More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0302 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0302  Integrase catalytic region  100 
 
 		 303 aa  619  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0268  Integrase catalytic region  100 
 
 		 302 aa  602  1.0000000000000001e-171  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.154929  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0272  Integrase catalytic region  100 
 
 		 302 aa  602  1.0000000000000001e-171  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.443922  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0279  Integrase catalytic region  100 
 
 		 302 aa  602  1.0000000000000001e-171  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1648  Integrase catalytic region  100 
 
 		 302 aa  602  1.0000000000000001e-171  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1666  Integrase catalytic region  100 
 
 		 302 aa  602  1.0000000000000001e-171  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2473  Integrase catalytic region  100 
 
 		 302 aa  602  1.0000000000000001e-171  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2606  Integrase catalytic region  100 
 
 		 302 aa  602  1.0000000000000001e-171  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3218  Integrase catalytic region  100 
 
 		 302 aa  602  1.0000000000000001e-171  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0575  integrase catalytic subunit  61.95 
 
 		 299 aa  367  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0583  integrase catalytic subunit  61.95 
 
 		 299 aa  367  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4830  integrase catalytic subunit  60.62 
 
 		 299 aa  363  2e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.798983 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2154  integrase catalytic subunit  60.62 
 
 		 299 aa  363  2e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3741  integrase catalytic subunit  63.54 
 
 		 277 aa  352  4e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5606  integrase catalytic subunit  61.28 
 
 		 299 aa  345  7e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398983  normal  0.604241 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5824  integrase catalytic subunit  61.28 
 
 		 299 aa  345  7e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.360076 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2000  integrase catalytic subunit  62.63 
 
 		 299 aa  336  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2246  integrase catalytic subunit  62.63 
 
 		 299 aa  336  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0582886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1670  integrase catalytic subunit  62.63 
 
 		 299 aa  336  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.406666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2853  integrase catalytic subunit  62.63 
 
 		 299 aa  336  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2585  integrase catalytic subunit  62.63 
 
 		 299 aa  336  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2228  integrase catalytic subunit  62.63 
 
 		 299 aa  336  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.996851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0608  integrase catalytic subunit  62.63 
 
 		 299 aa  336  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1626  integrase catalytic subunit  62.63 
 
 		 299 aa  336  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0832257  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3191  integrase catalytic subunit  62.63 
 
 		 299 aa  336  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.959465  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0559  integrase catalytic subunit  62.63 
 
 		 299 aa  336  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1652  integrase catalytic subunit  62.63 
 
 		 299 aa  336  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3253  integrase catalytic subunit  62.63 
 
 		 299 aa  336  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0424775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0576  integrase catalytic subunit  62.29 
 
 		 299 aa  333  3e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0802  Integrase catalytic region  60.27 
 
 		 299 aa  318  1e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3285  Integrase catalytic region  60.27 
 
 		 299 aa  318  1e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4705  integrase catalytic subunit  44.52 
 
 		 296 aa  212  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0687  Integrase catalytic region  40.86 
 
 		 292 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1319  Integrase catalytic region  40.6 
 
 		 292 aa  188  8e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.586112  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1316  Integrase catalytic region  40.47 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0550565  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1775  Integrase catalytic region  40.47 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.565196  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0154  Integrase catalytic region  40.47 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0301  Integrase catalytic region  40.47 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0979  Integrase catalytic region  40.47 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.319185  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0519  Integrase catalytic region  40.47 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.377839  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0978  Integrase catalytic region  42.45 
 
 		 276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.216632  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0616  integrase catalytic subunit  46.7 
 
 		 232 aa  180  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.243414  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3664  Integrase catalytic region  38.78 
 
 		 294 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11217  normal  0.13781 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  38.68 
 
 		 291 aa  179  4.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1727  integrase  38.6 
 
 		 281 aa  179  4.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0647864 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1091  integrase catalytic subunit  40.13 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1692  integrase catalytic subunit  40.13 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1955  integrase catalytic subunit  40.13 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3659  integrase catalytic subunit  40.13 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3720  integrase catalytic subunit  40.13 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.424054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3740  integrase catalytic subunit  40.13 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.553095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5060  integrase catalytic subunit  40.13 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7355  integrase catalytic region  40.43 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.149793 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  38.99 
 
 		 277 aa  176  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0801  Integrase catalytic region  40.21 
 
 		 291 aa  174  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3739  integrase catalytic region  36.55 
 
 		 285 aa  174  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2522  integrase catalytic subunit  36.18 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  37.46 
 
 		 286 aa  170  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0765  integrase catalytic subunit  39.64 
 
 		 271 aa  171  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  37.92 
 
 		 289 aa  170  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  39.93 
 
 		 286 aa  168  9e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  39.93 
 
 		 286 aa  168  9e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  39.93 
 
 		 286 aa  168  9e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  39.93 
 
 		 286 aa  168  9e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  39.93 
 
 		 286 aa  168  9e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3089  integrase catalytic region  40 
 
 		 296 aa  168  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0514  integrase catalytic subunit  41.82 
 
 		 285 aa  168  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0519  integrase catalytic subunit  41.82 
 
 		 285 aa  168  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0693  integrase catalytic subunit  41.82 
 
 		 285 aa  168  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0702  integrase catalytic subunit  41.82 
 
 		 285 aa  168  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0706  integrase catalytic subunit  41.82 
 
 		 285 aa  168  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0708  integrase catalytic subunit  41.82 
 
 		 285 aa  168  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2398  integrase catalytic subunit  41.82 
 
 		 285 aa  168  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2400  integrase catalytic subunit  41.82 
 
 		 285 aa  168  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3189  integrase catalytic subunit  41.82 
 
 		 285 aa  168  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3353  integrase catalytic subunit  41.82 
 
 		 285 aa  168  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.746992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4118  integrase catalytic subunit  41.82 
 
 		 285 aa  168  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000189778 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  38.01 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  38.01 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  38.01 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  38.01 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  38.01 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1989  integrase catalytic subunit  37.58 
 
 		 289 aa  167  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.866629  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  36.08 
 
 		 286 aa  166  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  36.08 
 
 		 286 aa  166  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1288  integrase catalytic subunit  38.91 
 
 		 271 aa  166  4e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.381698  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3068  integrase catalytic region  38.95 
 
 		 304 aa  163  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.559211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1127  integrase catalytic subunit  37.25 
 
 		 289 aa  163  4.0000000000000004e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.70947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  35.74 
 
 		 286 aa  162  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  35.74 
 
 		 286 aa  162  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3769  putative transposase  34.33 
 
 		 296 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  35.74 
 
 		 286 aa  162  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  35.74 
 
 		 286 aa  162  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  35.74 
 
 		 286 aa  162  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  35.74 
 
 		 286 aa  162  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5189  Integrase catalytic region  35.96 
 
 		 289 aa  162  6e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0628  Integrase catalytic region  35.96 
 
 		 289 aa  162  6e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  35.74 
 
 		 286 aa  162  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  35.74 
 
 		 286 aa  162  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  35.74 
 
 		 286 aa  162  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>