More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4153 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4885  transposase IS4 family protein  83.56 
 
 		 368 aa  654    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4228  transposase ISRme1  100 
 
 		 366 aa  759    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00917968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4153  transposase ISRme1  100 
 
 		 366 aa  759    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.504697 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5975  IS4 family transposase  90.98 
 
 		 366 aa  682    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.682409  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1171  IS4 family transposase  100 
 
 		 366 aa  759    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.56171 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3353  IS4 family transposase  100 
 
 		 366 aa  759    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3230  transposase IS4 family protein  82.83 
 
 		 367 aa  625  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.431126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00235  putative ISXoo14 transposase  70.64 
 
 		 365 aa  525  1e-148  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02785  putative ISXoo14 transposase  69.85 
 
 		 369 aa  474  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00514  putative ISXoo14 transposase  71.08 
 
 		 333 aa  475  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0342548  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6134  transposase IS4 family protein  61.31 
 
 		 368 aa  448  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.647313  normal  0.885579 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4959  transposase IS4 family protein  61.31 
 
 		 368 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6786  transposase IS4 family protein  60.22 
 
 		 368 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1803  putative transposase  60.7 
 
 		 368 aa  431  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0559  ISGsu2, transposase  54.12 
 
 		 361 aa  385  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360108  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1297  ISGsu2, transposase  54.12 
 
 		 361 aa  385  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274953  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2597  ISGsu2, transposase  54.12 
 
 		 361 aa  385  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2513  transposase IS4 family protein  52.89 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000127835  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0155  transposase IS4 family protein  52.89 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.193829  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0006  transposase IS4 family protein  52.89 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2311  transposase IS4 family protein  52.89 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000514015  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1681  transposase IS4 family protein  52.89 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0330564  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0839  transposase IS4 family protein  52.89 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000787198  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0440  transposase IS4 family protein  52.89 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3116  transposase IS4 family protein  52.89 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000441936  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2694  transposase IS4 family protein  52.89 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00558684  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2726  transposase, IS4  55.26 
 
 		 367 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0495453  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0987  transposase, IS4  55.26 
 
 		 367 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1112  transposase, IS4  55.26 
 
 		 367 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.325371  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3098  transposase, IS4  55.26 
 
 		 367 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3984  transposase, IS4  55.26 
 
 		 367 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3687  transposase, IS4  55.26 
 
 		 367 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3700  transposase, IS4  55.26 
 
 		 367 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2770  transposase, IS4  55.26 
 
 		 367 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3889  transposase, IS4  55.26 
 
 		 367 aa  362  4e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4641  transposase, IS4  81.11 
 
 		 222 aa  362  6e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.395706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1527  transposase, IS4  55.26 
 
 		 367 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.717674  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2594  transposase, IS4  55.26 
 
 		 367 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2279  transposase, IS4  55.26 
 
 		 367 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5960  transposase, IS4 family protein  55.26 
 
 		 367 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0771683 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5505  transposase, IS4 family protein  55.26 
 
 		 367 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.60603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2894  transposase, IS4 family protein  55.26 
 
 		 367 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.457818  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6302  transposase, IS4 family protein  55.26 
 
 		 367 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.801327 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5596  transposase, IS4  55.26 
 
 		 367 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5376  transposase, IS4  56.08 
 
 		 367 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.490407  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3131  transposase, IS4  56.08 
 
 		 367 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347053  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2772  ISGsu3, transposase  49.59 
 
 		 362 aa  342  5e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2168  transposase, IS4  50.95 
 
 		 366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.238923  normal  0.543726 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2105  transposase, IS4  51.22 
 
 		 366 aa  335  5.999999999999999e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1433  transposase, IS4 family protein  47.32 
 
 		 405 aa  335  7e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7153  transposase  49.87 
 
 		 369 aa  332  4e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3911  transposase  49.87 
 
 		 369 aa  332  4e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.664589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6919  transposase  49.87 
 
 		 369 aa  332  4e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.439237 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5660  transposase IS4 family protein  48.91 
 
 		 365 aa  330  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.633118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1266  transposase, IS4  51.45 
 
 		 340 aa  329  4e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0283  transposase IS4  50.41 
 
 		 358 aa  325  1e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1069  transposase IS4  50.41 
 
 		 358 aa  325  1e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0456377 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2091  transposase IS4  50.41 
 
 		 358 aa  325  1e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000396436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2240  transposase IS4  50.41 
 
 		 358 aa  325  1e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000126004 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2488  transposase IS4  50.41 
 
 		 358 aa  325  1e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2883  transposase IS4  50.41 
 
 		 358 aa  325  1e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00446649 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0512  transposase, IS4  47.3 
 
 		 369 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.692808  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0701  transposase, IS4  47.3 
 
 		 369 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1095  transposase, IS4  47.3 
 
 		 369 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1135  transposase, IS4  47.3 
 
 		 369 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.064838  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1473  transposase, IS4  47.3 
 
 		 369 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282239  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1498  transposase, IS4  47.3 
 
 		 369 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1653  transposase, IS4  47.3 
 
 		 369 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.891331  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1821  transposase, IS4  47.3 
 
 		 369 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2160  transposase, IS4  47.3 
 
 		 369 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.591575  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2596  transposase, IS4  47.3 
 
 		 369 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3113  transposase, IS4  47.3 
 
 		 369 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3140  transposase, IS4  47.3 
 
 		 369 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3290  transposase, IS4  47.3 
 
 		 369 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3391  transposase, IS4  47.3 
 
 		 369 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.401653  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3414  transposase, IS4  47.3 
 
 		 369 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3440  transposase, IS4  47.3 
 
 		 369 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0308754  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3552  transposase, IS4  47.3 
 
 		 369 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3654  transposase, IS4  47.3 
 
 		 369 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.258841  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3706  transposase, IS4 family protein  46.8 
 
 		 354 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1230  transposase, IS4 family protein  49.04 
 
 		 362 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2866  transposase, IS4 family protein  49.04 
 
 		 362 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.953499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3703  transposase, IS4 family protein  49.04 
 
 		 362 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.757011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2685  transposase, IS4 family protein  49.04 
 
 		 362 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.235088  normal  0.541519 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0806  transposase, IS4 family protein  49.04 
 
 		 362 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0754  transposase, IS4 family protein  49.04 
 
 		 362 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1519  transposase, IS4 family protein  49.04 
 
 		 362 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1871  transposase, IS4 family protein  49.04 
 
 		 362 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.85058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1431  transposase, IS4 family protein  49.04 
 
 		 362 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.771105 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0576  transposase, IS4 family protein  49.04 
 
 		 362 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.78227  normal  0.0868679 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3331  transposase, IS4 family protein  49.04 
 
 		 362 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  0.0435671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3184  transposase, IS4 family protein  49.04 
 
 		 362 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2122  transposase, IS4 family protein  49.04 
 
 		 362 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.973511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3613  transposase, IS4 family protein  49.04 
 
 		 362 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3918  transposase, IS4 family protein  49.04 
 
 		 362 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3410  transposase, IS4 family protein  49.04 
 
 		 362 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1916  transposase, IS4 family protein  49.04 
 
 		 362 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.176419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0089  transposase, IS4 family protein  49.04 
 
 		 362 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0686  transposase IS4 family protein  48.76 
 
 		 362 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.278758  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0222  transposase IS4 family protein  48.76 
 
 		 362 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>