More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0512 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7153  transposase  87.26 
 
 
369 aa  660    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0512  transposase, IS4  100 
 
 
369 aa  755    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.692808  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0701  transposase, IS4  100 
 
 
369 aa  755    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1095  transposase, IS4  100 
 
 
369 aa  755    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1135  transposase, IS4  100 
 
 
369 aa  755    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.064838  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1473  transposase, IS4  100 
 
 
369 aa  755    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282239  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1498  transposase, IS4  100 
 
 
369 aa  755    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1653  transposase, IS4  100 
 
 
369 aa  755    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.891331  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1821  transposase, IS4  100 
 
 
369 aa  755    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2160  transposase, IS4  100 
 
 
369 aa  755    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.591575  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2596  transposase, IS4  100 
 
 
369 aa  755    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3113  transposase, IS4  100 
 
 
369 aa  755    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3140  transposase, IS4  100 
 
 
369 aa  755    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3290  transposase, IS4  100 
 
 
369 aa  755    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3391  transposase, IS4  100 
 
 
369 aa  755    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.401653  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3414  transposase, IS4  100 
 
 
369 aa  755    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3440  transposase, IS4  100 
 
 
369 aa  755    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0308754  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3552  transposase, IS4  100 
 
 
369 aa  755    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3654  transposase, IS4  100 
 
 
369 aa  755    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.258841  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3911  transposase  87.26 
 
 
369 aa  660    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.664589  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6919  transposase  87.26 
 
 
369 aa  660    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.439237 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1690  ISGsu2, transposase  100 
 
 
267 aa  529  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0288166  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1376  ISGsu2, transposase  100 
 
 
268 aa  509  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0014  transposase, IS4  100 
 
 
241 aa  495  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0462942  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0246  transposase, IS4  100 
 
 
241 aa  495  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.261546  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2500  transposase, IS4  100 
 
 
241 aa  495  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5660  transposase IS4 family protein  63.44 
 
 
365 aa  457  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.633118  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1266  transposase, IS4  63.58 
 
 
340 aa  431  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2168  transposase, IS4  58.27 
 
 
366 aa  425  1e-118  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.238923  normal  0.543726 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2105  transposase, IS4  57.99 
 
 
366 aa  420  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1433  transposase, IS4 family protein  50.85 
 
 
405 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0559  ISGsu2, transposase  51.65 
 
 
361 aa  379  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360108  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1297  ISGsu2, transposase  51.65 
 
 
361 aa  379  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274953  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2597  ISGsu2, transposase  51.65 
 
 
361 aa  379  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0440  transposase IS4 family protein  51.37 
 
 
360 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3116  transposase IS4 family protein  51.37 
 
 
360 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000441936  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0155  transposase IS4 family protein  51.37 
 
 
360 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.193829  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2311  transposase IS4 family protein  51.37 
 
 
360 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000514015  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1681  transposase IS4 family protein  51.37 
 
 
360 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0330564  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0006  transposase IS4 family protein  51.37 
 
 
360 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2694  transposase IS4 family protein  51.37 
 
 
360 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00558684  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2513  transposase IS4 family protein  51.37 
 
 
360 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000127835  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0839  transposase IS4 family protein  51.37 
 
 
360 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000787198  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0419  transposase, IS4 family protein  52.93 
 
 
364 aa  370  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3331  transposase, IS4 family protein  50.42 
 
 
362 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  0.0435671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3613  transposase, IS4 family protein  50.42 
 
 
362 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3918  transposase, IS4 family protein  50.42 
 
 
362 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1431  transposase, IS4 family protein  50.42 
 
 
362 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.771105 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3703  transposase, IS4 family protein  50.42 
 
 
362 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.757011  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3410  transposase, IS4 family protein  50.42 
 
 
362 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1519  transposase, IS4 family protein  50.42 
 
 
362 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2122  transposase, IS4 family protein  50.42 
 
 
362 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.973511  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1916  transposase, IS4 family protein  50.42 
 
 
362 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.176419  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2866  transposase, IS4 family protein  50.42 
 
 
362 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.953499  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3184  transposase, IS4 family protein  50.42 
 
 
362 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2685  transposase, IS4 family protein  50.42 
 
 
362 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.235088  normal  0.541519 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1871  transposase, IS4 family protein  50.42 
 
 
362 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.85058  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0806  transposase, IS4 family protein  50.42 
 
 
362 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0089  transposase, IS4 family protein  50.42 
 
 
362 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0576  transposase, IS4 family protein  50.42 
 
 
362 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.78227  normal  0.0868679 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0754  transposase, IS4 family protein  50.42 
 
 
362 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1230  transposase, IS4 family protein  50.42 
 
 
362 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2772  ISGsu3, transposase  49.86 
 
 
362 aa  355  5e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0222  transposase IS4 family protein  50.14 
 
 
362 aa  354  1e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2015  transposase IS4 family protein  50.14 
 
 
362 aa  354  1e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1337  transposase IS4 family protein  50.14 
 
 
362 aa  354  1e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0686  transposase IS4 family protein  50.14 
 
 
362 aa  354  1e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.278758  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0283  transposase IS4  52.2 
 
 
358 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1069  transposase IS4  52.2 
 
 
358 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0456377 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2091  transposase IS4  52.2 
 
 
358 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000396436  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2240  transposase IS4  52.2 
 
 
358 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000126004 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2488  transposase IS4  52.2 
 
 
358 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2883  transposase IS4  52.2 
 
 
358 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00446649 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3706  transposase, IS4 family protein  47.83 
 
 
354 aa  349  4e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3889  transposase, IS4  52.85 
 
 
367 aa  349  5e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2726  transposase, IS4  52.85 
 
 
367 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0495453  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3098  transposase, IS4  52.85 
 
 
367 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3700  transposase, IS4  52.85 
 
 
367 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3984  transposase, IS4  52.85 
 
 
367 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3687  transposase, IS4  52.85 
 
 
367 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0987  transposase, IS4  52.85 
 
 
367 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2770  transposase, IS4  52.85 
 
 
367 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1112  transposase, IS4  52.85 
 
 
367 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.325371  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1527  transposase, IS4  52.57 
 
 
367 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.717674  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2279  transposase, IS4  52.57 
 
 
367 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2594  transposase, IS4  52.57 
 
 
367 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3131  transposase, IS4  52.57 
 
 
367 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347053  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5376  transposase, IS4  52.57 
 
 
367 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.490407  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5596  transposase, IS4  52.57 
 
 
367 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2894  transposase, IS4 family protein  52.57 
 
 
367 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.457818  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5505  transposase, IS4 family protein  52.57 
 
 
367 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.60603  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5960  transposase, IS4 family protein  52.57 
 
 
367 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0771683 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6302  transposase, IS4 family protein  52.57 
 
 
367 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.801327 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6134  transposase IS4 family protein  49.2 
 
 
368 aa  342  7e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.647313  normal  0.885579 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4959  transposase IS4 family protein  48.93 
 
 
368 aa  340  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428493  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0050  ISMca1, transposase  48.91 
 
 
366 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1177  ISMca1, transposase  48.91 
 
 
366 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1197  ISMca1, transposase  48.91 
 
 
366 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2810  ISMca1, transposase  48.91 
 
 
366 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2964  ISMca1, transposase  48.91 
 
 
366 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>