More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00235 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02785  putative ISXoo14 transposase  98.23 
 
 		 369 aa  689    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00514  putative ISXoo14 transposase  99.1 
 
 		 333 aa  681    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0342548  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00235  putative ISXoo14 transposase  100 
 
 		 365 aa  755    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4885  transposase IS4 family protein  71.63 
 
 		 368 aa  545  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5975  IS4 family transposase  70.64 
 
 		 366 aa  530  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.682409  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3230  transposase IS4 family protein  70.33 
 
 		 367 aa  530  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.431126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1171  IS4 family transposase  70.64 
 
 		 366 aa  525  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.56171 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3353  IS4 family transposase  70.64 
 
 		 366 aa  525  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4153  transposase ISRme1  70.64 
 
 		 366 aa  525  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.504697 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4228  transposase ISRme1  70.64 
 
 		 366 aa  525  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00917968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6134  transposase IS4 family protein  58.79 
 
 		 368 aa  430  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.647313  normal  0.885579 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4959  transposase IS4 family protein  58.79 
 
 		 368 aa  430  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6786  transposase IS4 family protein  58.24 
 
 		 368 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1803  putative transposase  58.52 
 
 		 368 aa  411  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3131  transposase, IS4  53.51 
 
 		 367 aa  359  4e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347053  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5376  transposase, IS4  53.51 
 
 		 367 aa  359  4e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.490407  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3889  transposase, IS4  54.72 
 
 		 367 aa  358  6e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2726  transposase, IS4  54.44 
 
 		 367 aa  358  6e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0495453  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0987  transposase, IS4  54.44 
 
 		 367 aa  358  6e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3687  transposase, IS4  54.44 
 
 		 367 aa  358  6e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2770  transposase, IS4  54.44 
 
 		 367 aa  358  6e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3700  transposase, IS4  54.44 
 
 		 367 aa  358  6e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3098  transposase, IS4  54.44 
 
 		 367 aa  358  6e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3984  transposase, IS4  54.44 
 
 		 367 aa  358  6e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1112  transposase, IS4  54.44 
 
 		 367 aa  358  6e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.325371  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1527  transposase, IS4  54.44 
 
 		 367 aa  358  7e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.717674  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2279  transposase, IS4  54.44 
 
 		 367 aa  358  7e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2594  transposase, IS4  54.44 
 
 		 367 aa  358  7e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5596  transposase, IS4  54.44 
 
 		 367 aa  358  7e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2894  transposase, IS4 family protein  54.44 
 
 		 367 aa  358  7e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.457818  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5505  transposase, IS4 family protein  54.44 
 
 		 367 aa  358  7e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.60603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5960  transposase, IS4 family protein  54.44 
 
 		 367 aa  358  7e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0771683 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6302  transposase, IS4 family protein  54.44 
 
 		 367 aa  358  7e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.801327 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0559  ISGsu2, transposase  50.27 
 
 		 361 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360108  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1297  ISGsu2, transposase  50.27 
 
 		 361 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274953  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2597  ISGsu2, transposase  50.27 
 
 		 361 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3116  transposase IS4 family protein  50.55 
 
 		 360 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000441936  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2311  transposase IS4 family protein  50.55 
 
 		 360 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000514015  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0440  transposase IS4 family protein  50.55 
 
 		 360 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0839  transposase IS4 family protein  50.55 
 
 		 360 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000787198  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2694  transposase IS4 family protein  50.55 
 
 		 360 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00558684  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2513  transposase IS4 family protein  50.55 
 
 		 360 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000127835  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1681  transposase IS4 family protein  50.55 
 
 		 360 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0330564  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0006  transposase IS4 family protein  50.55 
 
 		 360 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0155  transposase IS4 family protein  50.55 
 
 		 360 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.193829  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2168  transposase, IS4  50.96 
 
 		 366 aa  339  5e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.238923  normal  0.543726 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2105  transposase, IS4  50.96 
 
 		 366 aa  335  5.999999999999999e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2772  ISGsu3, transposase  47.81 
 
