369 aa  345  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.664589  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6919  transposase  49.87 
 
 
369 aa  345  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.439237 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3654  transposase, IS4  48.78 
 
 
369 aa  335  5e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.258841  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5660  transposase IS4 family protein  50.14 
 
 
365 aa  335  5e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.633118  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3552  transposase, IS4  48.78 
 
 
369 aa  335  5e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3440  transposase, IS4  48.78 
 
 
369 aa  335  5e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0308754  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3414  transposase, IS4  48.78 
 
 
369 aa  335  5e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3391  transposase, IS4  48.78 
 
 
369 aa  335  5e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.401653  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0512  transposase, IS4  48.78 
 
 
369 aa  335  5e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.692808  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0701  transposase, IS4  48.78 
 
 
369 aa  335  5e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1095  transposase, IS4  48.78 
 
 
369 aa  335  5e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1135  transposase, IS4  48.78 
 
 
369 aa  335  5e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.064838  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1473  transposase, IS4  48.78 
 
 
369 aa  335  5e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282239  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1498  transposase, IS4  48.78 
 
 
369 aa  335  5e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1653  transposase, IS4  48.78 
 
 
369 aa  335  5e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.891331  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1821  transposase, IS4  48.78 
 
 
369 aa  335  5e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2160  transposase, IS4  48.78 
 
 
369 aa  335  5e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.591575  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2596  transposase, IS4  48.78 
 
 
369 aa  335  5e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3113  transposase, IS4  48.78 
 
 
369 aa  335  5e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3140  transposase, IS4  48.78 
 
 
369 aa  335  5e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3290  transposase, IS4  48.78 
 
 
369 aa  335  5e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0283  transposase IS4  50.95 
 
 
358 aa  335  1e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1069  transposase IS4  50.95 
 
 
358 aa  335  1e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0456377 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2091  transposase IS4  50.95 
 
 
358 aa  335  1e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000396436  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2240  transposase IS4  50.95 
 
 
358 aa  335  1e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000126004 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2488  transposase IS4  50.95 
 
 
358 aa  335  1e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2883  transposase IS4  50.95 
 
 
358 aa  335  1e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00446649 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1266  transposase, IS4  51.59 
 
 
340 aa  332  9e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1433  transposase, IS4 family protein  46.08 
 
 
405 aa  332  9e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0419  transposase, IS4 family protein  47.68 
 
 
364 aa  320  3e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3283  transposase IS4  51.3 
 
 
337 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0050  ISMca1, transposase  49.04 
 
 
366 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0096  ISMca1, transposase  49.04 
 
 
366 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0227  ISMca1, transposase  49.04 
 
 
366 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0751226  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0307  ISMca1, transposase  49.04 
 
 
366 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0723  ISMca1, transposase  49.04 
 
 
366 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.619399  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0980  ISMca1, transposase  49.04 
 
 
366 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1090  ISMca1, transposase  49.04 
 
 
366 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1177  ISMca1, transposase  49.04 
 
 
366 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1197  ISMca1, transposase  49.04 
 
 
366 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1312  ISMca1, transposase  49.04 
 
 
366 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1514  ISMca1, transposase  49.04 
 
 
366 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.332926  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1517  ISMca1, transposase  49.04 
 
 
366 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1580  ISMca1, transposase  49.04 
 
 
366 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1956  ISMca1, transposase  49.04 
 
 
366 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725664  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2178  ISMca1, transposase  49.04 
 
 
366 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2511  ISMca1, transposase  49.04 
 
 
366 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229212  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2556  ISMca1, transposase  49.04 
 
 
366 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.186429  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2687  prophage LambdaMc01, ISMca1, transposase  49.04 
 
 
366 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.765288  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2810  ISMca1, transposase  49.04 
 
 
366 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2964  ISMca1, transposase  49.04 
 
 
366 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>