More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2522 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2522  integrase catalytic subunit  100 
 
 
311 aa  648    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  41.72 
 
 
286 aa  209  4e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  41.67 
 
 
286 aa  209  7e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  41.67 
 
 
286 aa  209  7e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  41.67 
 
 
286 aa  209  7e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  41.67 
 
 
286 aa  209  7e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1465  integrase catalytic subunit  38.87 
 
 
271 aa  182  6e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1964  integrase catalytic subunit  38.87 
 
 
271 aa  182  6e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0173  integrase catalytic subunit  38.87 
 
 
271 aa  182  6e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3924  integrase catalytic subunit  38.87 
 
 
271 aa  182  6e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2945  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  36.95 
 
 
288 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.19707e-26 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4705  integrase catalytic subunit  39.4 
 
 
296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  35.31 
 
 
277 aa  178  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06247  integrase  37.91 
 
 
283 aa  177  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1288  integrase catalytic subunit  37.72 
 
 
271 aa  177  3e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.381698  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0268  Integrase catalytic region  36.18 
 
 
302 aa  176  5e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.154929  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1648  Integrase catalytic region  36.18 
 
 
302 aa  176  5e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3218  Integrase catalytic region  36.18 
 
 
302 aa  176  5e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1666  Integrase catalytic region  36.18 
 
 
302 aa  176  5e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0302  Integrase catalytic region  36.18 
 
 
303 aa  176  5e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2473  Integrase catalytic region  36.18 
 
 
302 aa  176  5e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2606  Integrase catalytic region  36.18 
 
 
302 aa  176  5e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0272  Integrase catalytic region  36.18 
 
 
302 aa  176  5e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.443922  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0279  Integrase catalytic region  36.18 
 
 
302 aa  176  5e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3025  IS3, transposase orfB  35.59 
 
 
288 aa  175  7e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0765  integrase catalytic subunit  38.43 
 
 
271 aa  174  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5314  integrase catalytic subunit  41.78 
 
 
279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.389747 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0575  integrase catalytic subunit  38.56 
 
 
299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0583  integrase catalytic subunit  38.56 
 
 
299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308841  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1384  integrase catalytic region  40.94 
 
 
304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3068  integrase catalytic region  40.94 
 
 
304 aa  172  5.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.559211  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01360  IS3 element protein InsF  35.25 
 
 
288 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01525  putative transposase for IS3  35.25 
 
 
288 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1569  Integrase catalytic region  35.25 
 
 
288 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0876401  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2506  Integrase catalytic region  35.25 
 
 
288 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.239261  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2616  Integrase catalytic region  35.25 
 
 
288 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.170186  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3237  Integrase catalytic region  35.25 
 
 
288 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3304  Integrase catalytic region  35.25 
 
 
288 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.408812  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01035  hypothetical protein  35.25 
 
 
288 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3746  integrase catalytic region  35.25 
 
 
288 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.05522  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2570  integrase catalytic region  35.25 
 
 
288 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0458433 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4704  ISEc16, orfB  35.25 
 
 
288 aa  172  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01520  hypothetical protein  35.25 
 
 
298 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0729  integrase catalytic region  35.25 
 
 
288 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3716  integrase catalytic region  35.25 
 
 
288 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1146  IS3, transposase orfB  35.25 
 
 
288 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01028  putative transposase for IS3  36.56 
 
 
271 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0281  ISMca2, transposase, OrfB  36.08 
 
 
291 aa  171  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0907  ISMca2, transposase, OrfB  36.08 
 
 
291 aa  171  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0687  Integrase catalytic region  37.21 
 
 
292 aa  171  2e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0706  integrase catalytic subunit  38.16 
 
 
285 aa  170  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2400  integrase catalytic subunit  38.16 
 
 
285 aa  170  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2398  integrase catalytic subunit  38.16 
 
 
285 aa  170  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466088  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0708  integrase catalytic subunit  38.16 
 
 
285 aa  170  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4118  integrase catalytic subunit  38.16 
 
 
285 aa  170  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000189778 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3353  integrase catalytic subunit  38.16 
 
 
285 aa  170  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.746992  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3189  integrase catalytic subunit  38.16 
 
 
285 aa  170  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4847  IS3, transposase orfB  34.92 
 
 
288 aa  170  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0514  integrase catalytic subunit  38.16 
 
 
285 aa  170  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0519  integrase catalytic subunit  38.16 
 
 
285 aa  170  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0693  integrase catalytic subunit  38.16 
 
 
285 aa  170  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0702  integrase catalytic subunit  38.16 
 
 
285 aa  170  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02696  putative transposase for IS3  36.46 
 
 
268 aa  170  4e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.367073  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  35.1 
 
 
291 aa  168  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3089  integrase catalytic region  37.29 
 
 
296 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175977  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7355  integrase catalytic region  36.49 
 
 
319 aa  166  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.149793 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0186  hypothetical protein  33 
 
 
294 aa  166  5e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  33 
 
 
294 aa  166  5e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  33 
 
 
294 aa  166  5e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  33 
 
 
294 aa  166  5e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  33 
 
 
294 aa  166  5e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1118  ISEc16, orfB  35.25 
 
 
288 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.433654  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1212  integrase catalytic region  36.97 
 
 
278 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3739  integrase catalytic region  34.32 
 
 
285 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5327  Integrase catalytic region  36.21 
 
 
289 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0628  Integrase catalytic region  36.21 
 
 
289 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5189  Integrase catalytic region  36.21 
 
 
289 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100014  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  32.26 
 
 
270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36460  Integrase, catalytic domain-containing protein  43.96 
 
 
200 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5606  integrase catalytic subunit  37.03 
 
 
299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398983  normal  0.604241 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4830  integrase catalytic subunit  37.46 
 
 
299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.798983 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2154  integrase catalytic subunit  37.46 
 
 
299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  32.26 
 
 
270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5824  integrase catalytic subunit  37.03 
 
 
299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.360076 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1989  integrase catalytic subunit  35.1 
 
 
289 aa  163  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.866629  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1727  integrase  36.04 
 
 
281 aa  163  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0647864 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2905  integrase catalytic region  37.58 
 
 
286 aa  162  6e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  34.77 
 
 
289 aa  162  6e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2168  Integrase catalytic region  36.49 
 
 
280 aa  162  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0614321  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3327  Integrase catalytic region  36.49 
 
 
280 aa  162  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  36.15 
 
 
286 aa  161  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0801  Integrase catalytic region  35.54 
 
 
291 aa  160  3e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3664  Integrase catalytic region  35.25 
 
 
294 aa  160  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11217  normal  0.13781 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  32.26 
 
 
270 aa  159  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  32.26 
 
 
270 aa  159  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  32.26 
 
 
270 aa  159  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  32.26 
 
 
270 aa  159  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  32.26 
 
 
270 aa  159  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1127  integrase catalytic subunit  34.77 
 
 
289 aa  159  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.70947  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0928  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  37.34 
 
 
239 aa  157  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.394905  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>