 		 362 aa  333  4e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4641  transposase, IS4  74.07 
 
 		 222 aa  331  1e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.395706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1433  transposase, IS4 family protein  46 
 
 		 405 aa  324  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1266  transposase, IS4  50.58 
 
 		 340 aa  317  2e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5660  transposase IS4 family protein  47.67 
 
 		 365 aa  316  3e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.633118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7153  transposase  47.95 
 
 		 369 aa  314  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3911  transposase  47.95 
 
 		 369 aa  314  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.664589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6919  transposase  47.95 
 
 		 369 aa  314  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.439237 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0283  transposase IS4  48.75 
 
 		 358 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1069  transposase IS4  48.75 
 
 		 358 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0456377 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2091  transposase IS4  48.75 
 
 		 358 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000396436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2240  transposase IS4  48.75 
 
 		 358 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000126004 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2488  transposase IS4  48.75 
 
 		 358 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2883  transposase IS4  48.75 
 
 		 358 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00446649 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0512  transposase, IS4  46.74 
 
 		 369 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.692808  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0701  transposase, IS4  46.74 
 
 		 369 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1095  transposase, IS4  46.74 
 
 		 369 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1135  transposase, IS4  46.74 
 
 		 369 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.064838  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1473  transposase, IS4  46.74 
 
 		 369 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282239  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1498  transposase, IS4  46.74 
 
 		 369 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1653  transposase, IS4  46.74 
 
 		 369 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.891331  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1821  transposase, IS4  46.74 
 
 		 369 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2160  transposase, IS4  46.74 
 
 		 369 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.591575  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2596  transposase, IS4  46.74 
 
 		 369 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3113  transposase, IS4  46.74 
 
 		 369 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3140  transposase, IS4  46.74 
 
 		 369 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3290  transposase, IS4  46.74 
 
 		 369 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3391  transposase, IS4  46.74 
 
 		 369 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.401653  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3414  transposase, IS4  46.74 
 
 		 369 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3440  transposase, IS4  46.74 
 
 		 369 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0308754  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3552  transposase, IS4  46.74 
 
 		 369 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3654  transposase, IS4  46.74 
 
 		 369 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.258841  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0419  transposase, IS4 family protein  46.47 
 
 		 364 aa  302  5.000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0050  ISMca1, transposase  44.66 
 
 		 366 aa  295  8e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0096  ISMca1, transposase  44.66 
 
 		 366 aa  295  8e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0227  ISMca1, transposase  44.66 
 
 		 366 aa  295  8e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0751226  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0307  ISMca1, transposase  44.66 
 
 		 366 aa  295  8e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0723  ISMca1, transposase  44.66 
 
 		 366 aa  295  8e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.619399  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0980  ISMca1, transposase  44.66 
 
 		 366 aa  295  8e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1090  ISMca1, transposase  44.66 
 
 		 366 aa  295  8e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1177  ISMca1, transposase  44.66 
 
 		 366 aa  295  8e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1197  ISMca1, transposase  44.66 
 
 		 366 aa  295  8e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1312  ISMca1, transposase  44.66 
 
 		 366 aa  295  8e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1514  ISMca1, transposase  44.66 
 
 		 366 aa  295  8e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.332926  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1517  ISMca1, transposase  44.66 
 
 		 366 aa  295  8e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1580  ISMca1, transposase  44.66 
 
 		 366 aa  295  8e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1956  ISMca1, transposase  44.66 
 
 		 366 aa  295  8e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725664  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2178  ISMca1, transposase  44.66 
 
 		 366 aa  295  8e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2511  ISMca1, transposase  44.66 
 
 		 366 aa  295  8e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229212  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2556  ISMca1, transposase  44.66 
 
 		 366 aa  295  8e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.186429  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2687  prophage LambdaMc01, ISMca1, transposase  44.66 
 
 		 366 aa  295  8e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.765288  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2810  ISMca1, transposase  44.66 
 
 		 366 aa  295  8e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2964  ISMca1, transposase  44.66 
 
 		 366 aa  295  8e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>