More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0268 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3218  Integrase catalytic region  100 
 
 
302 aa  617  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0268  Integrase catalytic region  100 
 
 
302 aa  617  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.154929  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1648  Integrase catalytic region  100 
 
 
302 aa  617  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2606  Integrase catalytic region  100 
 
 
302 aa  617  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0272  Integrase catalytic region  100 
 
 
302 aa  617  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.443922  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2473  Integrase catalytic region  100 
 
 
302 aa  617  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1666  Integrase catalytic region  100 
 
 
302 aa  617  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0279  Integrase catalytic region  100 
 
 
302 aa  617  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0302  Integrase catalytic region  100 
 
 
303 aa  602  1.0000000000000001e-171  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0575  integrase catalytic subunit  61.72 
 
 
299 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0583  integrase catalytic subunit  61.72 
 
 
299 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308841  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4830  integrase catalytic subunit  60.62 
 
 
299 aa  363  1e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.798983 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2154  integrase catalytic subunit  60.62 
 
 
299 aa  363  1e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3741  integrase catalytic subunit  63.54 
 
 
277 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5606  integrase catalytic subunit  61.39 
 
 
299 aa  345  5e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398983  normal  0.604241 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5824  integrase catalytic subunit  61.39 
 
 
299 aa  345  5e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.360076 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2000  integrase catalytic subunit  62.38 
 
 
299 aa  336  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2853  integrase catalytic subunit  62.38 
 
 
299 aa  336  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2585  integrase catalytic subunit  62.38 
 
 
299 aa  336  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2246  integrase catalytic subunit  62.38 
 
 
299 aa  336  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0582886  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2228  integrase catalytic subunit  62.38 
 
 
299 aa  336  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.996851  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0559  integrase catalytic subunit  62.38 
 
 
299 aa  336  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1670  integrase catalytic subunit  62.38 
 
 
299 aa  336  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.406666  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1626  integrase catalytic subunit  62.38 
 
 
299 aa  336  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0832257  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3191  integrase catalytic subunit  62.38 
 
 
299 aa  336  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.959465  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0608  integrase catalytic subunit  62.38 
 
 
299 aa  336  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1652  integrase catalytic subunit  62.38 
 
 
299 aa  336  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3253  integrase catalytic subunit  62.38 
 
 
299 aa  336  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0424775  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0576  integrase catalytic subunit  62.05 
 
 
299 aa  332  4e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0802  Integrase catalytic region  60.4 
 
 
299 aa  320  9.999999999999999e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3285  Integrase catalytic region  60.4 
 
 
299 aa  320  9.999999999999999e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4705  integrase catalytic subunit  45.45 
 
 
296 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0687  Integrase catalytic region  41 
 
 
292 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1319  Integrase catalytic region  40.74 
 
 
292 aa  188  8e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.586112  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0979  Integrase catalytic region  40.47 
 
 
292 aa  187  1e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.319185  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1775  Integrase catalytic region  40.47 
 
 
292 aa  187  1e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.565196  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0154  Integrase catalytic region  40.47 
 
 
292 aa  187  1e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0301  Integrase catalytic region  40.47 
 
 
292 aa  187  1e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0519  Integrase catalytic region  40.47 
 
 
292 aa  187  1e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.377839  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1316  Integrase catalytic region  40.47 
 
 
292 aa  187  1e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0550565  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0978  Integrase catalytic region  42.45 
 
 
276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.216632  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3664  Integrase catalytic region  38.98 
 
 
294 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11217  normal  0.13781 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0616  integrase catalytic subunit  46.7 
 
 
232 aa  181  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.243414  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  38.68 
 
 
291 aa  179  4.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1091  integrase catalytic subunit  40.2 
 
 
297 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1692  integrase catalytic subunit  40.2 
 
 
297 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1955  integrase catalytic subunit  40.2 
 
 
297 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3659  integrase catalytic subunit  40.2 
 
 
297 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3720  integrase catalytic subunit  40.2 
 
 
297 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.424054  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3740  integrase catalytic subunit  40.2 
 
 
297 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.553095  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5060  integrase catalytic subunit  40.2 
 
 
297 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690854  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7355  integrase catalytic region  40.43 
 
 
319 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.149793 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0801  Integrase catalytic region  39.86 
 
 
291 aa  177  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1727  integrase  38.99 
 
 
281 aa  177  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0647864 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  38.99 
 
 
277 aa  176  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3739  integrase catalytic region  36.55 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2522  integrase catalytic subunit  35.56 
 
 
311 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0765  integrase catalytic subunit  39.64 
 
 
271 aa  171  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  38.1 
 
 
289 aa  169  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3089  integrase catalytic region  39.93 
 
 
296 aa  169  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175977  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0514  integrase catalytic subunit  41.4 
 
 
285 aa  169  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0519  integrase catalytic subunit  41.4 
 
 
285 aa  169  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0693  integrase catalytic subunit  41.4 
 
 
285 aa  169  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0702  integrase catalytic subunit  41.4 
 
 
285 aa  169  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0706  integrase catalytic subunit  41.4 
 
 
285 aa  169  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0708  integrase catalytic subunit  41.4 
 
 
285 aa  169  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2398  integrase catalytic subunit  41.4 
 
 
285 aa  169  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466088  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2400  integrase catalytic subunit  41.4 
 
 
285 aa  169  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3189  integrase catalytic subunit  41.4 
 
 
285 aa  169  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3353  integrase catalytic subunit  41.4 
 
 
285 aa  169  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.746992  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4118  integrase catalytic subunit  41.4 
 
 
285 aa  169  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000189778 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  38.05 
 
 
286 aa  169  6e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  38.05 
 
 
286 aa  169  6e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  38.05 
 
 
286 aa  169  6e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  38.05 
 
 
286 aa  169  6e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  37.41 
 
 
286 aa  168  8e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  39.93 
 
 
286 aa  168  9e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  39.93 
 
 
286 aa  168  9e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  39.93 
 
 
286 aa  168  9e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  39.93 
 
 
286 aa  168  9e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  39.93 
 
 
286 aa  168  9e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  38.01 
 
 
286 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  36.08 
 
 
286 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  36.08 
 
 
286 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1989  integrase catalytic subunit  37.76 
 
 
289 aa  166  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.866629  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1288  integrase catalytic subunit  38.91 
 
 
271 aa  166  5e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.381698  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0186  hypothetical protein  32.68 
 
 
294 aa  163  3e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  32.68 
 
 
294 aa  163  3e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  32.68 
 
 
294 aa  163  3e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  32.68 
 
 
294 aa  163  3e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  32.68 
 
 
294 aa  163  3e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1846  putative transposase  35 
 
 
296 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796912  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2087  putative IS3 family transposase orfB  35 
 
 
296 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360317  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2544  IS3 family transposase orfB  35 
 
 
296 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765664  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2735  putative IS3 transposase integrase  35 
 
 
296 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0386866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3565  putative transposase  35 
 
 
296 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0131  putative transposase  35 
 
 
296 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0634  putative transposase  35 
 
 
296 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214662  normal  0.0414488 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3068  integrase catalytic region  38.95 
 
 
304 aa  163  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.559211  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  35.74 
 
 
286 aa  162  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>